MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor owensensis OL chromosome

Total Repeats: 413

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014657	ATATA	2	10	10143	10152	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014657	AAATT	2	10	15408	15417	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014657	TAACT	2	10	21965	21974	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014657	GAAAA	2	10	47081	47090	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014657	AAACA	2	10	55671	55680	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014657	TTTGT	2	10	56183	56192	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014657	ATTTT	2	10	56335	56344	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014657	ACATT	2	10	57249	57258	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014657	AGGAG	2	10	57840	57849	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014657	CTTTG	2	10	62046	62055	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014657	TTATA	2	10	67140	67149	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014657	AATTT	2	10	68570	68579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014657	CTTTT	2	10	73869	73878	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014657	TTTGT	2	10	76731	76740	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014657	GTAAT	2	10	77063	77072	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014657	AGAAC	2	10	77670	77679	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014657	ATTGC	2	10	77784	77793	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014657	GGAAG	2	10	85453	85462	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014657	GGCTT	2	10	91183	91192	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014657	ATCCA	2	10	91511	91520	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_014657	GTTTT	2	10	93636	93645	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014657	CTGGG	2	10	94352	94361	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014657	GAAAA	2	10	95498	95507	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014657	GTTAT	2	10	95571	95580	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014657	ATTTT	2	10	96447	96456	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014657	TAGCT	2	10	96506	96515	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014657	AAGAA	2	10	112829	112838	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014657	TAAAA	2	10	122551	122560	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014657	AATAA	2	10	124099	124108	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014657	GGATT	2	10	133422	133431	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014657	AAATA	2	10	137375	137384	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014657	GGTTA	2	10	141213	141222	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014657	TAAAA	2	10	166114	166123	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014657	AAAAT	2	10	171678	171687	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014657	AGAAA	2	10	176530	176539	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014657	AATTA	2	10	184456	184465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014657	CTTTT	2	10	195709	195718	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014657	GCAGA	2	10	200138	200147	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014657	GTTTT	2	10	203006	203015	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014657	TATAT	2	10	219811	219820	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014657	ATAAA	2	10	219855	219864	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014657	GTATG	2	10	222706	222715	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014657	TAAGA	2	10	223329	223338	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014657	CAAAA	2	10	234187	234196	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014657	GATTA	2	10	234851	234860	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014657	AATTT	2	10	239785	239794	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014657	TAAAA	2	10	246100	246109	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014657	TTTTA	2	10	250677	250686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014657	ATATA	2	10	253539	253548	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014657	AAAGG	2	10	254909	254918	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014657	TAAAA	2	10	266970	266979	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014657	TAAAA	2	10	269104	269113	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014657	GAACG	2	10	280475	280484	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014657	TTCAG	2	10	281030	281039	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014657	AGTGA	2	10	282003	282012	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014657	TTATA	2	10	282203	282212	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014657	TATAA	2	10	295233	295242	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014657	TCGTG	2	10	301396	301405	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014657	TAGGT	2	10	301883	301892	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014657	GGGAG	2	10	302694	302703	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014657	AGGGG	2	10	304060	304069	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014657	CCGAA	2	10	304079	304088	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_014657	ATTTT	2	10	307679	307688	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014657	AGTAG	2	10	307896	307905	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014657	AAGGA	2	10	316472	316481	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014657	AATTG	2	10	346616	346625	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014657	TATAT	2	10	346631	346640	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014657	TGTTT	2	10	349567	349576	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014657	TCATC	2	10	351467	351476	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_014657	AGAAA	2	10	353009	353018	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014657	AGAAA	2	10	360970	360979	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014657	TTAAT	2	10	361111	361120	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014657	AATAA	2	10	363501	363510	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014657	TAGTA	2	10	363538	363547	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014657	AATTT	2	10	365642	365651	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014657	CTATC	2	10	365814	365823	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_014657	TAAAA	2	10	365859	365868	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014657	ATAAC	2	10	367106	367115	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014657	ATAAA	2	10	370333	370342	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014657	TTTAC	2	10	370435	370444	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014657	TTCAA	2	10	370531	370540	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014657	TAATT	2	10	370651	370660	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014657	AAAAG	2	10	376789	376798	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014657	AATAA	2	10	386027	386036	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014657	TACTT	2	10	388087	388096	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014657	TCTTT	2	10	388842	388851	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014657	TTTTA	2	10	390302	390311	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014657	CAAAA	2	10	391865	391874	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014657	AAGAG	2	10	391896	391905	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014657	ATGAT	2	10	395636	395645	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014657	AGTAA	2	10	398843	398852	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014657	AAGAA	2	10	399603	399612	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014657	ATATA	2	10	400072	400081	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014657	TTTAA	2	10	403797	403806	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014657	GACAA	2	10	403842	403851	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014657	AAAAT	2	10	408809	408818	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014657	AATTG	2	10	409239	409248	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014657	TATAT	2	10	412053	412062	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014657	AGGAG	2	10	429281	429290	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014657	AATAT	2	10	433456	433465	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014657	ACAGA	2	10	436258	436267	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014657	AAGTA	2	10	436306	436315	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014657	TATAA	2	10	438714	438723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014657	AATAT	2	10	445603	445612	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014657	ATTAT	2	10	450510	450519	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014657	AAGAA	2	10	454407	454416	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014657	TTAAA	2	10	454452	454461	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014657	AAATA	2	10	456634	456643	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014657	AAACT	2	10	464723	464732	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014657	AATAT	2	10	465641	465650	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014657	ACTTT	2	10	467865	467874	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014657	AGTAT	2	10	482413	482422	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014657	GGTGG	2	10	485437	485446	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014657	CCCCG	2	10	494414	494423	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
115	NC_014657	CTTTT	2	10	497677	497686	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014657	ATAAA	2	10	531166	531175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014657	TTATA	2	10	537789	537798	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014657	TCATC	2	10	541121	541130	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_014657	TAAAT	2	10	549524	549533	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014657	CAAAC	2	10	550552	550561	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_014657	TCATC	2	10	553785	553794	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_014657	AATTA	2	10	558231	558240	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014657	AACAA	2	10	570611	570620	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014657	AAGGA	2	10	577479	577488	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014657	ATTGT	2	10	580388	580397	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014657	AAAGA	2	10	586832	586841	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014657	ATATA	2	10	587942	587951	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014657	ATAGA	2	10	608369	608378	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014657	ATAAG	2	10	610592	610601	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014657	ATATT	2	10	626879	626888	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014657	GAGAA	2	10	629270	629279	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014657	GACAA	2	10	629283	629292	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014657	TTTTG	2	10	630342	630351	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014657	TTTTA	2	10	630615	630624	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014657	AAGTA	2	10	640131	640140	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014657	AATTA	2	10	657326	657335	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014657	TTGTC	2	10	659061	659070	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014657	AAAGA	2	10	660625	660634	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014657	GAAAA	2	10	660737	660746	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014657	GTTTT	2	10	662649	662658	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014657	AAATT	2	10	670145	670154	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014657	TTAGT	2	10	673239	673248	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014657	TGACA	2	10	673600	673609	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014657	TAAAA	2	10	682816	682825	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014657	TAAGC	2	10	683072	683081	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014657	TTGTT	2	10	683093	683102	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014657	TATGG	2	10	683253	683262	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014657	TAGAA	2	10	696954	696963	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.