MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor owensensis OL chromosome

Total Repeats: 4236

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014657	GTT	2	6	43	48	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014657	TTA	2	6	1604	1609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014657	ATT	3	9	1624	1632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014657	TAC	2	6	1635	1640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014657	AAG	2	6	1642	1647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014657	TGG	2	6	1654	1659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014657	GGA	2	6	1688	1693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014657	GTG	2	6	9165	9170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014657	GTT	2	6	9205	9210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014657	TTA	2	6	10131	10136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014657	TAT	2	6	10137	10142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014657	ATG	2	6	11278	11283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014657	TAA	2	6	11328	11333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014657	TTC	2	6	13380	13385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014657	AGA	2	6	13472	13477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014657	TAA	2	6	13586	13591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014657	AAG	2	6	13612	13617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014657	ATT	2	6	14203	14208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014657	TTG	2	6	14228	14233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014657	ACA	2	6	15361	15366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014657	TAA	2	6	15456	15461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014657	CCT	2	6	16196	16201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_014657	AGT	2	6	17817	17822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014657	AAT	2	6	17907	17912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014657	GAA	2	6	18004	18009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014657	CAT	2	6	19636	19641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014657	TTC	2	6	19740	19745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014657	TAA	2	6	20451	20456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014657	ATA	2	6	20518	20523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014657	TGA	3	9	21934	21942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014657	ATA	2	6	21993	21998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014657	TAA	2	6	25761	25766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014657	TTC	2	6	26466	26471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014657	CAA	2	6	26494	26499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014657	ATT	2	6	26570	26575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014657	AGG	2	6	26592	26597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014657	GGA	2	6	29510	29515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014657	TTA	3	9	30603	30611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014657	GAA	2	6	35292	35297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014657	GAT	2	6	35326	35331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014657	TAA	2	6	37520	37525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014657	TAA	2	6	37548	37553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014657	TGC	2	6	37558	37563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014657	GCA	2	6	37582	37587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014657	ATT	2	6	38574	38579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014657	CCT	2	6	38638	38643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_014657	CAA	2	6	39192	39197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014657	AAT	2	6	46409	46414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014657	TAT	2	6	46920	46925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014657	AGC	2	6	46969	46974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014657	ACT	2	6	46997	47002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014657	GGA	2	6	47093	47098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014657	GAT	2	6	49598	49603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014657	TGA	2	6	49617	49622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014657	TAA	2	6	52400	52405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014657	AGA	2	6	52420	52425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014657	TAA	2	6	52432	52437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014657	TGA	2	6	52522	52527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014657	TGA	2	6	53375	53380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014657	CAA	2	6	53401	53406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014657	CAA	2	6	54780	54785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014657	AAT	2	6	54811	54816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014657	GTT	2	6	54835	54840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014657	ATT	2	6	54884	54889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014657	AAT	2	6	55044	55049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014657	CTT	2	6	55095	55100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014657	CCG	2	6	55171	55176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_014657	CTA	2	6	55287	55292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014657	ACC	2	6	55323	55328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_014657	TTC	3	9	55528	55536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014657	TTC	2	6	55606	55611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014657	TAT	2	6	55684	55689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014657	TTC	2	6	55706	55711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014657	TTA	2	6	55755	55760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014657	TAA	2	6	55809	55814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014657	TCC	2	6	55830	55835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_014657	TCT	2	6	55854	55859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014657	AGG	2	6	55880	55885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014657	CAA	2	6	55938	55943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014657	TAA	2	6	56056	56061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014657	CTT	2	6	56073	56078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014657	ATT	2	6	56083	56088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014657	AGG	2	6	56103	56108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014657	TAA	2	6	56165	56170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014657	GCG	2	6	56200	56205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014657	CAG	2	6	56277	56282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014657	AAG	2	6	56510	56515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014657	TTA	2	6	56542	56547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014657	TGA	2	6	56580	56585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014657	TAA	2	6	56652	56657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014657	ATT	2	6	56746	56751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014657	TTC	2	6	56786	56791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014657	TAG	2	6	56807	56812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014657	TGC	2	6	56889	56894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014657	ATT	2	6	56908	56913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014657	TGG	2	6	57141	57146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014657	AGA	2	6	57171	57176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014657	ATT	2	6	57192	57197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014657	AAG	2	6	57236	57241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014657	ATA	2	6	57242	57247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014657	GCA	2	6	57268	57273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014657	CAT	2	6	57284	57289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014657	ATG	2	6	57356	57361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014657	TCT	2	6	57397	57402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014657	TCA	2	6	57442	57447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014657	GAT	2	6	57459	57464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014657	TTA	2	6	57516	57521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014657	ATA	2	6	57542	57547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014657	GAA	2	6	57595	57600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014657	GAA	2	6	57619	57624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014657	GCT	2	6	57661	57666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014657	GAA	2	6	57679	57684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014657	TGG	2	6	57759	57764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014657	TAG	2	6	57818	57823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014657	CAA	2	6	57884	57889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014657	TGT	2	6	57971	57976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014657	TCA	3	9	61858	61866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014657	TGT	2	6	61932	61937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014657	TCC	2	6	62071	62076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_014657	ATC	2	6	63189	63194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014657	TAT	2	6	66386	66391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014657	TTG	2	6	66459	66464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014657	TCT	2	6	66540	66545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014657	TTG	2	6	66679	66684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014657	ATT	2	6	66728	66733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014657	TAA	3	9	66782	66790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014657	TTG	2	6	66857	66862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014657	ATC	2	6	67079	67084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014657	ATT	2	6	67199	67204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014657	TAA	2	6	67343	67348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014657	CCA	2	6	67351	67356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_014657	ATA	2	6	67384	67389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014657	TGT	2	6	67392	67397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014657	AAG	2	6	67431	67436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014657	GGT	2	6	68592	68597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014657	AAG	2	6	71334	71339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014657	CCA	2	6	71389	71394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_014657	CTT	2	6	73760	73765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014657	TAT	2	6	73767	73772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_014657	TTC	2	6	73967	73972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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