MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 8567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014652	AAT	2	6	189788	189793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_014652	CCG	2	6	189804	189809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_014652	GGTTG	2	10	189844	189853	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
504	NC_014652	TTTG	2	8	189935	189942	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014652	CAG	2	6	190030	190035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_014652	CTT	2	6	190045	190050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_014652	TCA	2	6	190056	190061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_014652	AGA	3	9	190110	190118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_014652	AAGT	2	8	190167	190174	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
510	NC_014652	ACA	2	6	190194	190199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_014652	CTTC	2	8	190215	190222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
512	NC_014652	CAT	2	6	190253	190258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_014652	GA	3	6	190261	190266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_014652	AT	4	8	190296	190303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_014652	TTG	2	6	190307	190312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_014652	AATA	2	8	190338	190345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014652	AT	3	6	190347	190352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014652	TCC	2	6	190362	190367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_014652	AGA	2	6	190389	190394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_014652	AGG	2	6	190412	190417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014652	TA	3	6	191375	191380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014652	ATT	2	6	191398	191403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014652	CAA	2	6	191408	191413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_014652	AT	3	6	191422	191427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014652	ACA	2	6	191458	191463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_014652	TTG	2	6	191484	191489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_014652	GGGAT	2	10	191557	191566	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
528	NC_014652	AAT	2	6	191625	191630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_014652	ATT	2	6	191646	191651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014652	CTT	2	6	191800	191805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_014652	TA	3	6	191902	191907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014652	ATT	2	6	191909	191914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_014652	A	6	6	191950	191955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014652	TTC	2	6	194945	194950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_014652	CTC	2	6	196782	196787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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537	NC_014652	A	7	7	196867	196873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_014652	TGTA	2	8	196940	196947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014652	CTTT	2	8	198566	198573	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
540	NC_014652	TAA	2	6	198586	198591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014652	TAC	2	6	198595	198600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_014652	A	6	6	198609	198614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_014652	CTT	2	6	201336	201341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_014652	TAT	2	6	201383	201388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014652	A	6	6	201419	201424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_014652	T	6	6	201581	201586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_014652	TATT	2	8	201605	201612	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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550	NC_014652	T	6	6	202120	202125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_014652	A	6	6	202146	202151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_014652	TAT	2	6	202164	202169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014652	TGC	2	6	202186	202191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_014652	TGT	2	6	202228	202233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_014652	T	6	6	202233	202238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_014652	T	7	7	202256	202262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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558	NC_014652	AAT	2	6	202285	202290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_014652	TA	3	6	202299	202304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_014652	AGG	2	6	202308	202313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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562	NC_014652	A	7	7	208073	208079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_014652	GCT	2	6	209703	209708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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565	NC_014652	TAT	2	6	209743	209748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_014652	TA	3	6	209788	209793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_014652	ATA	2	6	209800	209805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_014652	AAG	2	6	209810	209815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_014652	GGA	2	6	209834	209839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014652	ATT	2	6	209890	209895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014652	TAT	2	6	209923	209928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_014652	ACT	2	6	209973	209978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_014652	AAAAT	2	10	210015	210024	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_014652	AAT	2	6	210034	210039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_014652	ATA	2	6	210111	210116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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580	NC_014652	A	6	6	210220	210225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_014652	TAGT	2	8	210231	210238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014652	T	6	6	210245	210250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_014652	TAT	2	6	210266	210271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_014652	AT	3	6	210274	210279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_014652	CTA	2	6	210331	210336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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589	NC_014652	TATT	2	8	210398	210405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_014652	TTG	2	6	210448	210453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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593	NC_014652	TTA	2	6	210524	210529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_014652	CAG	2	6	210680	210685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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601	NC_014652	TTTAT	2	10	210709	210718	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_014652	TTA	2	6	210800	210805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_014652	TA	3	6	210804	210809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_014652	A	6	6	210822	210827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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606	NC_014652	TAA	2	6	210944	210949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014652	A	6	6	210999	211004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_014652	TA	3	6	211009	211014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014652	CAT	2	6	211048	211053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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612	NC_014652	TTGAAG	2	12	211112	211123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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614	NC_014652	TACC	2	8	211221	211228	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
615	NC_014652	A	7	7	211242	211248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_014652	TAT	2	6	211257	211262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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618	NC_014652	AAT	2	6	211279	211284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014652	AG	4	8	211314	211321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014652	A	6	6	211324	211329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_014652	AGAA	2	8	211335	211342	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
622	NC_014652	ATA	2	6	211385	211390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014652	AAG	2	6	211415	211420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_014652	TAAAAT	2	12	211433	211444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_014652	AT	3	6	211465	211470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_014652	AT	3	6	211513	211518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_014652	AATAGA	2	12	211524	211535	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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629	NC_014652	ATT	2	6	211650	211655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_014652	TTAT	2	8	211688	211695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_014652	A	6	6	211705	211710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_014652	GAT	2	6	211711	211716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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634	NC_014652	ATT	2	6	211734	211739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_014652	GAT	2	6	211765	211770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014652	GC	3	6	211825	211830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
637	NC_014652	AAAT	2	8	211848	211855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_014652	TAA	2	6	211880	211885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_014652	TGA	2	6	211893	211898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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641	NC_014652	CAC	2	6	211955	211960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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923	NC_014652	GTA	2	6	288548	288553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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925	NC_014652	CTA	2	6	288580	288585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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934	NC_014652	GTT	2	6	290143	290148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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942	NC_014652	ATTCT	2	10	290324	290333	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
943	NC_014652	ATT	2	6	290345	290350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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956	NC_014652	GTA	2	6	294835	294840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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962	NC_014652	GAT	2	6	299197	299202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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966	NC_014652	AGT	2	6	299340	299345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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972	NC_014652	AGAAA	2	10	299499	299508	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
973	NC_014652	GGT	2	6	299543	299548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
974	NC_014652	CTT	2	6	299553	299558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
975	NC_014652	TAT	3	9	299586	299594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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978	NC_014652	A	6	6	299714	299719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
979	NC_014652	TTGA	2	8	299816	299823	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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986	NC_014652	GAA	2	6	300112	300117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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