MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782202

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014534	TCACG	2	10	595	604	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_014534	ACCGC	2	10	2132	2141	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_014534	ATCCG	2	10	2286	2295	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_014534	AATCA	2	10	9105	9114	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014534	CTTCC	2	10	9911	9920	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_014534	GTGTC	2	10	23645	23654	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014534	TCTTT	2	10	32740	32749	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014534	TAGAA	2	10	33014	33023	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014534	AATTA	2	10	33134	33143	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014534	ATTTA	2	10	33587	33596	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014534	AGATT	2	10	63123	63132	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014534	TTAGT	2	10	66237	66246	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014534	GAAAA	2	10	111905	111914	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014534	CGGGG	2	10	125423	125432	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014534	AAAGG	2	10	125450	125459	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014534	CTTTT	2	10	126743	126752	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014534	TTCGC	2	10	144518	144527	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_014534	TAGCC	2	10	144712	144721	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_014534	CAATT	2	10	146925	146934	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014534	TGACA	2	10	150893	150902	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014534	AAGTC	2	10	152478	152487	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014534	GACTT	2	10	155644	155653	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014534	TCGGT	2	10	156106	156115	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014534	TTGAT	2	10	164393	164402	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014534	GTTAA	2	10	166192	166201	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014534	TGCCC	2	10	168803	168812	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_014534	GTTTG	2	10	169892	169901	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014534	AACAA	2	10	171295	171304	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014534	TTAAG	2	10	180133	180142	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014534	AATTT	2	10	190261	190270	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014534	GACAG	2	10	212161	212170	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014534	TCTCT	2	10	217642	217651	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_014534	CAAAG	2	10	217722	217731	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014534	GGGTT	2	10	225013	225022	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014534	AGACA	2	10	242505	242514	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014534	AAGTT	2	10	267433	267442	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014534	CGATC	2	10	270194	270203	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_014534	TAAAA	2	10	270220	270229	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014534	GTGTA	2	10	287844	287853	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014534	CATTG	2	10	287877	287886	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014534	AGCGA	2	10	287937	287946	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014534	AGAGA	2	10	290242	290251	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014534	AAAAT	2	10	293212	293221	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014534	TGGCG	2	10	293300	293309	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014534	CTTGG	2	10	294086	294095	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014534	AGCAG	2	10	295231	295240	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014534	GTTTT	2	10	306323	306332	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014534	TTTGA	2	10	310542	310551	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014534	AGGGT	2	10	310855	310864	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014534	GATCA	2	10	315169	315178	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014534	AATAC	2	10	328589	328598	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014534	CAGTC	2	10	334750	334759	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_014534	TACAT	2	10	335495	335504	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014534	TATTC	2	10	356189	356198	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014534	CAAAC	2	10	358158	358167	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_014534	AAGAT	2	10	358747	358756	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014534	AATCG	2	10	367643	367652	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014534	TAGGT	2	10	369286	369295	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014534	ATCAG	2	10	378341	378350	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014534	CTTCC	2	10	382486	382495	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
61	NC_014534	TCACA	2	10	387326	387335	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_014534	TCCTC	2	10	394057	394066	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_014534	GACTG	2	10	394364	394373	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014534	TCTCT	2	10	401321	401330	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_014534	GCTTG	2	10	401658	401667	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014534	ATTAA	2	10	403929	403938	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014534	CTTGA	2	10	406285	406294	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014534	GCTTG	2	10	406386	406395	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014534	AATCC	2	10	409672	409681	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_014534	AAATT	2	10	414851	414860	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014534	GATAT	2	10	425690	425699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014534	AAAAT	2	10	426235	426244	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014534	AACTG	2	10	428455	428464	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014534	CAAAC	2	10	431034	431043	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_014534	AAGAT	2	10	431623	431632	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014534	TTTCC	2	10	432774	432783	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_014534	CCTAA	2	10	434447	434456	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_014534	AGAAA	2	10	435688	435697	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014534	TAAAA	2	10	442738	442747	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014534	AGATT	2	10	444096	444105	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014534	ATTTC	2	10	447040	447049	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014534	CCTCG	2	10	452387	452396	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_014534	AGTTT	2	10	458493	458502	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014534	TCTCC	2	10	460665	460674	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
85	NC_014534	GCTTG	2	10	463600	463609	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014534	AAGAG	2	10	465124	465133	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014534	GAATC	2	10	471184	471193	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014534	TAATC	2	10	473701	473710	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.