MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782202

Total Repeats: 2646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014534	T	6	6	452727	452732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_014534	AT	3	6	452745	452750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_014534	ATTA	2	8	452758	452765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_014534	ATT	2	6	452772	452777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_014534	AT	3	6	452802	452807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_014534	AAAT	2	8	452860	452867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_014534	AG	4	8	453099	453106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_014534	AAT	2	6	453114	453119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_014534	CT	3	6	453124	453129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2510	NC_014534	CTAT	2	8	453141	453148	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2511	NC_014534	GGA	2	6	453640	453645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_014534	ATT	2	6	453692	453697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_014534	AAG	2	6	454781	454786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_014534	CTT	2	6	454807	454812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_014534	T	6	6	454816	454821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_014534	TTTC	2	8	454836	454843	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2517	NC_014534	A	6	6	455022	455027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_014534	ATT	2	6	455762	455767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_014534	TAG	2	6	456662	456667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_014534	GTT	2	6	456685	456690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_014534	TGA	2	6	456700	456705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_014534	AGT	2	6	456729	456734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_014534	GAT	2	6	456752	456757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_014534	GAAAAA	2	12	456773	456784	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_014534	CCA	3	9	456801	456809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2526	NC_014534	TAA	2	6	456842	456847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_014534	T	6	6	457628	457633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2530	NC_014534	AATG	2	8	458354	458361	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_014534	CT	3	6	458365	458370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2532	NC_014534	CAAA	2	8	458371	458378	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2533	NC_014534	AG	3	6	458477	458482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_014534	AGTTT	2	10	458493	458502	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_014534	A	6	6	458514	458519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_014534	GAA	2	6	458522	458527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_014534	TTAG	2	8	458541	458548	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_014534	CTAA	2	8	458562	458569	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2539	NC_014534	T	6	6	458577	458582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_014534	ATT	2	6	458611	458616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_014534	T	8	8	458645	458652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_014534	TCT	2	6	460043	460048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_014534	GAAT	2	8	460144	460151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_014534	TCTCC	2	10	460665	460674	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2545	NC_014534	TAA	2	6	460677	460682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_014534	A	6	6	461081	461086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_014534	A	6	6	461131	461136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_014534	TAA	2	6	461718	461723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_014534	A	6	6	461722	461727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_014534	AGG	2	6	461788	461793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_014534	CTAT	2	8	462010	462017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2552	NC_014534	TTC	2	6	462066	462071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_014534	TAATCT	2	12	462101	462112	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2554	NC_014534	A	6	6	462130	462135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_014534	T	6	6	462155	462160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_014534	TAA	2	6	462162	462167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_014534	CTT	2	6	462178	462183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_014534	TAT	3	9	462836	462844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_014534	TTA	2	6	462902	462907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_014534	TGC	2	6	462909	462914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_014534	ACT	2	6	462949	462954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_014534	AATA	2	8	463004	463011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_014534	T	6	6	463022	463027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_014534	AAT	2	6	463475	463480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_014534	CAT	2	6	463487	463492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_014534	GCTTG	2	10	463600	463609	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2567	NC_014534	CCG	2	6	463639	463644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2569	NC_014534	ATC	2	6	463680	463685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_014534	GTA	2	6	463934	463939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_014534	TGA	2	6	463959	463964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_014534	TCAG	2	8	463966	463973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2573	NC_014534	ATG	2	6	464001	464006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_014534	ATA	2	6	464049	464054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2578	NC_014534	TG	3	6	464150	464155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_014534	AAG	2	6	464217	464222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_014534	T	6	6	464231	464236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2582	NC_014534	ATC	2	6	465056	465061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_014534	AAGAG	2	10	465124	465133	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_014534	AGT	2	6	465149	465154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2587	NC_014534	ATTT	2	8	465586	465593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2589	NC_014534	T	9	9	465636	465644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2591	NC_014534	TTAA	2	8	465681	465688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_014534	A	6	6	465699	465704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_014534	T	7	7	465743	465749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_014534	TGG	2	6	465852	465857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2598	NC_014534	A	7	7	466412	466418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_014534	TGA	2	6	466617	466622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2602	NC_014534	ACA	2	6	467395	467400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_014534	GTT	2	6	467404	467409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_014534	TTA	2	6	467468	467473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_014534	GAT	2	6	471144	471149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_014534	AT	3	6	471148	471153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_014534	T	7	7	471153	471159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_014534	GAATC	2	10	471184	471193	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2609	NC_014534	AATG	2	8	471197	471204	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_014534	ATTT	2	8	471219	471226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_014534	GCC	2	6	471229	471234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2612	NC_014534	TAA	2	6	471249	471254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_014534	A	7	7	471279	471285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_014534	T	6	6	471303	471308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_014534	ATA	2	6	471347	471352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2617	NC_014534	AAT	2	6	471401	471406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_014534	TTTG	2	8	471423	471430	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_014534	GAGG	2	8	471490	471497	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_014534	TTA	2	6	471498	471503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_014534	AAT	2	6	472386	472391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_014534	CTTA	2	8	472406	472413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2623	NC_014534	T	7	7	472441	472447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_014534	T	6	6	472553	472558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_014534	AGC	2	6	472582	472587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2627	NC_014534	ACC	2	6	472657	472662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2628	NC_014534	CG	3	6	472691	472696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2629	NC_014534	GAT	2	6	472736	472741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_014534	GCA	2	6	472760	472765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2632	NC_014534	TTA	2	6	472876	472881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_014534	ATC	2	6	472887	472892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2634	NC_014534	ACT	2	6	472945	472950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2636	NC_014534	TTC	2	6	473028	473033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2637	NC_014534	TGT	2	6	473064	473069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2638	NC_014534	GGA	2	6	473092	473097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2639	NC_014534	T	6	6	473109	473114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2640	NC_014534	CTC	2	6	473135	473140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2641	NC_014534	A	7	7	473189	473195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2642	NC_014534	A	7	7	473679	473685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2643	NC_014534	TAATC	2	10	473701	473710	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2644	NC_014534	GAG	2	6	473736	473741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2645	NC_014534	TTGC	2	8	473786	473793	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2646	NC_014534	TAC	2	6	473833	473838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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