MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782202

Total Repeats: 2646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014534	CAA	2	6	318191	318196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_014534	TAT	2	6	318233	318238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_014534	TCG	2	6	319083	319088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_014534	ATG	2	6	319155	319160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_014534	AAT	2	6	319176	319181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_014534	ATT	2	6	319202	319207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_014534	AATT	2	8	319212	319219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_014534	C	6	6	319266	319271	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1509	NC_014534	TCT	2	6	321043	321048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_014534	ATT	2	6	326149	326154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_014534	T	7	7	326166	326172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_014534	AATT	2	8	326174	326181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_014534	AGTA	2	8	326214	326221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_014534	AGC	2	6	326368	326373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_014534	CTA	2	6	326412	326417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_014534	CTACTT	2	12	326445	326456	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_014534	AAAT	2	8	326500	326507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_014534	CAT	2	6	326520	326525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_014534	CCT	2	6	326547	326552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_014534	CTG	3	9	326585	326593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_014534	AGT	2	6	326648	326653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_014534	CCT	2	6	326678	326683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_014534	TGT	2	6	326706	326711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_014534	ATT	2	6	327852	327857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_014534	T	6	6	327978	327983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_014534	TAT	2	6	327985	327990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_014534	TAAA	2	8	328021	328028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_014534	TCA	2	6	328322	328327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_014534	TGT	2	6	328403	328408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_014534	CA	3	6	328428	328433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_014534	G	6	6	328513	328518	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_014534	TCG	2	6	328523	328528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_014534	TAG	3	9	328532	328540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_014534	CAAG	2	8	328555	328562	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1535	NC_014534	AATAC	2	10	328589	328598	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1536	NC_014534	GAA	2	6	328660	328665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_014534	CTAG	2	8	328699	328706	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1538	NC_014534	AG	3	6	328717	328722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_014534	A	7	7	328745	328751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_014534	ACT	2	6	328791	328796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_014534	A	7	7	328822	328828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_014534	TAA	2	6	328866	328871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_014534	TAA	2	6	328953	328958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_014534	AGC	2	6	330944	330949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_014534	ATCGCC	2	12	330996	331007	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_014534	ATC	2	6	331025	331030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_014534	CTG	2	6	331087	331092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_014534	ATT	2	6	331133	331138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_014534	TTTA	2	8	331164	331171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_014534	AGC	2	6	331177	331182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_014534	GCA	2	6	332956	332961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_014534	T	8	8	332970	332977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_014534	GAA	2	6	333004	333009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_014534	GAA	2	6	333053	333058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_014534	GTT	2	6	333538	333543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_014534	ATA	2	6	333561	333566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_014534	ACC	2	6	333569	333574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_014534	ACC	2	6	333637	333642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_014534	AG	3	6	333693	333698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_014534	AG	3	6	333717	333722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_014534	GAAA	2	8	333723	333730	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_014534	A	6	6	333931	333936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_014534	GTA	2	6	334042	334047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_014534	GA	3	6	334085	334090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_014534	GAC	2	6	334150	334155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_014534	AGG	2	6	334200	334205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_014534	CAG	2	6	334340	334345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_014534	TTC	2	6	334427	334432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_014534	TTA	2	6	334447	334452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_014534	AAACGT	2	12	334642	334653	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1571	NC_014534	CAGTC	2	10	334750	334759	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1572	NC_014534	TTGT	2	8	334763	334770	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_014534	CTG	2	6	334774	334779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_014534	TA	3	6	334814	334819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_014534	TC	3	6	334881	334886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_014534	ACG	2	6	334898	334903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_014534	AGGA	2	8	334947	334954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_014534	GGA	2	6	335056	335061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_014534	CTTT	2	8	335126	335133	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1580	NC_014534	AG	3	6	335217	335222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_014534	GGC	2	6	335239	335244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_014534	AAT	2	6	335300	335305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_014534	TCT	2	6	335373	335378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_014534	ATTA	2	8	335389	335396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_014534	TGA	2	6	335442	335447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_014534	TACAT	2	10	335495	335504	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1587	NC_014534	AT	3	6	335503	335508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_014534	ATCG	2	8	335545	335552	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1589	NC_014534	GAG	2	6	335579	335584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_014534	A	6	6	341186	341191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_014534	A	6	6	341263	341268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_014534	AAG	2	6	341271	341276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_014534	GAAG	2	8	341300	341307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_014534	CAG	2	6	341313	341318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_014534	TGA	2	6	341346	341351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_014534	TGA	2	6	341368	341373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_014534	AGAT	2	8	341377	341384	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_014534	TGTC	2	8	342382	342389	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1599	NC_014534	ATT	2	6	342399	342404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_014534	A	7	7	342406	342412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_014534	TTA	2	6	342431	342436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_014534	TAA	2	6	343078	343083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_014534	GAT	2	6	343182	343187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_014534	TAA	2	6	344469	344474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_014534	AAG	2	6	344478	344483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_014534	AAT	2	6	344505	344510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_014534	TTCATT	2	12	344541	344552	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1608	NC_014534	AAT	2	6	344680	344685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_014534	GCT	2	6	344701	344706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_014534	ACA	2	6	344863	344868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_014534	CTT	2	6	344939	344944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_014534	AGA	2	6	344981	344986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_014534	GCA	2	6	346808	346813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_014534	GCG	2	6	346860	346865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_014534	ACT	2	6	346903	346908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_014534	AAT	3	9	346954	346962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_014534	T	6	6	347281	347286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_014534	AGG	3	9	347313	347321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_014534	ACCA	2	8	347335	347342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_014534	GCG	2	6	347434	347439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_014534	ATC	2	6	347462	347467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_014534	ATT	2	6	347483	347488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_014534	AAT	2	6	347513	347518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_014534	CAT	2	6	347519	347524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_014534	AGA	2	6	347550	347555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_014534	TA	5	10	347580	347589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_014534	GCA	2	6	347833	347838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_014534	TAGA	2	8	347841	347848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_014534	T	6	6	347915	347920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_014534	ATG	2	6	348274	348279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_014534	A	6	6	348540	348545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_014534	CCT	2	6	348575	348580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1633	NC_014534	TAA	2	6	348673	348678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_014534	TTC	2	6	348680	348685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_014534	GAG	2	6	348699	348704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_014534	CA	3	6	389412	389417	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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