MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782201

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014533	GGCTT	2	10	346	355	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014533	AGCGA	2	10	1896	1905	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014533	TGCCG	2	10	22895	22904	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_014533	CAAAT	2	10	23995	24004	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014533	ACTTT	2	10	28247	28256	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014533	AATTA	2	10	31617	31626	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014533	GTTTC	2	10	45696	45705	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014533	TTAAG	2	10	60729	60738	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014533	AACTC	2	10	60933	60942	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014533	TAATT	2	10	61150	61159	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014533	ATTTA	2	10	61174	61183	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014533	GGCTA	2	10	68951	68960	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014533	ATTTA	2	10	69109	69118	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014533	TTGAA	2	10	70901	70910	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014533	AAAAG	2	10	74712	74721	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014533	ATTTT	2	10	74762	74771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014533	TAATC	2	10	77677	77686	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014533	TTAAA	2	10	84350	84359	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014533	TGAAA	2	10	84507	84516	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014533	TAAAA	2	10	84530	84539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014533	CGTTA	2	10	85094	85103	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014533	ATATT	2	10	85436	85445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014533	GTTAA	2	10	86715	86724	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014533	CTTCG	2	10	95794	95803	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_014533	AGTTT	2	10	96472	96481	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014533	GGCAA	2	10	97511	97520	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014533	AGAAA	2	10	97669	97678	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014533	GGTAA	2	10	97779	97788	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014533	TTTGA	2	10	100528	100537	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014533	ATTAA	2	10	100546	100555	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014533	CTTCC	2	10	125149	125158	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_014533	TATAA	2	10	135711	135720	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014533	TAATT	2	10	144537	144546	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014533	TTTAT	2	10	158986	158995	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014533	TAACT	2	10	163343	163352	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014533	CTCAA	2	10	165876	165885	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014533	TCCTC	2	10	166280	166289	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
38	NC_014533	ATAAA	2	10	168461	168470	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014533	ATTAA	2	10	190985	190994	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014533	TAGTT	2	10	199078	199087	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014533	ATAAA	2	10	199180	199189	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014533	TGGTT	2	10	201300	201309	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014533	TAAAA	2	10	213874	213883	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014533	AGTTA	2	10	219982	219991	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014533	CGCCA	2	10	221777	221786	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_014533	TAAAA	2	10	229141	229150	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014533	TAATA	2	10	240449	240458	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014533	AAATT	2	10	247180	247189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014533	ATATA	2	10	247445	247454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014533	CCTCA	2	10	254825	254834	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
51	NC_014533	AATTT	2	10	255229	255238	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014533	TTGGT	2	10	261337	261346	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014533	AAAGT	2	10	269567	269576	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014533	TTGCC	2	10	269585	269594	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014533	CTTTT	2	10	272397	272406	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014533	TTGCC	2	10	272776	272785	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_014533	GAGTA	2	10	273345	273354	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014533	AAAAT	2	10	274200	274209	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014533	TTTCT	2	10	274374	274383	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014533	ATTAT	2	10	275920	275929	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014533	CAAAT	2	10	276038	276047	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014533	ATTTT	2	10	278786	278795	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014533	TTTAA	2	10	279269	279278	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014533	AGCGA	2	10	279422	279431	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014533	TATTG	2	10	289747	289756	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014533	ATTAA	2	10	300279	300288	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014533	TAAAA	2	10	301564	301573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014533	TAAAA	2	10	308007	308016	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014533	AACTC	2	10	312627	312636	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_014533	AAAAG	2	10	317929	317938	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014533	GTTGT	2	10	323752	323761	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014533	TTTAA	2	10	335828	335837	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014533	TTATA	2	10	337110	337119	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014533	GAAGC	2	10	337303	337312	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014533	TAGCG	2	10	340250	340259	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014533	TAGCG	2	10	340281	340290	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014533	TAGCG	2	10	340312	340321	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014533	CTAAA	2	10	361454	361463	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014533	AAATA	2	10	370705	370714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014533	TTAAA	2	10	372892	372901	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014533	TTAAA	2	10	378728	378737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014533	AATTA	2	10	382700	382709	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014533	AGCGA	2	10	388598	388607	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014533	AGGTT	2	10	406283	406292	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014533	TAGGG	2	10	447640	447649	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014533	CTTAG	2	10	448074	448083	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014533	TATGT	2	10	448796	448805	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014533	GAACA	2	10	449495	449504	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014533	AAAAT	2	10	449631	449640	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014533	AATCG	2	10	455438	455447	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014533	TTTTC	2	10	458680	458689	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014533	AGCCG	2	10	461348	461357	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_014533	CTTCG	2	10	463284	463293	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_014533	GTTGA	2	10	464313	464322	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014533	GTTTG	2	10	469027	469036	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014533	ATTTA	2	10	473703	473712	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014533	CTTTT	2	10	482581	482590	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014533	TTTTA	2	10	487587	487596	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014533	TTTAG	2	10	496965	496974	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014533	TGTAT	2	10	502112	502121	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014533	CAATC	2	10	502920	502929	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_014533	AAACT	2	10	506763	506772	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014533	TTTTG	2	10	506823	506832	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014533	ATGAT	2	10	509022	509031	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014533	TTAAA	2	10	509034	509043	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014533	CCACG	2	10	527066	527075	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_014533	AAAAG	2	10	528777	528786	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014533	TAAAA	2	10	533654	533663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014533	AGACT	2	10	538370	538379	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014533	ATGAT	2	10	539881	539890	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014533	ACTTT	2	10	562373	562382	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014533	TAAAA	2	10	565209	565218	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014533	ATTAA	2	10	571861	571870	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014533	TAAAA	2	10	576033	576042	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014533	GTTAG	2	10	578842	578851	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014533	TAATC	2	10	582433	582442	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014533	AGGGT	2	10	600318	600327	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014533	TGAAT	2	10	600425	600434	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014533	TATAA	2	10	613207	613216	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014533	ATTTT	2	10	617929	617938	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014533	TTAAT	2	10	625320	625329	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014533	TTAGT	2	10	634371	634380	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014533	ATCAT	2	10	681701	681710	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014533	ATGCG	2	10	682018	682027	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014533	CTCTT	2	10	693954	693963	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_014533	TAAAT	2	10	694065	694074	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014533	ACTTA	2	10	700614	700623	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014533	CAAAG	2	10	732015	732024	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014533	AATTA	2	10	732828	732837	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014533	TAACG	2	10	737008	737017	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014533	CAATT	2	10	744431	744440	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014533	TGTAT	2	10	752226	752235	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014533	AAGGC	2	10	757984	757993	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014533	ATTTT	2	10	765248	765257	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014533	ACAAA	2	10	770374	770383	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_014533	TTTAA	2	10	772869	772878	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014533	TTAAT	2	10	774268	774277	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014533	TGATT	2	10	777587	777596	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014533	ATTAA	2	10	779448	779457	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014533	AAAGT	2	10	786073	786082	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014533	TTCCC	2	10	786890	786899	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
142	NC_014533	GGCAA	2	10	787489	787498	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014533	AAAAG	2	10	787868	787877	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014533	CCACG	2	10	800071	800080	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_014533	AAAAG	2	10	801782	801791	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014533	TTAAC	2	10	806643	806652	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014533	GGAAA	2	10	822529	822538	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014533	ACAAA	2	10	830409	830418	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_014533	TTTCT	2	10	832335	832344	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_014533	TATTT	2	10	841109	841118	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014533	TGAGT	2	10	846697	846706	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014533	TAACT	2	10	858206	858215	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_014533	AACCC	2	10	861500	861509	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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158	NC_014533	TGATT	2	10	872428	872437	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014533	CTACC	2	10	875311	875320	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
160	NC_014533	TAATC	2	10	877180	877189	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
161	NC_014533	CAATT	2	10	878078	878087	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
162	NC_014533	CAATC	2	10	878857	878866	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.