MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782201

Total Repeats: 3901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014533	A	6	6	45	50	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014533	AAT	3	9	68	76	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014533	A	6	6	92	97	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014533	ATAA	2	8	104	111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014533	ATTA	2	8	137	144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014533	A	8	8	148	155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014533	TAA	3	9	196	204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014533	A	6	6	203	208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014533	A	6	6	224	229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014533	A	6	6	257	262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014533	GAA	2	6	280	285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014533	TAAA	2	8	317	324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014533	GGCTT	2	10	346	355	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014533	T	7	7	384	390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014533	T	6	6	399	404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014533	ATTT	2	8	459	466	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014533	G	6	6	479	484	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014533	T	7	7	486	492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014533	TAC	2	6	497	502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014533	CATT	2	8	526	533	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014533	AAT	2	6	556	561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014533	A	8	8	667	674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014533	TTAA	2	8	744	751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014533	TGA	2	6	793	798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014533	ATT	2	6	827	832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014533	ACG	2	6	941	946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014533	TCG	2	6	995	1000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014533	GCA	2	6	1070	1075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014533	TTTTAT	2	12	1080	1091	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014533	TCG	2	6	1157	1162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014533	CAA	2	6	1258	1263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014533	ATT	2	6	1302	1307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014533	GAT	2	6	1357	1362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014533	CTC	2	6	1387	1392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_014533	A	6	6	1504	1509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014533	GAA	2	6	1511	1516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014533	A	8	8	1515	1522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014533	TC	3	6	1550	1555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014533	ATA	2	6	1562	1567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014533	AGA	2	6	1581	1586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014533	AGA	2	6	1599	1604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014533	TAAA	2	8	1806	1813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014533	G	6	6	1845	1850	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014533	G	6	6	1854	1859	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014533	C	6	6	1863	1868	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_014533	AGCGA	2	10	1896	1905	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014533	TAG	2	6	1943	1948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014533	T	7	7	1952	1958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014533	AAT	2	6	2102	2107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014533	TTGG	2	8	2111	2118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014533	T	6	6	2144	2149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014533	AAAT	2	8	2265	2272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014533	ATG	2	6	2302	2307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014533	TAAT	2	8	3601	3608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014533	CAA	2	6	12288	12293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014533	T	6	6	12300	12305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014533	AAT	2	6	13375	13380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014533	ATT	2	6	13419	13424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014533	TTA	2	6	13425	13430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014533	T	6	6	13433	13438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014533	TACA	2	8	13445	13452	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014533	TAA	2	6	13583	13588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014533	ATAA	2	8	13599	13606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014533	CA	3	6	13682	13687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014533	ACA	2	6	13776	13781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014533	ATT	2	6	13808	13813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014533	AAT	2	6	13831	13836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014533	CTT	2	6	17793	17798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014533	ATAA	2	8	17813	17820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014533	TCA	2	6	20458	20463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014533	GTT	2	6	20557	20562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014533	ATAA	2	8	20578	20585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014533	TACT	2	8	20683	20690	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014533	CTA	2	6	20693	20698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014533	AATGAA	2	12	20699	20710	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014533	GGC	2	6	20747	20752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014533	CTA	2	6	20772	20777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014533	ATG	3	9	20805	20813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014533	AAT	3	9	20816	20824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014533	ATC	2	6	20853	20858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014533	A	8	8	20873	20880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014533	GTCG	2	8	20908	20915	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014533	TGG	2	6	20947	20952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014533	GAT	2	6	21016	21021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014533	CCTA	2	8	21044	21051	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014533	CCTA	2	8	21116	21123	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014533	ATT	2	6	21154	21159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014533	TAT	2	6	21182	21187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014533	CCTA	2	8	21196	21203	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014533	AGC	2	6	21264	21269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014533	CCTA	2	8	21270	21277	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014533	CCTA	2	8	21344	21351	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014533	CCTA	2	8	21418	21425	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014533	TCC	2	6	21471	21476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_014533	CCTA	2	8	21492	21499	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014533	ACC	2	6	21564	21569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014533	CCTA	2	8	21570	21577	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014533	GGC	2	6	21610	21615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014533	CGG	2	6	21633	21638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014533	CCTA	2	8	21646	21653	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014533	CCTA	2	8	21724	21731	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014533	CCTA	2	8	21797	21804	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014533	CGG	2	6	21858	21863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014533	C	6	6	21871	21876	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_014533	TTC	2	6	21933	21938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014533	CCTA	2	8	21947	21954	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014533	T	6	6	21987	21992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014533	ACC	2	6	21999	22004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_014533	CCTA	2	8	22026	22033	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014533	TAT	2	6	22085	22090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014533	CCTA	2	8	22100	22107	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014533	ATTC	2	8	22149	22156	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014533	ATT	2	6	22165	22170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014533	CCTA	2	8	22174	22181	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014533	GT	3	6	22232	22237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014533	CCTA	2	8	22250	22257	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014533	AAATAG	2	12	22265	22276	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014533	CGC	2	6	22303	22308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_014533	CCTA	2	8	22322	22329	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014533	CCG	3	9	22356	22364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014533	GAAC	2	8	22369	22376	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014533	CCTA	2	8	22395	22402	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014533	CCTA	2	8	22472	22479	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014533	GGA	2	6	22508	22513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014533	CCTA	2	8	22546	22553	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014533	CCTA	2	8	22619	22626	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014533	CCTA	2	8	22692	22699	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014533	CAA	2	6	22756	22761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014533	CCTA	2	8	22768	22775	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014533	AAT	2	6	22803	22808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014533	CCTA	2	8	22843	22850	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014533	AAC	2	6	22875	22880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014533	CG	3	6	22886	22891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014533	TGCCG	2	10	22895	22904	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_014533	CGC	2	6	22910	22915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_014533	CCTA	2	8	22920	22927	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014533	CCTA	2	8	22994	23001	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014533	ATC	2	6	23034	23039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014533	CCTA	2	8	23065	23072	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014533	CCTA	2	8	23140	23147	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014533	GCGA	2	8	23178	23185	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014533	CAG	2	6	23200	23205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014533	CCTA	2	8	23215	23222	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014533	TGT	2	6	23270	23275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014533	A	7	7	23308	23314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014533	ATTT	2	8	23358	23365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014533	A	7	7	23381	23387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014533	GAA	2	6	23396	23401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014533	TCTT	2	8	23418	23425	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014533	ATT	2	6	23449	23454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014533	ATAA	2	8	23500	23507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014533	ACT	2	6	23595	23600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014533	ATT	3	9	23611	23619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014533	TTA	2	6	23633	23638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014533	A	7	7	23667	23673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014533	CTAT	2	8	23678	23685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
157	NC_014533	ATT	2	6	23690	23695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014533	T	6	6	23694	23699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014533	CAT	2	6	23709	23714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_014533	TGT	2	6	23732	23737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014533	A	6	6	23740	23745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014533	A	6	6	23752	23757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014533	AAAT	2	8	23766	23773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014533	TTAT	2	8	23796	23803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014533	TTA	2	6	23907	23912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014533	AAG	2	6	23929	23934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_014533	A	7	7	23938	23944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_014533	CAT	2	6	23978	23983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_014533	CAAAT	2	10	23995	24004	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
170	NC_014533	A	8	8	24028	24035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014533	AGA	2	6	24095	24100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_014533	T	6	6	24174	24179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_014533	CAA	2	6	24221	24226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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175	NC_014533	AATT	2	8	24262	24269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_014533	CTTA	2	8	24318	24325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
177	NC_014533	CAA	2	6	24353	24358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_014533	AAAT	2	8	24397	24404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_014533	TAA	2	6	24438	24443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_014533	ACA	2	6	24583	24588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_014533	AGA	2	6	24607	24612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_014533	A	8	8	24674	24681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_014533	A	6	6	24683	24688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_014533	A	8	8	24693	24700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_014533	GGAGAT	2	12	24737	24748	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
186	NC_014533	GAA	2	6	24797	24802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_014533	A	6	6	24804	24809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_014533	GAAAAT	2	12	24857	24868	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
189	NC_014533	A	6	6	24895	24900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_014533	AT	3	6	24904	24909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_014533	GGT	2	6	24914	24919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
192	NC_014533	AAT	2	6	24922	24927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_014533	ATT	2	6	25052	25057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_014533	ACA	2	6	25114	25119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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224	NC_014533	A	7	7	31288	31294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_014533	AT	3	6	45552	45557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_014533	ATT	2	6	45623	45628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_014533	GTTTC	2	10	45696	45705	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
283	NC_014533	GTT	2	6	45835	45840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_014533	TCC	2	6	46247	46252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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291	NC_014533	TGT	2	6	46398	46403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_014533	T	6	6	46606	46611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_014533	TCC	2	6	50201	50206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
295	NC_014533	C	6	6	50227	50232	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
296	NC_014533	C	6	6	50236	50241	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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