MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782203

Total Repeats: 1998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014502	TA	3	6	78032	78037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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503	NC_014502	CTT	2	6	78284	78289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_014502	GGA	2	6	78322	78327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014502	AAT	2	6	78347	78352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_014502	CTA	2	6	78461	78466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_014502	CT	3	6	78528	78533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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509	NC_014502	GTC	2	6	78626	78631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_014502	AT	3	6	78649	78654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_014502	A	7	7	78661	78667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_014502	CT	3	6	78690	78695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_014502	ACT	2	6	78787	78792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_014502	TTAA	2	8	78817	78824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_014502	AAC	2	6	78834	78839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_014502	TAAA	2	8	78845	78852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014502	A	6	6	78893	78898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014502	TTAAT	2	10	78929	78938	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014502	TAA	2	6	78942	78947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_014502	GATT	2	8	79018	79025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014502	AAT	2	6	79041	79046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014502	TAAA	2	8	79085	79092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014502	AT	3	6	79096	79101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014502	ATG	2	6	79113	79118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014502	CT	3	6	79176	79181	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
526	NC_014502	CAT	2	6	79184	79189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_014502	GCT	3	9	79204	79212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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534	NC_014502	TA	3	6	79499	79504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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536	NC_014502	AAT	2	6	79539	79544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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539	NC_014502	TCA	2	6	79654	79659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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542	NC_014502	GAT	2	6	79752	79757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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545	NC_014502	GAC	2	6	79883	79888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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549	NC_014502	TTAA	2	8	80068	80075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_014502	GAA	2	6	80078	80083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_014502	AAG	2	6	80115	80120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_014502	ATA	2	6	80124	80129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014502	ATT	2	6	80130	80135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014502	TAA	2	6	80169	80174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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559	NC_014502	ATTA	2	8	80421	80428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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573	NC_014502	CTAA	2	8	80897	80904	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
574	NC_014502	A	6	6	80903	80908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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603	NC_014502	TTTA	2	8	82482	82489	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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606	NC_014502	ATT	2	6	82609	82614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014502	T	7	7	82642	82648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_014502	A	6	6	82650	82655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014502	A	8	8	82696	82703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014502	AATT	2	8	83492	83499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_014502	AAAT	2	8	101403	101410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_014502	CA	3	6	101452	101457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
613	NC_014502	TTGA	2	8	101513	101520	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
614	NC_014502	TAA	2	6	101559	101564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014502	TGA	2	6	101639	101644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_014502	T	6	6	101658	101663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_014502	CTG	2	6	101671	101676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_014502	AAT	2	6	101709	101714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014502	ATATG	2	10	101715	101724	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014502	TTC	2	6	101814	101819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_014502	TACT	2	8	103042	103049	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
622	NC_014502	GAA	2	6	103103	103108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014502	ACA	2	6	103122	103127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_014502	GCT	2	6	103196	103201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_014502	TTAC	2	8	103219	103226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
626	NC_014502	TATC	2	8	103249	103256	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
627	NC_014502	TGA	2	6	103258	103263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_014502	TC	3	6	103354	103359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
629	NC_014502	ATTG	2	8	103394	103401	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
630	NC_014502	TGCA	2	8	103419	103426	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
631	NC_014502	AGG	2	6	103484	103489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_014502	TAT	2	6	103501	103506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_014502	TAAA	2	8	103507	103514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_014502	A	6	6	103548	103553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_014502	A	6	6	103557	103562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014502	A	6	6	103566	103571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_014502	CCAC	2	8	103585	103592	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
638	NC_014502	AGC	2	6	103598	103603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_014502	GGA	2	6	103634	103639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
640	NC_014502	GCA	2	6	103650	103655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_014502	A	9	9	103691	103699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_014502	TACT	2	8	103812	103819	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
643	NC_014502	CAA	2	6	103899	103904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_014502	GTA	2	6	103926	103931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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782	NC_014502	ACC	2	6	119733	119738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
783	NC_014502	GAT	2	6	119749	119754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
784	NC_014502	CGA	3	9	119804	119812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
785	NC_014502	CAT	2	6	119849	119854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
786	NC_014502	TGA	2	6	119986	119991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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788	NC_014502	AGT	2	6	120135	120140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
789	NC_014502	GAT	2	6	120150	120155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
790	NC_014502	TGA	2	6	120237	120242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
791	NC_014502	TAT	2	6	120257	120262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
792	NC_014502	ATC	2	6	120267	120272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
793	NC_014502	TGA	2	6	120312	120317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
794	NC_014502	TCA	2	6	120340	120345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
795	NC_014502	TTA	2	6	120346	120351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
796	NC_014502	ATT	2	6	120429	120434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
797	NC_014502	GCT	2	6	120449	120454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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801	NC_014502	CGG	2	6	120716	120721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
802	NC_014502	TCT	2	6	120731	120736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
803	NC_014502	CTG	2	6	120741	120746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
804	NC_014502	GCC	2	6	120763	120768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
805	NC_014502	TA	3	6	120776	120781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
806	NC_014502	TCC	2	6	120793	120798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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813	NC_014502	GTT	3	9	121055	121063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
814	NC_014502	ATC	2	6	121065	121070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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865	NC_014502	ATT	2	6	131791	131796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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869	NC_014502	ACA	2	6	131955	131960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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881	NC_014502	A	7	7	132436	132442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
882	NC_014502	AATTAA	2	12	132475	132486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
883	NC_014502	TAC	2	6	132506	132511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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901	NC_014502	T	6	6	134721	134726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
902	NC_014502	AATT	2	8	135785	135792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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908	NC_014502	TAA	2	6	139302	139307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
909	NC_014502	A	6	6	139386	139391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
910	NC_014502	T	6	6	139575	139580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
911	NC_014502	T	6	6	139594	139599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
912	NC_014502	TAA	3	9	139628	139636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
913	NC_014502	CTT	2	6	140241	140246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
914	NC_014502	GAC	2	6	141235	141240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
915	NC_014502	TGA	2	6	141308	141313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
916	NC_014502	TAA	2	6	142273	142278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
917	NC_014502	TTC	2	6	142379	142384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
918	NC_014502	AAT	2	6	142403	142408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
919	NC_014502	TGC	2	6	142426	142431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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