MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 chromosome

Total Repeats: 21713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014501	T	6	6	131966	131971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_014501	ATC	2	6	131980	131985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_014501	GA	3	6	132060	132065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_014501	T	6	6	132081	132086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014501	GTT	2	6	132130	132135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_014501	GAT	2	6	132139	132144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_014501	C	7	7	132216	132222	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
508	NC_014501	AGGT	2	8	132359	132366	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_014501	TACT	3	12	132413	132424	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
510	NC_014501	T	6	6	132424	132429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_014501	TAA	2	6	132548	132553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_014501	AAG	2	6	132576	132581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014501	A	6	6	132599	132604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_014501	TAAA	2	8	132621	132628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_014501	GT	3	6	134595	134600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_014501	GGC	2	6	134603	134608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_014501	ATT	2	6	134742	134747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014501	CTTT	2	8	134769	134776	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
519	NC_014501	TTA	2	6	134777	134782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_014501	T	6	6	134783	134788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014501	ACCCT	2	10	134828	134837	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
522	NC_014501	CGT	2	6	134883	134888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_014501	ACC	2	6	134935	134940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_014501	TG	3	6	135681	135686	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014501	A	8	8	135753	135760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_014501	TCT	2	6	135774	135779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_014501	AAT	2	6	135865	135870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_014501	TAT	2	6	135899	135904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_014501	TTTA	2	8	135905	135912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014501	GGC	2	6	138299	138304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_014501	TTTA	2	8	139035	139042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014501	GCG	2	6	139111	139116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_014501	AT	3	6	139156	139161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014501	GA	3	6	139173	139178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_014501	ATA	2	6	139217	139222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014501	TTC	2	6	139249	139254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_014501	TAAA	2	8	139280	139287	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_014501	CAT	2	6	139338	139343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_014501	TCA	2	6	139347	139352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_014501	TAA	2	6	143982	143987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014501	TCT	2	6	143996	144001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_014501	CTAC	2	8	144008	144015	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_014501	TAA	2	6	144020	144025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_014501	A	6	6	144887	144892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014501	ATT	2	6	144903	144908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_014501	CTT	2	6	146206	146211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_014501	A	6	6	146307	146312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_014501	CCA	2	6	147747	147752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_014501	GAT	2	6	147755	147760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_014501	CCT	2	6	147763	147768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_014501	GCAGT	2	10	147771	147780	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
552	NC_014501	AGA	2	6	147855	147860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014501	GATA	2	8	147941	147948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014501	GCA	2	6	148013	148018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_014501	GTAG	2	8	148030	148037	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_014501	CAA	2	6	148082	148087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_014501	CGT	2	6	148090	148095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_014501	CCA	2	6	148099	148104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_014501	ATC	2	6	148728	148733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_014501	TAA	2	6	148766	148771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_014501	ACC	2	6	148866	148871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_014501	ATCA	2	8	148875	148882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
563	NC_014501	TTTA	2	8	148893	148900	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_014501	CTA	2	6	148905	148910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_014501	A	6	6	148928	148933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_014501	T	6	6	149044	149049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_014501	ATT	2	6	150911	150916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_014501	GTTTG	2	10	150919	150928	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
569	NC_014501	TTG	2	6	150938	150943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014501	CGC	2	6	150971	150976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_014501	TTA	2	6	152797	152802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_014501	TTA	2	6	152811	152816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_014501	AGG	2	6	152839	152844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_014501	TGAT	2	8	152876	152883	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
575	NC_014501	ACTA	2	8	152936	152943	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
576	NC_014501	A	6	6	154133	154138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_014501	ATT	2	6	154158	154163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_014501	A	6	6	154221	154226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_014501	CA	3	6	154227	154232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_014501	CAT	2	6	154236	154241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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582	NC_014501	T	6	6	154302	154307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_014501	AG	3	6	154312	154317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_014501	TCA	2	6	154332	154337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_014501	CAA	2	6	154368	154373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_014501	ATCA	2	8	154378	154385	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
587	NC_014501	CTA	2	6	154483	154488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_014501	ATA	2	6	154619	154624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_014501	AGT	2	6	154638	154643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_014501	CAA	2	6	154652	154657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_014501	TTGA	2	8	156503	156510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
592	NC_014501	TAA	2	6	156901	156906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_014501	TAA	2	6	156908	156913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014501	CAT	2	6	156915	156920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_014501	AGT	2	6	157466	157471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_014501	TCAG	2	8	158826	158833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
597	NC_014501	TCTAG	2	10	158849	158858	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
598	NC_014501	CTG	2	6	158917	158922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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600	NC_014501	ATT	2	6	158968	158973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014501	AAT	2	6	160148	160153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_014501	A	6	6	160168	160173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_014501	TAA	2	6	160206	160211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_014501	CTTT	2	8	161691	161698	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
606	NC_014501	TTA	2	6	162556	162561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014501	TGAG	2	8	162573	162580	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_014501	GAG	2	6	162591	162596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014501	GTT	2	6	162605	162610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014501	GGC	2	6	162623	162628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_014501	TATAT	2	10	162648	162657	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_014501	GTA	2	6	164532	164537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_014501	AGAT	2	8	164564	164571	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
614	NC_014501	TTAAT	2	10	166296	166305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014501	A	7	7	166359	166365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_014501	TTA	2	6	166369	166374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_014501	TAAATT	2	12	166602	166613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014501	T	6	6	166616	166621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014501	AGT	2	6	166622	166627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014501	TAG	2	6	166653	166658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_014501	TCT	2	6	166688	166693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_014501	GA	3	6	166699	166704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014501	A	6	6	166726	166731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_014501	AAAT	2	8	166767	166774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_014501	TTA	2	6	166794	166799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_014501	AATC	2	8	166802	166809	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
627	NC_014501	AAT	2	6	166815	166820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_014501	T	6	6	166824	166829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_014501	AAG	2	6	166849	166854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_014501	CA	3	6	166941	166946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
631	NC_014501	A	6	6	166993	166998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_014501	CT	3	6	167128	167133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_014501	A	7	7	167135	167141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_014501	CAAA	2	8	167712	167719	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
635	NC_014501	A	6	6	167717	167722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014501	CG	3	6	167725	167730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
637	NC_014501	GAA	2	6	167833	167838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_014501	A	7	7	167926	167932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_014501	ACT	2	6	168013	168018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_014501	CT	4	8	168028	168035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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981	NC_014501	GAACA	2	10	262145	262154	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
982	NC_014501	CGG	2	6	262169	262174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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