MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Sulcia muelleri CARI chromosome

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014499	ATTT	2	8	3633	3640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014499	AAGA	2	8	17310	17317	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014499	TTTA	2	8	18531	18538	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014499	ATAA	3	12	24078	24089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014499	ATTA	2	8	38236	38243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014499	ATTA	2	8	38257	38264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014499	TTTA	2	8	48653	48660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014499	ATTT	2	8	50391	50398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014499	AATT	2	8	50406	50413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014499	AAAT	2	8	51761	51768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014499	ATTA	2	8	51911	51918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014499	AGAA	2	8	63035	63042	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014499	ATTT	2	8	63558	63565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014499	TTTC	2	8	63566	63573	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014499	AATT	2	8	63658	63665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014499	TCAA	2	8	64513	64520	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014499	TAAA	2	8	68212	68219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014499	TTGT	2	8	69326	69333	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014499	TAAA	2	8	69452	69459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014499	TTTA	2	8	69667	69674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014499	AAAT	2	8	69739	69746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014499	TAAT	2	8	80864	80871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014499	TTTA	2	8	81443	81450	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014499	TAAT	2	8	81460	81467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014499	AAGA	2	8	82815	82822	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014499	AATA	2	8	83143	83150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014499	TATT	2	8	83156	83163	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014499	TATT	2	8	92558	92565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014499	ATAC	2	8	92884	92891	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014499	TTAG	2	8	93011	93018	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014499	ACTA	2	8	93589	93596	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014499	TAAT	2	8	94330	94337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014499	GCGA	2	8	94849	94856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014499	TTTA	2	8	96811	96818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014499	TCTA	2	8	97234	97241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014499	ATTA	2	8	107102	107109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014499	TAAT	2	8	113033	113040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014499	ATTA	2	8	113049	113056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014499	TAAA	2	8	119143	119150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014499	ATTA	2	8	124200	124207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014499	CACG	2	8	145157	145164	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014499	CTGG	2	8	145228	145235	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014499	AAAT	2	8	145332	145339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014499	CACT	2	8	152922	152929	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014499	AATT	2	8	152940	152947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014499	AAAT	2	8	168430	168437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014499	GAAT	2	8	170082	170089	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014499	AATC	2	8	170393	170400	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014499	AATA	2	8	171334	171341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014499	ATCC	2	8	176247	176254	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014499	TAAA	2	8	178446	178453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014499	AAAT	2	8	178640	178647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014499	TATT	2	8	180742	180749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014499	TTAA	2	8	181081	181088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014499	TAAA	2	8	184860	184867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014499	TATT	2	8	185140	185147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014499	AAAT	2	8	185251	185258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014499	ATTT	2	8	185744	185751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014499	ATTA	2	8	185804	185811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014499	CTTT	2	8	186153	186160	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014499	AATA	2	8	186214	186221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014499	AATT	2	8	186651	186658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014499	ATTT	2	8	186732	186739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014499	CAAT	2	8	186744	186751	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014499	TCTT	2	8	186973	186980	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014499	ATTA	2	8	187133	187140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014499	TTTA	2	8	187189	187196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014499	ATTT	2	8	187305	187312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014499	TAAT	2	8	187371	187378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014499	ATTA	2	8	187690	187697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014499	TTTA	2	8	187741	187748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014499	TATT	2	8	187893	187900	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014499	TAAT	2	8	188045	188052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014499	ATTA	2	8	188058	188065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014499	TATC	2	8	190796	190803	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014499	AAAC	2	8	190899	190906	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014499	ATTA	2	8	193861	193868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014499	TTAA	2	8	194180	194187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014499	TTTC	2	8	196223	196230	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014499	CTTT	2	8	196276	196283	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014499	TAAC	2	8	203652	203659	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014499	TTTA	2	8	212092	212099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014499	ATTA	2	8	212473	212480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014499	ATTT	2	8	212855	212862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014499	TAAT	2	8	214905	214912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014499	ATTT	2	8	214951	214958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014499	TAAA	2	8	215237	215244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014499	AATT	2	8	216895	216902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014499	AAAT	2	8	233924	233931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014499	ATTT	2	8	234119	234126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014499	TCTT	2	8	234151	234158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014499	ATAA	2	8	234256	234263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014499	AATT	2	8	238462	238469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014499	ATTA	2	8	248271	248278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014499	ATTA	2	8	253172	253179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014499	ATTT	2	8	259303	259310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014499	ATTT	2	8	259318	259325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014499	ATTT	2	8	259333	259340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014499	TAAT	2	8	265261	265268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014499	TAAA	2	8	266287	266294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014499	TATT	2	8	267812	267819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014499	TACA	2	8	268730	268737	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014499	TAAA	2	8	276477	276484	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.