MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Sulcia muelleri CARI chromosome

Total Repeats: 389

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014499	TAT	3	9	3618	3626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014499	AAT	2	6	3627	3632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014499	AAC	2	6	12916	12921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014499	AAG	2	6	12933	12938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014499	TAA	2	6	12953	12958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014499	TAT	2	6	13008	13013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014499	TAA	2	6	13025	13030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014499	TAT	2	6	17140	17145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014499	ATT	2	6	17158	17163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014499	ATA	2	6	17175	17180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014499	ATA	3	9	17262	17270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014499	TAT	2	6	17292	17297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014499	TAA	2	6	17304	17309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014499	TAA	2	6	17345	17350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014499	TAT	2	6	18453	18458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014499	TAA	2	6	18465	18470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014499	ATT	3	9	18506	18514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014499	ATA	2	6	20261	20266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014499	TTA	3	9	20267	20275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014499	AAT	2	6	20282	20287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014499	TCG	2	6	24965	24970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014499	TAA	2	6	29199	29204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014499	ATA	2	6	29205	29210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014499	TAT	2	6	38123	38128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014499	ATC	3	9	38132	38140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014499	CTT	2	6	38228	38233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014499	CTT	2	6	38249	38254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014499	ATT	2	6	46133	46138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014499	ATT	2	6	47397	47402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014499	TAA	2	6	47420	47425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014499	TAT	2	6	48613	48618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014499	TAA	2	6	48645	48650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014499	ATT	2	6	50439	50444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014499	ATT	2	6	50478	50483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014499	TAA	2	6	50484	50489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014499	TAT	2	6	50493	50498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014499	ATT	2	6	50535	50540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014499	TCT	2	6	50548	50553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014499	ATT	2	6	51615	51620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014499	TAA	2	6	51672	51677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014499	TAA	2	6	51786	51791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014499	ATT	3	9	51801	51809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014499	ATG	2	6	51839	51844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014499	ATT	2	6	51865	51870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014499	TAA	2	6	51919	51924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014499	TAT	2	6	51935	51940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014499	ATA	3	9	51945	51953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014499	TTA	2	6	51994	51999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014499	ATA	2	6	52009	52014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014499	TAA	2	6	52031	52036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014499	AAT	2	6	57685	57690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014499	TAA	2	6	60112	60117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014499	AAT	2	6	60118	60123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014499	CAG	2	6	63047	63052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014499	TTA	2	6	63147	63152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014499	GAT	2	6	63202	63207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014499	TAA	2	6	63225	63230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014499	TAG	2	6	63252	63257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014499	CTG	2	6	63267	63272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014499	TAA	2	6	63332	63337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014499	ATT	2	6	63384	63389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014499	AAG	2	6	63412	63417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014499	GGT	2	6	63461	63466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014499	TTG	2	6	63489	63494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014499	TAT	2	6	63596	63601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014499	TCA	2	6	63719	63724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014499	AGC	2	6	63760	63765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014499	ATA	2	6	63903	63908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014499	CAA	2	6	63914	63919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014499	TAC	2	6	63928	63933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014499	GAT	2	6	63935	63940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014499	AGA	2	6	63997	64002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014499	TAA	2	6	64020	64025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014499	TTA	2	6	64029	64034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014499	ATT	2	6	64037	64042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014499	TAA	2	6	64063	64068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014499	CTT	2	6	64158	64163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014499	GAA	2	6	64166	64171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014499	TAG	2	6	64206	64211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014499	ATT	2	6	64282	64287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014499	TAG	2	6	64306	64311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014499	TAG	2	6	64314	64319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014499	ATG	2	6	64415	64420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014499	TAA	2	6	64531	64536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014499	TCA	2	6	64594	64599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014499	AGA	2	6	64606	64611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014499	ATG	2	6	64619	64624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014499	TAG	2	6	64641	64646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014499	CAG	2	6	64737	64742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014499	AGC	2	6	64858	64863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014499	ATT	2	6	64898	64903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014499	AGA	2	6	64981	64986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014499	ATT	2	6	64992	64997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014499	ATT	2	6	65026	65031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014499	TAG	2	6	65061	65066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014499	TAA	2	6	65142	65147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014499	AAT	2	6	67173	67178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014499	ATT	2	6	68857	68862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014499	TTA	2	6	68863	68868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014499	ATA	2	6	68963	68968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014499	TGA	2	6	69093	69098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014499	ATA	2	6	69249	69254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014499	TTA	2	6	69472	69477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014499	AAC	2	6	69509	69514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014499	TAA	2	6	69532	69537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014499	ATA	2	6	69615	69620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014499	TTA	2	6	69693	69698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014499	TTC	2	6	69756	69761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014499	TAT	2	6	69774	69779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014499	ATT	2	6	69834	69839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014499	ATT	2	6	74862	74867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014499	ATA	2	6	78839	78844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014499	TAT	2	6	81014	81019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014499	TAT	2	6	81126	81131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014499	ATT	2	6	81208	81213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014499	ATT	2	6	81312	81317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014499	AAT	2	6	81325	81330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014499	TTA	2	6	81376	81381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014499	TAT	2	6	81424	81429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014499	TAT	2	6	81437	81442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014499	ATT	2	6	81471	81476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014499	GGT	2	6	81492	81497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014499	AAT	2	6	82978	82983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014499	CAG	2	6	82985	82990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014499	ATT	2	6	83131	83136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014499	ATA	3	9	84538	84546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014499	TAT	2	6	84551	84556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014499	TAA	2	6	84562	84567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014499	TAT	2	6	92528	92533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014499	TAA	2	6	92534	92539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014499	ATT	2	6	92547	92552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014499	TAT	2	6	92578	92583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014499	TAA	2	6	92584	92589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014499	TAT	2	6	92637	92642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014499	CTT	2	6	92664	92669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014499	TCT	2	6	92670	92675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014499	AAG	2	6	92677	92682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014499	GAA	2	6	92739	92744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014499	GCA	2	6	92823	92828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014499	GCA	2	6	93118	93123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014499	GGA	2	6	93143	93148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014499	CAG	2	6	93283	93288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.