MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Zinderia insecticola CARI chromosome

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014497	ATATT	2	10	293	302	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014497	AAAAT	2	10	382	391	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014497	ATATA	2	10	4283	4292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014497	TAAAA	2	10	5145	5154	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014497	CTTAA	2	10	5921	5930	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014497	AAAAT	2	10	6144	6153	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014497	TCGTG	2	10	6376	6385	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014497	TAAAT	2	10	6841	6850	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014497	GGGAG	2	10	7417	7426	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014497	AAATA	2	10	8496	8505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014497	TAAGA	2	10	9688	9697	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014497	ATTAT	2	10	12141	12150	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014497	TAAAA	2	10	12268	12277	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014497	ATTAT	2	10	12843	12852	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014497	TAGAA	2	10	13686	13695	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014497	ATATT	2	10	14086	14095	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014497	AAAAT	2	10	14101	14110	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014497	TTTAA	2	10	14749	14758	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014497	TTAAA	2	10	14795	14804	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014497	TATAA	2	10	17023	17032	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014497	ATTTT	3	15	17033	17047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014497	TAAAA	2	10	22338	22347	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014497	ATATT	2	10	24016	24025	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014497	TAAAA	2	10	35582	35591	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014497	TAAAA	2	10	43938	43947	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014497	ATTAT	2	10	56758	56767	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014497	TAGTA	2	10	56858	56867	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014497	TTTAA	2	10	57450	57459	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014497	AAATT	2	10	57517	57526	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014497	ATTTT	2	10	57834	57843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014497	TATAA	2	10	64694	64703	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014497	ATTTT	2	10	65933	65942	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014497	AATTT	2	10	66437	66446	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014497	TTAAA	2	10	66474	66483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014497	TAAAA	2	10	66616	66625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014497	TTTTA	2	10	67328	67337	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014497	ATTTT	2	10	74628	74637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014497	ATTTT	2	10	74905	74914	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014497	TAAAA	2	10	74961	74970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014497	TATAA	2	10	75202	75211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014497	AATTT	2	10	89885	89894	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014497	TAAAA	2	10	90104	90113	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014497	AATTT	2	10	104029	104038	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014497	AAATT	2	10	104055	104064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014497	ATTTT	2	10	109143	109152	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014497	TTAAA	2	10	112782	112791	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014497	AATAT	2	10	129109	129118	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014497	TAATA	2	10	129123	129132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014497	TATAA	2	10	148185	148194	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014497	TCAAA	2	10	148296	148305	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014497	TCAAA	2	10	148392	148401	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014497	AAAAT	2	10	149506	149515	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014497	TAATA	2	10	150142	150151	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014497	AAATA	2	10	150181	150190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014497	TAAAA	2	10	150211	150220	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014497	TTTAT	2	10	150372	150381	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014497	ATTTA	2	10	156648	156657	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014497	TAAAA	2	10	156792	156801	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014497	TAAAA	2	10	160189	160198	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014497	ATATA	2	10	179028	179037	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014497	ATAAA	2	10	179153	179162	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014497	ATAAA	2	10	179181	179190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014497	ATTTA	2	10	179633	179642	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014497	TAATA	2	10	179654	179663	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014497	TAAAA	2	10	180029	180038	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014497	AATTA	2	10	196006	196015	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.