MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Zinderia insecticola CARI chromosome

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014497	TATT	2	8	228	235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014497	TAAA	2	8	313	320	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014497	GCTT	2	8	5391	5398	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014497	GTGA	2	8	5707	5714	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014497	GAAA	2	8	5749	5756	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014497	AGAT	2	8	5899	5906	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014497	GCGA	2	8	7173	7180	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014497	TTTG	2	8	7322	7329	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014497	TAGG	2	8	7545	7552	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014497	CAAA	2	8	7717	7724	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014497	AAAT	2	8	7858	7865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014497	AGAC	2	8	7871	7878	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014497	AAAG	2	8	8013	8020	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014497	ATTT	2	8	8436	8443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014497	GGTG	2	8	8540	8547	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014497	AAAT	2	8	9706	9713	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014497	ATTT	2	8	11949	11956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014497	TAAT	2	8	12009	12016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014497	ATTT	2	8	12086	12093	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014497	ATTT	2	8	12110	12117	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014497	TTTA	3	12	12225	12236	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014497	TAAT	2	8	12333	12340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014497	TTTA	3	12	12379	12390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014497	ATTT	2	8	12445	12452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014497	ATTT	2	8	12469	12476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014497	TTTA	2	8	12570	12577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014497	TAAA	2	8	12608	12615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014497	TAAT	2	8	12648	12655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014497	TAAT	2	8	12677	12684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014497	TTTA	3	12	12723	12734	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014497	ATTT	2	8	12788	12795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014497	ATTT	2	8	12812	12819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014497	ATTA	2	8	12979	12986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014497	TAAA	2	8	13717	13724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014497	TAAA	2	8	13726	13733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014497	TAAT	2	8	13906	13913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014497	AAAT	2	8	14222	14229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014497	GATA	2	8	14235	14242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014497	TTAA	2	8	14350	14357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014497	TATT	2	8	14612	14619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014497	TAAA	2	8	14822	14829	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014497	TAAA	2	8	14852	14859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014497	AGAA	2	8	14901	14908	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014497	TATT	2	8	14919	14926	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014497	ATAA	2	8	17210	17217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014497	AATA	2	8	17302	17309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014497	ATAA	2	8	17423	17430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014497	ATAA	2	8	17448	17455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014497	TAAA	2	8	35056	35063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014497	TAAT	2	8	35154	35161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014497	TAAT	2	8	35232	35239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014497	TAAT	2	8	35290	35297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014497	TAAT	2	8	35363	35370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014497	TAAT	2	8	35421	35428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014497	ATTA	2	8	35491	35498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014497	TAAT	2	8	35523	35530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014497	TAAA	2	8	35568	35575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014497	CCTA	2	8	43849	43856	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014497	ATTT	2	8	43906	43913	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014497	TAAA	2	8	51573	51580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014497	ATTA	2	8	56703	56710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014497	TAGT	2	8	57047	57054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014497	TTTA	3	12	57179	57190	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014497	AAAT	2	8	57220	57227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014497	ATAA	2	8	57248	57255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014497	TTAT	2	8	57337	57344	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014497	TAAA	2	8	57630	57637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014497	ATAA	2	8	57725	57732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014497	TAAA	2	8	57940	57947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014497	TAAA	3	12	64660	64671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014497	ATAA	2	8	64732	64739	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014497	TATT	2	8	64806	64813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014497	ATTT	2	8	64868	64875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014497	ATTT	3	12	64886	64897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014497	ATTA	2	8	66056	66063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014497	TATT	2	8	66300	66307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014497	TTAT	2	8	66308	66315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014497	TATT	2	8	66351	66358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014497	ATTT	2	8	66379	66386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014497	AATA	2	8	67152	67159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014497	ATAA	2	8	74868	74875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014497	TAAA	2	8	75127	75134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014497	AAAT	2	8	75172	75179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014497	TTAT	2	8	76775	76782	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014497	TAAA	3	12	76826	76837	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014497	TATT	2	8	76852	76859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014497	TAAT	2	8	89957	89964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014497	TAAA	2	8	89978	89985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014497	TAAA	2	8	90084	90091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014497	TAAA	2	8	90156	90163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014497	AAAT	2	8	90177	90184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014497	AATT	2	8	90191	90198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014497	TTAT	2	8	103970	103977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014497	ATAA	2	8	103996	104003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014497	AAAT	2	8	104042	104049	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014497	TTTG	2	8	108857	108864	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014497	TGGT	2	8	108919	108926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014497	TATT	2	8	108990	108997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014497	TATT	2	8	109035	109042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014497	ATAA	2	8	112482	112489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014497	TAAA	2	8	112712	112719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014497	TAAT	2	8	116614	116621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014497	ATTA	2	8	116622	116629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014497	TAAA	2	8	120066	120073	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014497	TAAA	2	8	128821	128828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014497	ATTA	2	8	131888	131895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014497	GTAG	2	8	148245	148252	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014497	GTAG	2	8	148341	148348	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014497	TAAA	2	8	149557	149564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014497	ATAA	2	8	149966	149973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014497	TAAA	2	8	150432	150439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014497	ATAA	2	8	150515	150522	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014497	TTTA	2	8	156570	156577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014497	TAAA	2	8	156581	156588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014497	ATAA	2	8	156637	156644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014497	TATT	2	8	160120	160127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014497	TAAA	2	8	160222	160229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014497	ATAA	2	8	168236	168243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014497	TAAA	2	8	178971	178978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014497	AAAT	3	12	179199	179210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014497	ATAA	2	8	179249	179256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014497	TAAA	2	8	179323	179330	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014497	AAAT	2	8	179603	179610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014497	TAAA	2	8	179674	179681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014497	ATTA	2	8	179740	179747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014497	TAAA	2	8	179965	179972	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014497	TATT	2	8	195850	195857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014497	ATTT	2	8	198800	198807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014497	TAAT	2	8	202198	202205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014497	AAAT	2	8	206262	206269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.