MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor obsidiansis OB47 chromosome

Total Repeats: 203

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014392	AAAACC	2	12	1913	1924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014392	GATACA	2	12	20612	20623	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014392	GAAGAG	2	12	20843	20854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014392	TATAAA	2	12	22981	22992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014392	AAATTA	2	12	30684	30695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014392	TAAAAA	2	12	45272	45283	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014392	AAAACC	2	12	50216	50227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014392	GAAATG	2	12	65574	65585	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014392	TAACTA	2	12	87942	87953	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014392	ATTTTT	2	12	102922	102933	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014392	AAAATT	2	12	107127	107138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014392	TGTGAC	2	12	107398	107409	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014392	AAGACA	2	12	109544	109555	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014392	ATTTTG	2	12	128402	128413	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014392	ATTTTA	2	12	147366	147377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014392	TAAGAA	2	12	148817	148828	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014392	GAGCAG	2	12	152638	152649	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014392	GAGCAG	2	12	152968	152979	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014392	CAAATT	2	12	157604	157615	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014392	AGGGCG	2	12	159216	159227	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014392	TGTCAT	2	12	161366	161377	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014392	CAGGGA	2	12	161902	161913	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014392	GCAATA	2	12	161925	161936	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014392	GATAAT	2	12	162361	162372	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014392	AAAATC	2	12	162802	162813	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014392	GTAAAA	2	12	175812	175823	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014392	TAAAAT	2	12	180201	180212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014392	CAAAAA	2	12	183780	183791	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014392	AGGTAT	2	12	183897	183908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014392	GGATAA	2	12	189687	189698	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014392	GATTTT	2	12	211086	211097	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014392	CTTAAC	2	12	220706	220717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014392	TCAAAA	2	12	235837	235848	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014392	TGAAGC	2	12	238775	238786	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014392	TAAAAA	2	12	265385	265396	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014392	AAAAAT	2	12	277760	277771	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014392	TGGAGT	2	12	287928	287939	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014392	AAATTA	2	12	311940	311951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014392	ATGATA	2	12	313541	313552	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014392	CCAATT	2	12	315041	315052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014392	TAATTT	2	12	315345	315356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014392	AAAAGT	2	12	356758	356769	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014392	TTTATT	2	12	357771	357782	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014392	AAATGA	2	12	361167	361178	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014392	ACAGAT	2	12	362087	362098	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014392	AAGTGA	2	12	366383	366394	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014392	GGATTG	2	12	366858	366869	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014392	ATGAAA	2	12	373328	373339	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014392	AAAAAG	2	12	373719	373730	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014392	TAATTT	2	12	380463	380474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014392	TAAGAT	2	12	388023	388034	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014392	AAGATT	2	12	389194	389205	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014392	TAAAAT	2	12	414435	414446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014392	TAATTT	2	12	418842	418853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014392	AAACGA	2	12	430669	430680	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014392	ATTTAA	2	12	442641	442652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014392	GATTTT	2	12	445492	445503	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014392	AAAACC	2	12	486772	486783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014392	ATTGTT	2	12	500637	500648	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014392	ATATTT	2	12	502623	502634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014392	ACAAAA	2	12	503360	503371	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014392	ATGAAG	2	12	503545	503556	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014392	TTGACT	2	12	530573	530584	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014392	TGAAAA	2	12	535278	535289	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014392	ACAATC	2	12	553869	553880	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014392	TAATTT	2	12	597161	597172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014392	AATTTC	2	12	616795	616806	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014392	GTTAAG	2	12	620707	620718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014392	TTTTCA	2	12	692505	692516	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014392	TAATAT	2	12	703024	703035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014392	AATTAA	2	12	720722	720733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014392	TTTTGG	2	12	731558	731569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014392	ATACAA	2	12	731666	731677	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014392	AAAATA	2	12	731722	731733	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014392	TTTATA	2	12	735392	735403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014392	AATAAC	2	12	735456	735467	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014392	ATACAA	2	12	736001	736012	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014392	TAAAAA	2	12	736054	736065	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014392	TGCTAT	2	12	738239	738250	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014392	GATTTC	2	12	738622	738633	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014392	TCCAAT	2	12	751091	751102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014392	ATCAAA	2	12	752110	752121	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014392	AAATTA	2	12	785935	785946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014392	AAAAGT	2	12	786046	786057	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014392	CTTTTT	2	12	791660	791671	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014392	GTTTTT	2	12	802685	802696	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014392	TTGGTA	2	12	833472	833483	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014392	TGTCAT	2	12	956992	957003	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014392	TAAAAA	2	12	961606	961617	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014392	GAAAAA	2	12	962162	962173	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014392	TTTTAT	2	12	1023030	1023041	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014392	AAAAAG	2	12	1031656	1031667	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014392	GAGATT	2	12	1056274	1056285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014392	TTCCTA	2	12	1061008	1061019	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014392	AAAGTC	2	12	1069280	1069291	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014392	ATTGGA	2	12	1077776	1077787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014392	TGTTAT	2	12	1080331	1080342	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014392	ATAAAA	2	12	1081661	1081672	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014392	ATTTTA	2	12	1082345	1082356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014392	GACAAA	2	12	1087723	1087734	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014392	TTTTTA	2	12	1090416	1090427	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014392	AATTTT	2	12	1102989	1103000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014392	TTGCTT	2	12	1157828	1157839	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014392	ATCTTA	2	12	1157863	1157874	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014392	GTAAAT	2	12	1160352	1160363	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014392	TCAAAA	2	12	1162703	1162714	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014392	TAAAAA	2	12	1162722	1162733	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014392	CAATTA	2	12	1183938	1183949	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014392	TAAAAT	2	12	1183993	1184004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014392	AGGAGA	2	12	1202041	1202052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014392	CCAAAA	2	12	1210524	1210535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014392	TAAAAA	2	12	1268396	1268407	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014392	TATAAA	2	12	1281263	1281274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014392	AAAATA	2	12	1284984	1284995	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014392	TTGTTA	2	12	1285434	1285445	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014392	CTTTTT	2	12	1287668	1287679	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014392	TCCATC	2	12	1310016	1310027	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014392	AATTTG	2	12	1311961	1311972	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014392	TGAATC	2	12	1328892	1328903	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_014392	ACTTCT	2	12	1470210	1470221	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014392	TTCCTT	2	12	1480799	1480810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014392	ATTGTT	2	12	1488628	1488639	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014392	CAATTT	2	12	1513082	1513093	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014392	TCTTCA	2	12	1612408	1612419	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014392	AAAAAC	2	12	1612437	1612448	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014392	CCCAGC	2	12	1650970	1650981	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_014392	CTTTCT	2	12	1672764	1672775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014392	CTTAAC	2	12	1674735	1674746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014392	CTTTCT	2	12	1682620	1682631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014392	AATTAT	2	12	1702785	1702796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014392	ATTCTT	2	12	1708064	1708075	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_014392	AATTTT	2	12	1754517	1754528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.