MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium saccharolyticum WM1 chromosome

Total Repeats: 700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014376	TAAAA	2	10	18142	18151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014376	ACAGA	2	10	18161	18170	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014376	CCTTC	2	10	19570	19579	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_014376	TCGTG	2	10	19618	19627	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014376	GGGAG	2	10	21436	21445	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014376	CCGTA	2	10	22537	22546	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_014376	ATATA	2	10	24303	24312	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014376	ATTAT	2	10	24951	24960	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014376	AAAGG	2	10	25068	25077	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014376	ATTAT	2	10	55588	55597	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014376	AAAGT	2	10	59605	59614	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014376	GTATA	3	15	65688	65702	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014376	AGAGG	2	10	109933	109942	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014376	AAATG	2	10	111083	111092	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014376	AAAAC	2	10	125144	125153	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014376	AAAAT	2	10	163705	163714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014376	TTTTC	2	10	168473	168482	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014376	CCTTC	2	10	197664	197673	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_014376	TCGTG	2	10	197712	197721	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014376	GGGAG	2	10	199663	199672	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014376	CCGTA	2	10	200764	200773	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_014376	GTTTT	2	10	203824	203833	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014376	TAATT	2	10	207464	207473	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014376	TTATA	2	10	207543	207552	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014376	TCATT	2	10	210809	210818	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014376	TAATA	2	10	210827	210836	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014376	TTAAA	2	10	212373	212382	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014376	TATGC	2	10	212529	212538	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014376	TTTTC	2	10	217851	217860	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014376	TAATA	2	10	220502	220511	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014376	CAGAG	2	10	221361	221370	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014376	AAAGG	2	10	232610	232619	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014376	TTATG	2	10	239406	239415	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014376	ATATT	2	10	239517	239526	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014376	AATAA	2	10	239584	239593	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014376	TATAA	2	10	271981	271990	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014376	TTGAA	2	10	272042	272051	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014376	TGCAA	2	10	278456	278465	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014376	AGGAA	2	10	279711	279720	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014376	TACTT	2	10	287556	287565	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014376	AGAAT	2	10	296090	296099	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014376	TTATA	2	10	299861	299870	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014376	GAAAG	2	10	318724	318733	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014376	CCAAG	2	10	319439	319448	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_014376	CCGAG	2	10	320034	320043	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_014376	TACCA	2	10	320089	320098	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014376	ATTTT	2	10	327870	327879	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014376	ATAAA	2	10	343652	343661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014376	ACTAT	2	10	350331	350340	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014376	ATTCG	2	10	350535	350544	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014376	TATTT	2	10	351166	351175	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014376	TTTTG	2	10	363149	363158	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014376	TGATA	2	10	368736	368745	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014376	AAAAG	2	10	368756	368765	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014376	CTTTT	2	10	394746	394755	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014376	TGGAC	2	10	394992	395001	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014376	AGCAA	2	10	397186	397195	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014376	CCTTC	2	10	398552	398561	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_014376	TCGTG	2	10	398600	398609	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014376	GGGAG	2	10	400418	400427	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014376	CCGTA	2	10	401519	401528	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_014376	AGCTA	2	10	417011	417020	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014376	GGAAG	2	10	418274	418283	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014376	AGGAG	2	10	421389	421398	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014376	CTTTT	2	10	425217	425226	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014376	TTGGT	2	10	433818	433827	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014376	TTTTG	2	10	447805	447814	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014376	TTGCA	2	10	450819	450828	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014376	ACAGG	2	10	450878	450887	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014376	TTATA	2	10	465262	465271	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014376	CTTTT	2	10	484717	484726	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014376	AAAAG	2	10	499409	499418	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014376	AAAGG	2	10	503923	503932	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014376	GGACC	2	10	509568	509577	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_014376	AGGAA	2	10	526531	526540	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014376	TTTAA	3	15	530527	530541	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014376	GAAAG	2	10	542715	542724	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014376	GAAAG	2	10	547334	547343	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014376	CTTAT	2	10	549468	549477	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014376	CTTTT	2	10	549554	549563	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014376	TCTTA	2	10	549819	549828	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014376	GACTT	2	10	552805	552814	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014376	ATCAT	2	10	570949	570958	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014376	GTAAA	2	10	572423	572432	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014376	ATCAC	2	10	585031	585040	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_014376	TATAA	2	10	595826	595835	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014376	AAAAC	2	10	603980	603989	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014376	TTGTA	2	10	604745	604754	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014376	CGCTC	2	10	606498	606507	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_014376	AGATG	2	10	616366	616375	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014376	TAGCT	2	10	617155	617164	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014376	TGATG	2	10	626429	626438	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014376	GATAA	2	10	629515	629524	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014376	TAACA	2	10	637248	637257	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014376	ACTTA	2	10	654612	654621	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014376	TGTCT	2	10	670149	670158	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014376	ATAGA	2	10	684663	684672	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014376	TATAG	2	10	686308	686317	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014376	CCTTC	2	10	705328	705337	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_014376	TCGTG	2	10	705376	705385	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_014376	GGGAG	2	10	707175	707184	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014376	CCGTA	2	10	708276	708285	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_014376	GGTGC	2	10	722110	722119	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014376	ATAAC	2	10	723117	723126	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014376	AGGGG	2	10	732920	732929	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014376	GGGAA	2	10	738433	738442	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014376	TGGGT	2	10	743104	743113	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014376	AGGGA	2	10	750843	750852	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014376	GAGAG	2	10	759125	759134	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014376	ATATC	2	10	760740	760749	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014376	AGATA	2	10	764433	764442	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014376	TGATG	2	10	768851	768860	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014376	AGAAC	2	10	768985	768994	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014376	CTTTT	2	10	775458	775467	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014376	ATAAA	2	10	780185	780194	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014376	TGATC	2	10	787489	787498	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014376	ATATA	2	10	791469	791478	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014376	AATAC	2	10	792938	792947	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014376	AGCAA	2	10	794679	794688	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014376	CCTTC	2	10	796044	796053	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
121	NC_014376	TCGTG	2	10	796092	796101	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014376	GGGAG	2	10	797887	797896	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014376	CCGTA	2	10	798988	798997	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_014376	TTATA	2	10	801827	801836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014376	ATATA	2	10	802745	802754	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014376	ATTGA	2	10	808447	808456	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014376	CAATA	2	10	813005	813014	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014376	TGGTA	2	10	815351	815360	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014376	GAAAA	2	10	823943	823952	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014376	AATTT	2	10	832989	832998	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014376	TTATT	2	10	835147	835156	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014376	AAAAT	2	10	837427	837436	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014376	TTAAG	2	10	845966	845975	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014376	CTTTT	2	10	857288	857297	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014376	TATGA	2	10	863997	864006	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014376	TGCAA	2	10	867073	867082	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014376	CACTA	2	10	876128	876137	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_014376	CAGGA	2	10	876442	876451	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014376	ACGTA	2	10	876469	876478	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014376	AGGAC	2	10	879894	879903	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014376	TAAAA	2	10	900260	900269	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014376	GGACC	2	10	901424	901433	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_014376	ATAGA	2	10	905519	905528	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014376	AGGAC	2	10	905859	905868	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014376	GAAAG	2	10	917402	917411	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014376	TCCCT	2	10	920661	920670	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
147	NC_014376	ATGGA	2	10	920950	920959	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_014376	ATCCT	2	10	1904084	1904093	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
285	NC_014376	TGATC	2	10	1906178	1906187	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_014376	ATACA	2	10	3352677	3352686	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

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