MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium saccharolyticum WM1 chromosome

Total Repeats: 14102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014376	GCT	2	6	303832	303837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_014376	T	6	6	303896	303901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014376	ATTC	2	8	304673	304680	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_014376	AAT	2	6	304724	304729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_014376	TAGT	2	8	304736	304743	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_014376	ATGA	2	8	304763	304770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_014376	TCC	2	6	307166	307171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_014376	A	6	6	307180	307185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_014376	CTA	2	6	307233	307238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_014376	TTG	2	6	307568	307573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014376	CCTA	2	8	307577	307584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_014376	CAA	2	6	307609	307614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_014376	TGT	2	6	307615	307620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_014376	TCCT	2	8	307968	307975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_014376	CAT	2	6	307989	307994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_014376	AT	3	6	307999	308004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014376	TAC	2	6	308066	308071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_014376	GA	3	6	308079	308084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_014376	GCG	2	6	308333	308338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_014376	A	6	6	308897	308902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_014376	CCT	2	6	308903	308908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_014376	CCT	2	6	311201	311206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_014376	TCC	2	6	315730	315735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_014376	A	6	6	316169	316174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_014376	CCT	2	6	316175	316180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_014376	TAA	2	6	316229	316234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014376	CCT	2	6	316299	316304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_014376	A	6	6	316350	316355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014376	T	6	6	316376	316381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014376	TCT	2	6	316489	316494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_014376	CCT	2	6	316523	316528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_014376	A	6	6	316588	316593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_014376	CAA	2	6	316628	316633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_014376	CAA	2	6	316646	316651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_014376	GAA	2	6	316652	316657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_014376	A	6	6	316676	316681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014376	GCAA	2	8	316685	316692	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_014376	AAC	2	6	316706	316711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_014376	CAA	2	6	316729	316734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_014376	C	6	6	316767	316772	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1041	NC_014376	A	7	7	318443	318449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_014376	CGG	2	6	318460	318465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_014376	GTC	2	6	318513	318518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_014376	CAT	3	9	318521	318529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_014376	GGT	2	6	318561	318566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_014376	TCG	2	6	318571	318576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_014376	ACTT	2	8	318579	318586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_014376	GCG	2	6	318627	318632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_014376	CGG	2	6	318677	318682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_014376	GAAAG	2	10	318724	318733	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_014376	TTG	2	6	318763	318768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014376	TGG	2	6	318776	318781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_014376	TTTC	2	8	318884	318891	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_014376	TGG	2	6	318917	318922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_014376	ACC	2	6	318933	318938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_014376	TA	3	6	318989	318994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_014376	GGC	2	6	319098	319103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_014376	ATA	2	6	319112	319117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_014376	ATG	2	6	319125	319130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014376	GCC	2	6	319140	319145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_014376	CAA	2	6	319202	319207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_014376	ATG	2	6	319237	319242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_014376	TCA	2	6	319288	319293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_014376	T	6	6	319395	319400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014376	CCAAG	2	10	319439	319448	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1066	NC_014376	TCA	2	6	319480	319485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_014376	TTC	2	6	319539	319544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_014376	GCC	2	6	319800	319805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_014376	ACC	2	6	319816	319821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_014376	CAG	2	6	319900	319905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_014376	AAG	2	6	319953	319958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_014376	GTT	2	6	319980	319985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_014376	CCGAG	2	10	320034	320043	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1075	NC_014376	T	6	6	320077	320082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_014376	TACCA	2	10	320089	320098	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1077	NC_014376	GGT	2	6	320237	320242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_014376	AGAA	2	8	320260	320267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1082	NC_014376	CCT	2	6	321673	321678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_014376	TTG	2	6	322126	322131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1085	NC_014376	AT	4	8	322195	322202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_014376	GCC	2	6	322257	322262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_014376	AT	3	6	322329	322334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014376	TCC	2	6	323898	323903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_014376	A	6	6	323923	323928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_014376	T	6	6	323938	323943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_014376	CCT	2	6	323974	323979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1094	NC_014376	TTC	2	6	324112	324117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_014376	AT	3	6	324142	324147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_014376	ATA	2	6	324155	324160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_014376	TA	3	6	327806	327811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_014376	ATTTT	2	10	327870	327879	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_014376	T	6	6	327909	327914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_014376	TCC	2	6	329083	329088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_014376	A	6	6	329106	329111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_014376	TA	3	6	329135	329140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014376	TAA	2	6	329230	329235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_014376	GATG	2	8	329270	329277	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014376	AAGA	2	8	329306	329313	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_014376	GAA	2	6	329323	329328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014376	TGA	2	6	329355	329360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_014376	A	6	6	329461	329466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_014376	ATA	2	6	330044	330049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_014376	T	6	6	330074	330079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_014376	C	6	6	334042	334047	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1113	NC_014376	A	6	6	334104	334109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014376	TCC	2	6	334142	334147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_014376	A	7	7	334164	334170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014376	ACT	2	6	334953	334958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_014376	T	6	6	335033	335038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_014376	AAG	2	6	335795	335800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014376	TGA	2	6	335885	335890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014376	CCT	2	6	336120	336125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_014376	AGT	2	6	336176	336181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014376	CTT	2	6	336983	336988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_014376	CCT	2	6	337251	337256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_014376	TTA	2	6	337553	337558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_014376	CCG	2	6	337564	337569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_014376	GAT	2	6	337570	337575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014376	TA	3	6	339755	339760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014376	A	7	7	339825	339831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014376	TAT	2	6	339864	339869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014376	AGTA	2	8	339881	339888	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_014376	AGG	2	6	339898	339903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_014376	AGG	2	6	340123	340128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_014376	CCT	2	6	340146	340151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_014376	T	7	7	340153	340159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_014376	CT	3	6	340260	340265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_014376	TCC	2	6	341654	341659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_014376	TGTC	2	8	341670	341677	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1138	NC_014376	GCA	2	6	341699	341704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1263	NC_014376	TTTC	2	8	385776	385783	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1272	NC_014376	CGGC	2	8	390316	390323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1275	NC_014376	ACA	2	6	393710	393715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1414	NC_014376	ACA	2	6	406796	406801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1415	NC_014376	CAGG	2	8	406887	406894	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1416	NC_014376	A	6	6	406925	406930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_014376	AGG	2	6	412911	412916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1419	NC_014376	TAA	2	6	413842	413847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_014376	ATA	2	6	414363	414368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1422	NC_014376	TAC	2	6	414427	414432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1425	NC_014376	AAG	2	6	415282	415287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1427	NC_014376	T	7	7	416941	416947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_014376	A	6	6	416948	416953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1430	NC_014376	AGCTA	2	10	417011	417020	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1441	NC_014376	ATA	2	6	419811	419816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_014376	AAG	2	6	419829	419834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1457	NC_014376	CCG	2	6	424110	424115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1459	NC_014376	TGA	2	6	424160	424165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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