MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014329	TTATC	2	10	14085	14094	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014329	ACGTA	2	10	14248	14257	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014329	CAGTA	2	10	14631	14640	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014329	TAGCG	2	10	18330	18339	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014329	CACAT	2	10	39588	39597	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_014329	TTGGA	2	10	52672	52681	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014329	TTGAT	2	10	52707	52716	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014329	TGCAC	2	10	52801	52810	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014329	TCTGT	2	10	64665	64674	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014329	CATGT	2	10	71818	71827	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014329	TAATT	2	10	76515	76524	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014329	GATCG	2	10	90051	90060	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014329	AACAA	2	10	93624	93633	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014329	TGCAC	2	10	104224	104233	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014329	TGTTT	2	10	120902	120911	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014329	TTAAG	2	10	130900	130909	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014329	AGACG	2	10	135430	135439	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014329	AAAAC	2	10	144894	144903	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014329	GTACC	2	10	155798	155807	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_014329	GCATA	2	10	163225	163234	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014329	TGTGC	2	10	164448	164457	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014329	GGGAC	2	10	171484	171493	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014329	CACTT	2	10	171664	171673	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_014329	TTAAG	2	10	184488	184497	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014329	AGGTG	2	10	186359	186368	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014329	TTGCA	2	10	186692	186701	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014329	GAAAA	2	10	224803	224812	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014329	CGAGA	2	10	225443	225452	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014329	CAAAA	2	10	229068	229077	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014329	TGGGG	2	10	256344	256353	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014329	ATTAG	2	10	305512	305521	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014329	TGCGA	2	10	310701	310710	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014329	TGTTC	2	10	312333	312342	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014329	AGCGG	2	10	313533	313542	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014329	TGGGG	2	10	321223	321232	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014329	TTGTG	2	10	322038	322047	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014329	CTTGC	2	10	355612	355621	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_014329	AGGGG	2	10	364928	364937	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014329	TTTGG	2	10	379311	379320	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014329	CGAGC	2	10	399802	399811	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_014329	GCGGA	2	10	403250	403259	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014329	GGGTG	2	10	404277	404286	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014329	AGGAA	2	10	405609	405618	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014329	GATGT	2	10	447550	447559	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014329	GGTGG	2	10	451436	451445	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014329	GCATC	2	10	452719	452728	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014329	CGCAA	2	10	452899	452908	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_014329	TGATG	2	10	460293	460302	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014329	TGCCT	2	10	468643	468652	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_014329	AGGGG	2	10	500870	500879	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014329	CTTCT	2	10	511933	511942	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_014329	TGTGT	2	10	522945	522954	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014329	TTCAA	2	10	533420	533429	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014329	CTTGG	2	10	575711	575720	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014329	AGCTC	2	10	583917	583926	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_014329	ATATC	2	10	584244	584253	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014329	GACTG	2	10	584303	584312	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014329	TTAGG	2	10	588631	588640	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014329	CGCTA	2	10	597425	597434	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_014329	TTGTG	2	10	618828	618837	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014329	TGTGG	2	10	618907	618916	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014329	TCGTG	2	10	620136	620145	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014329	CGTCA	2	10	620472	620481	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_014329	GTGTT	2	10	620754	620763	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014329	TGTGT	2	10	620899	620908	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014329	GGGAG	2	10	621557	621566	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014329	TGACA	2	10	624143	624152	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014329	TGTGT	2	10	624158	624167	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014329	CGTCT	2	10	641611	641620	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_014329	GTCCT	2	10	643095	643104	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_014329	AAAGG	2	10	645132	645141	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014329	TTTCA	2	10	666170	666179	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014329	GTTTT	2	10	688910	688919	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014329	TGAAT	2	10	719927	719936	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014329	GGGAA	2	10	731649	731658	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014329	GCGAC	2	10	775661	775670	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_014329	AACGA	2	10	789866	789875	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014329	GAACA	2	10	791323	791332	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014329	TCTCC	2	10	808760	808769	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
80	NC_014329	GAATC	2	10	816283	816292	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014329	GTTAA	2	10	853734	853743	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014329	TGGTT	2	10	863857	863866	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014329	ATTTT	2	10	873742	873751	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014329	GTAGG	2	10	875215	875224	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014329	GTGTG	2	10	879861	879870	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014329	TTTTG	2	10	896774	896783	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014329	CGCAC	2	10	897207	897216	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
88	NC_014329	CGAAA	2	10	898412	898421	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014329	ATAAA	2	10	915509	915518	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014329	CCCTG	2	10	915556	915565	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_014329	AAGAA	2	10	915570	915579	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014329	TATGT	2	10	925396	925405	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014329	TTTCC	2	10	933474	933483	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_014329	ACTAA	2	10	933638	933647	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014329	AATAA	2	10	942170	942179	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014329	CTCAT	2	10	944268	944277	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_014329	CGTAA	2	10	946775	946784	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014329	TAAAA	2	10	960890	960899	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014329	TACCG	2	10	962205	962214	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_014329	TGATG	2	10	966788	966797	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014329	AGGGG	2	10	969060	969069	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014329	TCTAG	2	10	974987	974996	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014329	AGAGA	2	10	990033	990042	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014329	GAACA	2	10	996961	996970	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014329	AGCAC	2	10	1003468	1003477	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_014329	GGGGA	2	10	1008459	1008468	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014329	ATTCA	2	10	1024943	1024952	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014329	TTGTG	2	10	1029861	1029870	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014329	TGTGG	2	10	1029940	1029949	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014329	TCGTG	2	10	1031169	1031178	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014329	CGTCA	2	10	1031505	1031514	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_014329	GTGTT	2	10	1031787	1031796	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014329	TGTGT	2	10	1031932	1031941	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014329	GGGAG	2	10	1032590	1032599	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014329	TGACA	2	10	1035177	1035186	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014329	TGTGT	2	10	1035192	1035201	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014329	TTTTG	2	10	1049639	1049648	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014329	AAAGC	2	10	1057771	1057780	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014329	TTGAG	2	10	1072466	1072475	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014329	TTTGC	2	10	1080786	1080795	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014329	CGTAA	2	10	1083905	1083914	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014329	GCAGC	2	10	1102313	1102322	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_014329	CTTTA	2	10	1106285	1106294	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014329	TAACG	2	10	1126468	1126477	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014329	CTTAC	2	10	1129623	1129632	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_014329	CGGGG	2	10	1135324	1135333	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014329	ACAAT	2	10	1136966	1136975	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014329	CAAAA	2	10	1154538	1154547	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014329	CCCGG	2	10	1154786	1154795	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
130	NC_014329	TAAAG	2	10	1163631	1163640	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014329	CTGAA	2	10	1252229	1252238	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014329	TGCGC	2	10	1252518	1252527	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_014329	ATTCC	2	10	1255378	1255387	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_014329	TCAGG	2	10	1273964	1273973	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014329	TGCCA	2	10	1276517	1276526	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_014329	CTTAA	2	10	1277879	1277888	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014329	GCTTA	2	10	1286574	1286583	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014329	ATCGT	2	10	1288835	1288844	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014329	CTTAC	2	10	1299325	1299334	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_014329	TCCTA	2	10	1301681	1301690	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_014329	CATTC	2	10	1305015	1305024	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_014329	TTTCA	2	10	1372877	1372886	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014329	CTTTT	2	10	1384954	1384963	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014329	AAGAA	2	10	1385143	1385152	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014329	GAACA	2	10	1388040	1388049	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014329	ACGGT	2	10	1405287	1405296	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014329	CCCGC	2	10	1407864	1407873	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
148	NC_014329	CTGGC	2	10	1424251	1424260	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_014329	AAAAG	2	10	1442068	1442077	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_014329	AAGGC	2	10	1611952	1611961	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
164	NC_014329	ATATA	2	10	1690064	1690073	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_014329	AACGA	2	10	1709326	1709335	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
168	NC_014329	TTAGC	2	10	1715501	1715510	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
169	NC_014329	ACACA	2	10	1718211	1718220	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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182	NC_014329	CAACA	2	10	1858814	1858823	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
183	NC_014329	TGACG	2	10	1859097	1859106	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
184	NC_014329	CACGA	2	10	1859433	1859442	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
185	NC_014329	CAACA	2	10	1861163	1861172	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
186	NC_014329	ACCCC	2	10	1864381	1864390	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
187	NC_014329	ACAAA	2	10	1868813	1868822	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
188	NC_014329	CTAAC	2	10	1879404	1879413	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
189	NC_014329	AAAAG	2	10	1879424	1879433	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_014329	TCCCC	2	10	1922462	1922471	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
192	NC_014329	TAACC	2	10	1951000	1951009	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
193	NC_014329	CCTCC	2	10	1976500	1976509	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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216	NC_014329	GACGC	2	10	2246253	2246262	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
217	NC_014329	ATGCA	2	10	2248715	2248724	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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225	NC_014329	AGAAA	2	10	2324017	2324026	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
226	NC_014329	ACCTC	2	10	2327613	2327622	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.