MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 5286

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014329	TTTTAT	2	12	1137052	1137063	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_014329	A	6	6	1137064	1137069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_014329	AGT	2	6	1137078	1137083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_014329	CAT	2	6	1138579	1138584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_014329	TAT	2	6	1138597	1138602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_014329	TTA	2	6	1138639	1138644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_014329	GTC	2	6	1138649	1138654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_014329	CT	3	6	1138690	1138695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2509	NC_014329	T	6	6	1138735	1138740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_014329	GTTT	2	8	1138794	1138801	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_014329	GCA	2	6	1140058	1140063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_014329	ATT	2	6	1140774	1140779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_014329	TC	3	6	1140821	1140826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2514	NC_014329	GGC	2	6	1140848	1140853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_014329	GTAT	2	8	1144476	1144483	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_014329	TG	3	6	1144484	1144489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_014329	TCA	2	6	1145024	1145029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_014329	TTA	2	6	1146339	1146344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_014329	AGA	3	9	1146384	1146392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_014329	AAAG	2	8	1149404	1149411	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_014329	TACC	2	8	1150853	1150860	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2522	NC_014329	AGAAAA	2	12	1150913	1150924	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_014329	TCTTTT	2	12	1150934	1150945	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2524	NC_014329	TGT	2	6	1151944	1151949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_014329	CAT	2	6	1154499	1154504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_014329	TGT	2	6	1154507	1154512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_014329	CAAAA	2	10	1154538	1154547	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2528	NC_014329	CATT	2	8	1154582	1154589	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2529	NC_014329	AACA	2	8	1154624	1154631	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2530	NC_014329	CTAT	2	8	1154726	1154733	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2531	NC_014329	CCCGG	2	10	1154786	1154795	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2532	NC_014329	CTA	2	6	1154837	1154842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_014329	C	6	6	1154863	1154868	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2534	NC_014329	GGC	2	6	1154986	1154991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_014329	GC	3	6	1155228	1155233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2536	NC_014329	TTGG	2	8	1155238	1155245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_014329	TGC	2	6	1155285	1155290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_014329	CCA	2	6	1155298	1155303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2539	NC_014329	GAT	2	6	1155343	1155348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_014329	ATA	2	6	1155714	1155719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_014329	CGA	2	6	1156709	1156714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_014329	TCG	2	6	1159333	1159338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_014329	AAG	2	6	1163472	1163477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_014329	ATC	2	6	1163543	1163548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_014329	TCA	2	6	1163581	1163586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_014329	TG	3	6	1163596	1163601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_014329	TAAAG	2	10	1163631	1163640	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_014329	T	7	7	1163653	1163659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_014329	TCT	2	6	1164391	1164396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_014329	ATTT	2	8	1164405	1164412	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_014329	T	7	7	1165045	1165051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_014329	CAT	2	6	1166726	1166731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_014329	AAGA	2	8	1169572	1169579	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_014329	GATT	2	8	1169621	1169628	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_014329	AGG	2	6	1171484	1171489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_014329	AAC	2	6	1171507	1171512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_014329	CTT	2	6	1171546	1171551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_014329	ATT	2	6	1171800	1171805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_014329	CCCA	2	8	1171847	1171854	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2560	NC_014329	CCG	2	6	1171898	1171903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2561	NC_014329	CCTT	2	8	1171926	1171933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2562	NC_014329	GTAT	2	8	1171967	1171974	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_014329	GAC	3	9	1172747	1172755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_014329	GCT	2	6	1172766	1172771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_014329	CAG	2	6	1172794	1172799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_014329	AGA	2	6	1172808	1172813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_014329	GC	3	6	1175656	1175661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2568	NC_014329	AGT	2	6	1176385	1176390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_014329	TACC	2	8	1178876	1178883	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2570	NC_014329	ACT	2	6	1178890	1178895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_014329	T	6	6	1178895	1178900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_014329	A	7	7	1178913	1178919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_014329	TCC	2	6	1178934	1178939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2574	NC_014329	CAGCCA	2	12	1178955	1178966	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2575	NC_014329	GGT	2	6	1178996	1179001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_014329	TTA	2	6	1179125	1179130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_014329	TAC	2	6	1179162	1179167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_014329	TGG	2	6	1179249	1179254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_014329	CCCA	2	8	1180493	1180500	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2580	NC_014329	TAAT	2	8	1180593	1180600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_014329	AT	3	6	1180599	1180604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_014329	CAA	2	6	1180630	1180635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_014329	TAAT	2	8	1180714	1180721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_014329	AGA	2	6	1182894	1182899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_014329	TTA	2	6	1182921	1182926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2587	NC_014329	ACC	2	6	1182947	1182952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2588	NC_014329	TCT	2	6	1182983	1182988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_014329	CGG	2	6	1184681	1184686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2591	NC_014329	CTT	2	6	1191298	1191303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_014329	TTC	2	6	1191317	1191322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_014329	ATTC	2	8	1191384	1191391	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2594	NC_014329	AC	3	6	1191403	1191408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2595	NC_014329	AACC	2	8	1191435	1191442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2596	NC_014329	ATC	2	6	1191458	1191463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_014329	TAA	2	6	1191528	1191533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_014329	TTC	2	6	1191534	1191539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_014329	CCA	2	6	1191544	1191549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2600	NC_014329	GTA	2	6	1196327	1196332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_014329	AAGG	2	8	1196337	1196344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_014329	T	6	6	1196387	1196392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_014329	TTA	2	6	1196402	1196407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_014329	TCC	2	6	1197385	1197390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2605	NC_014329	TCA	2	6	1197420	1197425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_014329	T	6	6	1197480	1197485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_014329	CTT	2	6	1197567	1197572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_014329	ATTA	2	8	1197628	1197635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_014329	GAA	2	6	1197651	1197656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_014329	CTTT	2	8	1197690	1197697	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2611	NC_014329	CAAA	2	8	1197718	1197725	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2612	NC_014329	GGAC	2	8	1197743	1197750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2613	NC_014329	TCA	2	6	1199856	1199861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_014329	TCA	2	6	1201048	1201053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_014329	AAT	2	6	1201145	1201150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_014329	GTAG	2	8	1201157	1201164	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_014329	TGAA	2	8	1201177	1201184	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_014329	CAGA	2	8	1204548	1204555	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2619	NC_014329	CAC	2	6	1204911	1204916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2620	NC_014329	AAGCTC	2	12	1207771	1207782	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2621	NC_014329	ATG	2	6	1207817	1207822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_014329	CTTT	2	8	1207829	1207836	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2623	NC_014329	ACT	2	6	1207861	1207866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_014329	ATG	2	6	1208768	1208773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_014329	AGA	2	6	1210130	1210135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_014329	ATC	2	6	1211192	1211197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_014329	GAA	2	6	1211202	1211207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_014329	T	6	6	1211307	1211312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_014329	ACC	2	6	1211339	1211344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2630	NC_014329	TGT	2	6	1211376	1211381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_014329	CA	3	6	1211410	1211415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2632	NC_014329	GGA	2	6	1211440	1211445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_014329	TTG	2	6	1211473	1211478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_014329	AGCT	2	8	1212595	1212602	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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