MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 20411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014328	GAG	2	6	135045	135050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_014328	GACC	2	8	135079	135086	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_014328	GTT	2	6	135099	135104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_014328	AAGAT	2	10	135180	135189	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_014328	GAA	2	6	135220	135225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_014328	GAG	2	6	135229	135234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_014328	CTGA	2	8	135270	135277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_014328	GAAA	2	8	135312	135319	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_014328	A	7	7	135317	135323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_014328	AT	3	6	135375	135380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014328	GAG	2	6	135424	135429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_014328	GAT	2	6	135503	135508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_014328	TGG	2	6	135513	135518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_014328	A	8	8	135628	135635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014328	T	7	7	135658	135664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014328	TAATT	2	10	135669	135678	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014328	TGA	2	6	135684	135689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014328	GA	3	6	135749	135754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_014328	AAG	2	6	135809	135814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_014328	TAA	2	6	135820	135825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_014328	TTA	2	6	135874	135879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_014328	AGC	2	6	136720	136725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_014328	T	6	6	136729	136734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_014328	A	7	7	136785	136791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_014328	CTT	2	6	136918	136923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_014328	T	6	6	136922	136927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014328	GTA	2	6	136953	136958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014328	ATT	3	9	136961	136969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014328	AAAGA	2	10	136983	136992	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014328	TAC	2	6	137018	137023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_014328	ATC	2	6	137072	137077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_014328	AAG	2	6	137091	137096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_014328	ATAA	2	8	137101	137108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_014328	TTA	2	6	137183	137188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_014328	T	6	6	137232	137237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_014328	GTA	2	6	137270	137275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014328	GTT	2	6	137320	137325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_014328	AAG	2	6	137344	137349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_014328	GAG	2	6	137360	137365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_014328	TA	3	6	137816	137821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_014328	TTC	2	6	137859	137864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_014328	A	6	6	137898	137903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_014328	GT	3	6	137907	137912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_014328	TAAA	2	8	137923	137930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_014328	CCT	2	6	139816	139821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_014328	TTGG	2	8	139843	139850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_014328	TTTA	2	8	139851	139858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_014328	TA	3	6	139857	139862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_014328	TATATT	2	12	139864	139875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_014328	AT	3	6	139901	139906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_014328	CTA	2	6	139931	139936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1053	NC_014328	TA	3	6	139987	139992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_014328	T	6	6	140019	140024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_014328	TAA	2	6	140072	140077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014328	AGT	2	6	140090	140095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1058	NC_014328	GGA	2	6	141759	141764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_014328	ATTA	2	8	142469	142476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014328	ATA	2	6	142496	142501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_014328	TAA	2	6	142515	142520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014328	ATT	2	6	142549	142554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_014328	AAAT	2	8	142559	142566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014328	T	6	6	145039	145044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014328	CCT	2	6	145098	145103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_014328	A	6	6	145112	145117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_014328	TTTC	2	8	145144	145151	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_014328	AGG	2	6	145228	145233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_014328	AGG	2	6	145424	145429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014328	TA	3	6	145455	145460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_014328	AAT	2	6	145500	145505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_014328	ATAG	2	8	145510	145517	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_014328	TAAA	2	8	145523	145530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_014328	TAGT	2	8	147211	147218	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_014328	TATT	2	8	147226	147233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_014328	ATTTT	2	10	147255	147264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_014328	T	6	6	147261	147266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1079	NC_014328	TATTT	2	10	147308	147317	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_014328	AAAT	2	8	147353	147360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_014328	TG	3	6	148135	148140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1083	NC_014328	TTA	2	6	149015	149020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_014328	A	6	6	149061	149066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_014328	TTA	2	6	149077	149082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1087	NC_014328	TA	3	6	149128	149133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014328	T	6	6	149178	149183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_014328	GAG	2	6	149228	149233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_014328	TACA	2	8	150316	150323	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_014328	T	7	7	150361	150367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1094	NC_014328	TAA	2	6	150513	150518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1096	NC_014328	ATT	2	6	150539	150544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_014328	ATA	2	6	150548	150553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_014328	TCT	2	6	150582	150587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_014328	TTAC	2	8	150645	150652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_014328	GAG	2	6	150712	150717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_014328	ATT	2	6	151790	151795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_014328	TTTAAA	2	12	151796	151807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014328	TACA	2	8	151810	151817	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_014328	T	8	8	151856	151863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014328	A	6	6	151921	151926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_014328	ATTATA	2	12	151934	151945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014328	ATA	2	6	151961	151966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_014328	TCC	2	6	152220	152225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_014328	ATA	2	6	152259	152264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_014328	TAC	2	6	152344	152349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_014328	ATA	2	6	152351	152356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_014328	TAA	2	6	152378	152383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014328	AT	3	6	152393	152398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014328	A	6	6	152462	152467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014328	T	6	6	152470	152475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_014328	AG	3	6	152562	152567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_014328	TAA	2	6	152598	152603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014328	AT	3	6	152645	152650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014328	A	7	7	152683	152689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_014328	TTTA	2	8	152696	152703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014328	ATA	2	6	152732	152737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014328	AGTA	2	8	152738	152745	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_014328	AT	3	6	154240	154245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_014328	A	6	6	155669	155674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_014328	TCC	2	6	155675	155680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_014328	A	6	6	156216	156221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014328	ATA	2	6	156237	156242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014328	T	6	6	156248	156253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014328	TAACT	2	10	156257	156266	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1131	NC_014328	AAT	2	6	156287	156292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_014328	ATA	2	6	156311	156316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_014328	ATATTA	2	12	156331	156342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_014328	TAT	2	6	156382	156387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_014328	TAT	2	6	156450	156455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_014328	AT	4	8	156467	156474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_014328	TAA	2	6	156502	156507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_014328	TAGT	2	8	156509	156516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1140	NC_014328	ATA	2	6	156541	156546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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