MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 20411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014328	AAT	2	6	1156308	1156313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_014328	AT	3	6	1156312	1156317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_014328	ATA	2	6	1156348	1156353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_014328	A	6	6	1156361	1156366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_014328	TA	4	8	1156380	1156387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_014328	ATA	2	6	1156542	1156547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_014328	AT	3	6	1156563	1156568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_014328	TTAA	2	8	1156569	1156576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_014328	AAAT	2	8	1156585	1156592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_014328	TA	3	6	1159594	1159599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_014328	ATT	2	6	1159633	1159638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_014328	ATTAT	2	10	1159660	1159669	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_014328	TATT	2	8	1159679	1159686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_014328	T	6	6	1159716	1159721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_014328	T	7	7	1159742	1159748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_014328	TAAA	2	8	1159760	1159767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_014328	TAT	2	6	1159782	1159787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_014328	CTT	2	6	1162162	1162167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_014328	AAG	2	6	1162176	1162181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_014328	TAA	2	6	1162187	1162192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_014328	AGA	3	9	1162258	1162266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_014328	ATTTCT	2	12	1162273	1162284	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5023	NC_014328	GAT	2	6	1162309	1162314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_014328	GAC	2	6	1162368	1162373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_014328	AT	3	6	1162519	1162524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_014328	TTTGA	2	10	1162534	1162543	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_014328	AGA	2	6	1162576	1162581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5030	NC_014328	GAT	2	6	1162625	1162630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_014328	T	7	7	1162640	1162646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_014328	AGA	2	6	1162674	1162679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_014328	TAA	2	6	1162692	1162697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_014328	TAA	2	6	1162707	1162712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_014328	TCC	2	6	1162739	1162744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5036	NC_014328	TTAAA	2	10	1162745	1162754	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_014328	TAT	2	6	1162762	1162767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_014328	AT	3	6	1162772	1162777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_014328	ATA	2	6	1162795	1162800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_014328	AGG	2	6	1162813	1162818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_014328	AT	3	6	1163504	1163509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_014328	A	7	7	1163510	1163516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_014328	ATT	2	6	1163547	1163552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_014328	ATT	2	6	1163583	1163588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_014328	CTT	2	6	1164706	1164711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_014328	ATT	2	6	1164764	1164769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_014328	A	7	7	1164822	1164828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5050	NC_014328	A	8	8	1164857	1164864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_014328	A	6	6	1164880	1164885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_014328	TGG	2	6	1164920	1164925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5054	NC_014328	T	7	7	1165442	1165448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_014328	GGA	2	6	1165468	1165473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5057	NC_014328	AAT	2	6	1168742	1168747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_014328	TAA	2	6	1168783	1168788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_014328	TAT	2	6	1168833	1168838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_014328	TAA	2	6	1170448	1170453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_014328	TTA	2	6	1170486	1170491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_014328	TATGT	2	10	1170492	1170501	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_014328	ATAA	2	8	1170544	1170551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_014328	ATG	2	6	1170579	1170584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_014328	ATTT	2	8	1170646	1170653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_014328	AGA	2	6	1173106	1173111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_014328	TAA	2	6	1173164	1173169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_014328	AGG	2	6	1173173	1173178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5071	NC_014328	TTA	2	6	1174467	1174472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5073	NC_014328	CTT	2	6	1174535	1174540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5076	NC_014328	TAT	2	6	1174688	1174693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_014328	ATAAA	2	10	1175486	1175495	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_014328	ATT	2	6	1177305	1177310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_014328	TTG	2	6	1177319	1177324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5081	NC_014328	TAAT	2	8	1177341	1177348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_014328	T	6	6	1178103	1178108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_014328	ATAA	2	8	1178586	1178593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_014328	AAT	2	6	1178880	1178885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_014328	T	6	6	1180410	1180415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5089	NC_014328	GGA	2	6	1181222	1181227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5092	NC_014328	TA	3	6	1182611	1182616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5094	NC_014328	CCCT	2	8	1184527	1184534	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5095	NC_014328	AATTT	2	10	1184570	1184579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_014328	A	6	6	1184596	1184601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5099	NC_014328	T	7	7	1184711	1184717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_014328	T	7	7	1184729	1184735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_014328	AATA	2	8	1184757	1184764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_014328	ATT	2	6	1184786	1184791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_014328	T	6	6	1184790	1184795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_014328	TAG	2	6	1184803	1184808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5106	NC_014328	ATC	2	6	1186611	1186616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_014328	ATT	2	6	1186660	1186665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_014328	AGT	2	6	1186668	1186673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_014328	AGT	2	6	1188650	1188655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_014328	T	6	6	1188668	1188673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_014328	GAA	2	6	1188691	1188696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_014328	T	7	7	1188714	1188720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_014328	ATT	2	6	1188763	1188768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_014328	ATAA	2	8	1188784	1188791	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_014328	AAG	2	6	1188793	1188798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_014328	AATTT	2	10	1188818	1188827	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_014328	ATA	2	6	1188869	1188874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_014328	TTA	2	6	1188890	1188895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_014328	TCC	2	6	1189513	1189518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_014328	T	6	6	1189538	1189543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_014328	ATT	2	6	1189544	1189549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_014328	GCT	2	6	1189586	1189591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_014328	CAG	2	6	1189599	1189604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_014328	TA	3	6	1189612	1189617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_014328	ATATA	2	10	1189643	1189652	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_014328	ATG	2	6	1189676	1189681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_014328	TTAT	2	8	1189682	1189689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_014328	AGG	2	6	1189750	1189755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_014328	CTT	2	6	1189759	1189764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_014328	ACTA	2	8	1189895	1189902	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5131	NC_014328	CATG	2	8	1190634	1190641	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5132	NC_014328	AT	3	6	1190658	1190663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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