MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cellulomonas flavigena DSM 20109 chromosome

Total Repeats: 212

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014151	CGATGA	2	12	2183	2194	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014151	GCCGAC	2	12	6418	6429	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014151	CGGTCC	2	12	18174	18185	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014151	CGCTCG	2	12	40980	40991	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014151	CGGCCC	2	12	48980	48991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_014151	GCGGGC	2	12	67479	67490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014151	AGCCGG	2	12	80322	80333	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014151	CCGCGC	2	12	92124	92135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_014151	CCCCAC	2	12	96101	96112	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
10	NC_014151	CCCACC	2	12	96114	96125	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
11	NC_014151	ACGGGG	2	12	109680	109691	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014151	TCGCCG	2	12	133219	133230	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014151	CGCCGG	2	12	134582	134593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014151	GCACAC	2	12	144911	144922	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014151	CCGCGG	2	12	165467	165478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014151	CGGGAC	2	12	168755	168766	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014151	GGTGCC	2	12	168789	168800	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014151	GCGAGC	2	12	176339	176350	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014151	TCCGGG	2	12	192450	192461	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014151	GCCGCG	2	12	192462	192473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014151	GCGCCG	2	12	213514	213525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014151	CCCCCA	2	12	223219	223230	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
23	NC_014151	CGCTGC	2	12	241522	241533	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014151	CCCACC	2	12	257081	257092	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
25	NC_014151	GAGGGG	2	12	269535	269546	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014151	CGACGC	2	12	307359	307370	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014151	CGGGGG	2	12	316510	316521	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014151	TGGTCG	2	12	379111	379122	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014151	CGAGGG	2	12	379928	379939	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014151	GACACC	2	12	395333	395344	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014151	GTCGTG	2	12	448705	448716	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014151	AGCCAG	2	12	457652	457663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014151	GGGAGC	2	12	473311	473322	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014151	CCGGGC	2	12	475738	475749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014151	GGTGGA	2	12	476633	476644	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014151	GAGCGG	2	12	481120	481131	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014151	GTGGGG	2	12	493361	493372	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014151	CGGCGC	2	12	500470	500481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014151	CACCTG	2	12	510082	510093	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014151	CCCCAC	2	12	549221	549232	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
41	NC_014151	CCCCGC	2	12	562858	562869	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
42	NC_014151	CCGACC	2	12	563267	563278	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014151	GGTGGG	2	12	569696	569707	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014151	CCGCGG	2	12	588702	588713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014151	CCTCGC	2	12	593322	593333	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_014151	AAGGCG	2	12	667944	667955	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014151	CCCGAC	2	12	717047	717058	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_014151	ACCCGA	2	12	843127	843138	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014151	CCCACC	2	12	844990	845001	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
50	NC_014151	GGTGCG	2	12	855114	855125	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014151	GCGCCC	2	12	892810	892821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_014151	GCCGGG	2	12	895296	895307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014151	CCGCGG	2	12	954654	954665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014151	TGGGGG	2	12	1023748	1023759	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014151	GCGGGG	2	12	1028979	1028990	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014151	CGGGGA	2	12	1043752	1043763	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014151	ACGCGT	2	12	1043901	1043912	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014151	GGGGGT	2	12	1071291	1071302	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014151	GGGGGT	2	12	1071322	1071333	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014151	GGGGGT	2	12	1071384	1071395	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014151	GGACAC	2	12	1129211	1129222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014151	GGCGCG	2	12	1164302	1164313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014151	CCGGCG	2	12	1169786	1169797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014151	ACCGCA	2	12	1189440	1189451	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014151	CGGGCG	2	12	1195832	1195843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014151	CGGGCG	2	12	1201857	1201868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014151	AGTGCA	2	12	1214264	1214275	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014151	CCCTCG	2	12	1215148	1215159	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014151	CGTCGA	2	12	1314716	1314727	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014151	GGCACC	2	12	1316855	1316866	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014151	TGGCCC	2	12	1322973	1322984	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014151	CGGCCA	2	12	1323427	1323438	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014151	CGAGGC	2	12	1382932	1382943	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014151	CGCTGC	2	12	1383036	1383047	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014151	GAGCGG	2	12	1385377	1385388	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014151	CCACGT	2	12	1472075	1472086	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014151	GCCCCG	2	12	1480515	1480526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014151	GACGGG	2	12	1483308	1483319	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014151	CGCGGC	2	12	1498065	1498076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014151	GGGCGT	2	12	1537847	1537858	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014151	GCCCGG	2	12	1614582	1614593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014151	GTGTCC	2	12	1635053	1635064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014151	ACGTCG	2	12	1646242	1646253	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014151	TCGGGC	2	12	1755759	1755770	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014151	CGTCAC	2	12	1781966	1781977	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014151	CCCGCG	2	12	1790891	1790902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_014151	CGCGTC	2	12	1801871	1801882	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014151	CGCGCA	2	12	1808494	1808505	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014151	AGTGCA	2	12	1843755	1843766	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014151	TCGCGC	2	12	1846258	1846269	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014151	CGCGGT	2	12	1846364	1846375	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014151	CGGCCC	2	12	1876186	1876197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_014151	GTGCGC	2	12	1920779	1920790	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014151	TCCAGG	2	12	1934808	1934819	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014151	GACGGG	2	12	1962087	1962098	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014151	GACCCC	2	12	2002744	2002755	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014151	CGACGC	2	12	2016359	2016370	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014151	CGAGGC	2	12	2118385	2118396	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014151	GCGCTC	2	12	2118466	2118477	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014151	AACGGC	2	12	2121464	2121475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014151	GCTCGC	2	12	2121633	2121644	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014151	CGACCC	2	12	2122135	2122146	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_014151	GACCCT	2	12	2123452	2123463	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014151	GCTGCC	2	12	2136600	2136611	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014151	GACGCC	3	18	2136727	2136744	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014151	CTGCCA	2	12	2137075	2137086	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014151	CACCAG	2	12	2137232	2137243	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014151	CTGCCA	2	12	2162394	2162405	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014151	CGACGG	2	12	2172033	2172044	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014151	TGCCCG	2	12	2195239	2195250	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014151	GCCGGT	2	12	2257767	2257778	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014151	GTCCGG	2	12	2309319	2309330	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014151	CCACTG	2	12	2311996	2312007	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014151	CCCCAC	2	12	2413819	2413830	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
115	NC_014151	ACCGCG	2	12	2437137	2437148	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014151	GGTGGG	2	12	2447518	2447529	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014151	CCCGTC	2	12	2466310	2466321	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_014151	GCGCGG	2	12	2488364	2488375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014151	CCGCGG	2	12	2488820	2488831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014151	GGCCGC	4	24	2494880	2494903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_014151	GTGGTC	2	12	2508764	2508775	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014151	GCAGGA	2	12	2519404	2519415	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_014151	CCGACG	2	12	2612928	2612939	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014151	GTGCTC	2	12	2623138	2623149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014151	CCGCGG	2	12	2625203	2625214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014151	CCGACC	2	12	2690009	2690020	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_014151	CCCGGC	2	12	2691721	2691732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_014151	CGGCCG	2	12	2699325	2699336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014151	GAGGTC	2	12	2751152	2751163	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_014151	CACCCC	2	12	2791393	2791404	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
131	NC_014151	TCGACG	2	12	2832314	2832325	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014151	ACGGTG	2	12	2851913	2851924	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_014151	TCGCGG	2	12	2851979	2851990	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014151	GCGCCC	2	12	2938574	2938585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_014151	CCGTCG	2	12	2941358	2941369	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_014151	GCACCC	2	12	2963001	2963012	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_014151	CGCACG	2	12	2986486	2986497	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014151	CGAGCG	2	12	2986749	2986760	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014151	TCGAGC	2	12	2986835	2986846	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014151	AGCGGG	2	12	3000004	3000015	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_014151	CGTCCT	2	12	3002609	3002620	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014151	GCCCCC	2	12	3030549	3030560	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
143	NC_014151	CCGCGA	2	12	3051882	3051893	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014151	AGGACG	2	12	3074790	3074801	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_014151	CGCGAC	2	12	3085597	3085608	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014151	CGGCGA	2	12	3093897	3093908	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_014151	TCCTCG	2	12	3122116	3122127	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014151	CCCGCG	2	12	3146043	3146054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_014151	CGCCCT	2	12	3166331	3166342	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_014151	TCCGGC	2	12	3186976	3186987	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
151	NC_014151	CGGGCC	2	12	3215964	3215975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_014151	CGCAGG	2	12	3217543	3217554	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014151	TCGGGG	2	12	3224238	3224249	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_014151	CGGCGC	2	12	3226017	3226028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_014151	GGGTCC	2	12	3245437	3245448	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_014151	CCGGCA	2	12	3257041	3257052	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
157	NC_014151	GTCCGG	2	12	3283671	3283682	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_014151	GCGGGC	2	12	3347922	3347933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_014151	GGTGCC	2	12	3362557	3362568	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_014151	CACCCT	2	12	3365837	3365848	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_014151	CGGGTC	2	12	3398592	3398603	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_014151	CGGGGC	2	12	3400441	3400452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_014151	CACCGC	2	12	3485114	3485125	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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191	NC_014151	CACACC	2	12	3761726	3761737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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199	NC_014151	CCGGCG	2	12	3875738	3875749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
200	NC_014151	TCGGTG	2	12	3885592	3885603	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
201	NC_014151	CAGTCG	2	12	3920368	3920379	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
202	NC_014151	CAGTCG	2	12	3920386	3920397	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
203	NC_014151	CAGTCG	2	12	3920404	3920415	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
204	NC_014151	CCGGAC	2	12	3959475	3959486	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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212	NC_014151	CGTCGG	2	12	4114810	4114821	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.