MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Riesia pediculicola USDA chromosome

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014109	AAATAG	2	12	4002	4013	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014109	TCTATT	2	12	13628	13639	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014109	TTAAAT	2	12	25175	25186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014109	TTGAAC	2	12	30496	30507	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014109	CAATTT	2	12	36298	36309	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014109	AAAGAC	2	12	53148	53159	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014109	TAAAAT	2	12	55961	55972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014109	ATTTTC	2	12	57281	57292	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014109	ATCTAA	2	12	57992	58003	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014109	GATTTT	2	12	66883	66894	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014109	ATTTTG	2	12	77986	77997	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014109	ATTTAA	2	12	84189	84200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014109	TATCTT	2	12	100755	100766	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014109	TTGATG	2	12	115787	115798	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014109	GGAGTT	2	12	116118	116129	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014109	TGAATT	2	12	140368	140379	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014109	TCTATA	2	12	141130	141141	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014109	TAATCA	2	12	141966	141977	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014109	TTTAAG	2	12	142128	142139	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014109	TGAAAA	2	12	158458	158469	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014109	TAAAAA	2	12	164296	164307	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014109	TTTTAA	2	12	178284	178295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014109	TTTTTA	2	12	179446	179457	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014109	TTCTCT	2	12	187540	187551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014109	AAATTG	2	12	188080	188091	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014109	TAAAAA	2	12	188212	188223	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014109	AAAATC	2	12	210645	210656	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014109	AAAATA	2	12	247538	247549	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014109	TTTAAA	2	12	255359	255370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014109	TTTTTC	2	12	270658	270669	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014109	ATTAAT	2	12	271172	271183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014109	GAACGA	2	12	275941	275952	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014109	ATTTTT	2	12	280305	280316	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014109	ATTATG	2	12	295295	295306	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014109	ATAATT	2	12	303714	303725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014109	AAAGAT	2	12	318231	318242	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014109	CAATTT	2	12	334992	335003	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014109	TTTAAA	2	12	355282	355293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014109	ATTTTT	2	12	370117	370128	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014109	TGTTAA	2	12	370298	370309	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014109	TCAAAT	2	12	372296	372307	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014109	AATTTT	2	12	388395	388406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014109	TAAAAA	2	12	388928	388939	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014109	ATTTTA	2	12	416922	416933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014109	AATAAA	2	12	422527	422538	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014109	AAAGAA	2	12	470699	470710	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014109	TTATTT	2	12	481451	481462	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014109	GAACTT	2	12	492658	492669	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014109	AAAACA	2	12	499369	499380	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014109	TATTTT	2	12	509291	509302	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014109	TAAATT	2	12	518398	518409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014109	ATTTTT	2	12	518656	518667	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014109	ATTTTT	2	12	526955	526966	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014109	TTTTTA	2	12	544992	545003	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014109	TTTTAA	2	12	572527	572538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.