MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Coraliomargarita akajimensis DSM 45221 chromosome

Total Repeats: 303

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014008	CTTTT	2	10	8576	8585	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014008	AGCCT	2	10	9159	9168	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014008	ATGTG	2	10	32417	32426	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014008	TATAT	2	10	89798	89807	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014008	TGGTG	2	10	97300	97309	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014008	CGGAT	2	10	100114	100123	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014008	GTAGC	2	10	107815	107824	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014008	ACATA	2	10	111355	111364	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014008	TTCGT	2	10	128511	128520	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014008	GATCC	2	10	135910	135919	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_014008	GTGAA	2	10	146532	146541	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014008	ATGAC	2	10	173564	173573	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014008	CGCAG	2	10	175659	175668	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014008	ATGAC	2	10	183196	183205	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014008	ATGAC	2	10	183350	183359	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014008	TTCCT	2	10	186699	186708	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014008	CGATG	2	10	192623	192632	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014008	ATGGA	2	10	202354	202363	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014008	CGTTC	2	10	235654	235663	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_014008	CTCGG	2	10	300254	300263	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_014008	GTTTT	2	10	323160	323169	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014008	CTTGA	2	10	343104	343113	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014008	TCCAG	2	10	361303	361312	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_014008	GTTTG	2	10	362459	362468	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014008	TGGAG	2	10	364774	364783	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014008	CGTTC	2	10	368325	368334	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014008	TGGAG	2	10	368732	368741	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014008	ATTCA	2	10	372009	372018	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014008	GGCGC	2	10	372080	372089	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30	NC_014008	GAGCG	2	10	373151	373160	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014008	GGCGC	2	10	377448	377457	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_014008	TTTCT	2	10	378297	378306	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014008	TGGAG	2	10	379618	379627	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014008	CATTT	2	10	384947	384956	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014008	AATTG	2	10	419232	419241	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014008	AGGGG	2	10	425029	425038	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014008	GATTT	2	10	428438	428447	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014008	CAAGG	2	10	450490	450499	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014008	GTGTC	2	10	454414	454423	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014008	CAGCG	2	10	463788	463797	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_014008	TCTTT	2	10	467741	467750	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014008	GAGTA	2	10	470647	470656	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014008	TCGGC	2	10	509804	509813	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_014008	ATTCA	2	10	524107	524116	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014008	GAGCA	2	10	543723	543732	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014008	GTCGC	2	10	543890	543899	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014008	GCGTG	2	10	548400	548409	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014008	TGATG	2	10	549753	549762	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014008	GGTGC	2	10	564365	564374	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014008	TGCTT	2	10	593888	593897	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014008	CAGGG	2	10	646285	646294	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014008	TGCGT	2	10	693919	693928	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014008	TGAGT	2	10	710116	710125	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014008	AACCA	2	10	722820	722829	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014008	CGACG	2	10	724309	724318	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_014008	GGGAA	2	10	729285	729294	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014008	GGATG	2	10	730228	730237	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014008	GGAGT	2	10	733615	733624	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014008	TGTGA	2	10	762409	762418	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014008	CTCAG	2	10	769732	769741	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_014008	ATACA	2	10	774163	774172	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014008	TGAAC	2	10	798127	798136	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014008	AACAG	2	10	806805	806814	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014008	GTAGT	2	10	806933	806942	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014008	CTGAA	2	10	814447	814456	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014008	TGACG	2	10	824609	824618	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014008	ATCAA	2	10	850598	850607	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014008	GCTGT	2	10	872262	872271	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014008	GCATC	2	10	873605	873614	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_014008	GAGCG	2	10	885828	885837	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014008	TCATT	2	10	885881	885890	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014008	GCAAA	2	10	888275	888284	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014008	AGCGA	2	10	891986	891995	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014008	TTGAC	2	10	936381	936390	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014008	TGGGG	2	10	1015938	1015947	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014008	TGCAC	2	10	1030025	1030034	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_014008	TCTTT	2	10	1035169	1035178	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014008	AACTG	2	10	1048777	1048786	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014008	GTTCG	2	10	1059528	1059537	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014008	CATCC	2	10	1072094	1072103	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
81	NC_014008	CTCAG	2	10	1097905	1097914	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_014008	CTGCG	2	10	1103053	1103062	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_014008	GTTTT	2	10	1115648	1115657	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014008	CAAAA	2	10	1116677	1116686	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014008	TTCGG	2	10	1133686	1133695	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014008	AAATC	2	10	1138658	1138667	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014008	TGAAC	2	10	1141074	1141083	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014008	GCTCC	2	10	1165520	1165529	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_014008	CTAAG	2	10	1171805	1171814	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014008	CAAGA	2	10	1173693	1173702	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014008	ACTGA	2	10	1176924	1176933	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014008	CCTAG	2	10	1183014	1183023	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_014008	CAACT	2	10	1183842	1183851	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_014008	ATCAA	2	10	1191028	1191037	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014008	AGCAC	2	10	1200707	1200716	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_014008	CCGCC	2	10	1228283	1228292	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
97	NC_014008	ACTAT	2	10	1234399	1234408	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014008	TCATT	2	10	1256175	1256184	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014008	TCATT	2	10	1257624	1257633	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_014008	TTCAG	2	10	1269127	1269136	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_014008	TCATT	2	10	1272501	1272510	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014008	TCATT	2	10	1273318	1273327	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014008	CAAAC	2	10	1275236	1275245	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_014008	GTGCG	2	10	1275502	1275511	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014008	CCCCT	2	10	1291329	1291338	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
106	NC_014008	CGCAG	2	10	1305683	1305692	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_014008	CTTGA	2	10	1305780	1305789	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014008	GCGAA	2	10	1333947	1333956	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014008	TCAGA	2	10	1336944	1336953	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014008	AGTTT	2	10	1341025	1341034	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014008	CGCAG	2	10	1352141	1352150	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_014008	AAGCT	2	10	1352155	1352164	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014008	CACTT	2	10	1366330	1366339	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_014008	GCTCG	2	10	1388454	1388463	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_014008	TCCTG	2	10	1397135	1397144	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_014008	CAACC	2	10	1412393	1412402	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
117	NC_014008	TCAGA	2	10	1433164	1433173	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_014008	CAAAA	2	10	1437979	1437988	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014008	GAATC	2	10	1492262	1492271	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014008	GCCCC	2	10	1505685	1505694	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
121	NC_014008	CGCCA	2	10	1506481	1506490	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
122	NC_014008	TCGCA	2	10	1525973	1525982	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_014008	CAAAA	2	10	1537909	1537918	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014008	AGCGA	2	10	1556423	1556432	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014008	ATCTT	2	10	1558004	1558013	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014008	CTGAC	2	10	1561696	1561705	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_014008	CACGA	2	10	1561820	1561829	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_014008	GCATG	2	10	1588954	1588963	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014008	CGCTC	2	10	1611135	1611144	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_014008	TCTAC	2	10	1620416	1620425	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_014008	ATAGA	2	10	1695791	1695800	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014008	TTCGC	2	10	1695945	1695954	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_014008	GCTCC	2	10	1695971	1695980	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
134	NC_014008	CTCAA	2	10	1707765	1707774	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_014008	GAGCC	2	10	1723595	1723604	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_014008	CCCCT	2	10	1723627	1723636	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
137	NC_014008	TCAGC	2	10	1723646	1723655	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_014008	CTAGG	2	10	1725088	1725097	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014008	TGGTT	2	10	1727903	1727912	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014008	TCCCC	2	10	1745822	1745831	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
141	NC_014008	GATCT	2	10	1746055	1746064	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_014008	GGCCC	2	10	1749769	1749778	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
143	NC_014008	TAAGT	2	10	1787570	1787579	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_014008	CGAAG	2	10	3336632	3336641	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_014008	GGCGC	2	10	3512642	3512651	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
282	NC_014008	GAATG	2	10	3515332	3515341	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
283	NC_014008	TGTCG	2	10	3517701	3517710	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
284	NC_014008	CTTGG	2	10	3519096	3519105	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
285	NC_014008	GGATC	2	10	3519176	3519185	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
286	NC_014008	CTTGG	2	10	3522290	3522299	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
287	NC_014008	AGGGC	2	10	3537203	3537212	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
288	NC_014008	GGCGA	2	10	3581117	3581126	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
289	NC_014008	TTTGT	2	10	3581468	3581477	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
290	NC_014008	TTGAA	2	10	3597339	3597348	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
291	NC_014008	TTCGC	2	10	3613426	3613435	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
292	NC_014008	AAGGA	2	10	3622168	3622177	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
293	NC_014008	GTTTG	2	10	3635331	3635340	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
294	NC_014008	TAGCG	2	10	3651213	3651222	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
295	NC_014008	TAGTC	2	10	3663855	3663864	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
296	NC_014008	GAGCC	2	10	3694888	3694897	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
297	NC_014008	TTCGC	2	10	3699205	3699214	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
298	NC_014008	ATTCT	2	10	3701669	3701678	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
299	NC_014008	GGAGG	2	10	3702094	3702103	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
300	NC_014008	TGGCT	2	10	3703667	3703676	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
301	NC_014008	GGAGT	2	10	3708138	3708147	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
302	NC_014008	CTTGG	2	10	3709954	3709963	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
303	NC_014008	CGAAA	2	10	3740278	3740287	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.