MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Sulcia muelleri DMIN chromosome

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014004	TAA	2	6	8548	8553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014004	AAG	2	6	12083	12088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014004	ATA	2	6	12119	12124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014004	ATT	2	6	12133	12138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014004	ATT	2	6	12169	12174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014004	ATG	2	6	12199	12204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014004	AGT	2	6	14325	14330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014004	TTA	2	6	14361	14366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014004	TAA	2	6	14369	14374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014004	TAA	2	6	14377	14382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014004	TTA	2	6	21803	21808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014004	TCG	2	6	22647	22652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014004	CTA	2	6	22694	22699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014004	TTA	2	6	35059	35064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014004	GAT	2	6	36379	36384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014004	ATT	2	6	36470	36475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014004	TAA	2	6	36481	36486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014004	ATC	2	6	45474	45479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014004	ATA	2	6	45576	45581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014004	GAC	2	6	48245	48250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014004	TAA	2	6	60502	60507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014004	ATT	2	6	60555	60560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014004	TAT	2	6	60566	60571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014004	TAA	2	6	60574	60579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014004	TTA	2	6	60580	60585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014004	GGT	2	6	60645	60650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014004	CTG	2	6	62106	62111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014004	CTA	2	6	62281	62286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014004	TAA	2	6	70774	70779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014004	TAA	2	6	71780	71785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014004	TAT	2	6	71807	71812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014004	TTA	2	6	71813	71818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014004	AAT	2	6	71819	71824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014004	ATA	2	6	71854	71859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014004	TTG	2	6	71913	71918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014004	GCA	2	6	72048	72053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014004	ATA	2	6	72057	72062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014004	ATA	2	6	72165	72170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014004	TAT	2	6	72203	72208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014004	GCA	2	6	72341	72346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014004	GGA	2	6	72366	72371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014004	AAT	2	6	72461	72466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014004	CAG	2	6	72506	72511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014004	AGT	2	6	72587	72592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014004	GAT	2	6	72806	72811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014004	GAG	2	6	72893	72898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014004	GAT	2	6	72971	72976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014004	TAC	2	6	73006	73011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014004	TGC	2	6	73054	73059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014004	GTC	2	6	73066	73071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014004	TTA	3	9	73120	73128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014004	AGT	2	6	73139	73144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014004	TAA	2	6	73156	73161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014004	GAC	2	6	73193	73198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014004	ATC	2	6	73204	73209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014004	TAA	2	6	73477	73482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014004	TAA	2	6	73571	73576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014004	TGA	2	6	73588	73593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014004	TGA	2	6	73596	73601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014004	TCC	2	6	73761	73766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_014004	TAA	2	6	73793	73798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014004	ATA	2	6	73799	73804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014004	TGG	2	6	73821	73826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014004	AAT	2	6	73878	73883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014004	AAT	2	6	73925	73930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014004	AAT	2	6	73952	73957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014004	TTG	2	6	73966	73971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014004	AAT	2	6	73974	73979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014004	TTG	2	6	73988	73993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014004	AAT	2	6	73996	74001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014004	AAT	2	6	74023	74028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014004	AAT	2	6	74055	74060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014004	AAT	2	6	74087	74092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014004	AAT	2	6	74119	74124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014004	TAG	2	6	74259	74264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014004	TAT	2	6	74338	74343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014004	AGA	2	6	74548	74553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014004	ACG	2	6	74608	74613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014004	AAT	2	6	74661	74666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014004	GGA	2	6	74780	74785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014004	GCA	2	6	74888	74893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014004	AGT	2	6	74993	74998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014004	AAC	2	6	75035	75040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014004	AGC	2	6	75127	75132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014004	ATA	2	6	75184	75189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014004	TTA	2	6	75282	75287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014004	TGA	2	6	75465	75470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014004	AGT	2	6	75479	75484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014004	TAT	2	6	75548	75553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014004	AAC	2	6	75606	75611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014004	TAA	2	6	75612	75617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014004	GAT	2	6	75850	75855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014004	AGG	2	6	75897	75902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014004	CGG	2	6	75943	75948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014004	GTA	2	6	76059	76064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014004	GTA	2	6	76153	76158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014004	ACC	2	6	76214	76219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_014004	GTG	2	6	76264	76269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014004	GGT	2	6	76284	76289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014004	GGT	2	6	76428	76433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014004	GAA	2	6	76561	76566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014004	CGT	2	6	76623	76628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014004	CTT	2	6	76816	76821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014004	AGT	2	6	76887	76892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014004	ATA	2	6	76940	76945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014004	CAA	2	6	76978	76983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014004	GTA	3	9	78320	78328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014004	TGC	2	6	78352	78357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014004	TAA	2	6	78381	78386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014004	TTA	2	6	78626	78631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014004	TAA	2	6	78637	78642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014004	TTA	2	6	78643	78648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014004	TAC	2	6	82982	82987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014004	TGG	2	6	83046	83051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014004	TAT	3	9	84648	84656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014004	AGT	2	6	86589	86594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014004	ATT	2	6	94236	94241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014004	ATA	2	6	94698	94703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014004	AAT	2	6	94730	94735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014004	TTA	2	6	94775	94780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014004	GTA	2	6	96198	96203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014004	AAG	2	6	96212	96217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014004	AGT	2	6	96222	96227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014004	ATT	2	6	97547	97552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014004	ATT	2	6	97598	97603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014004	TAA	2	6	98981	98986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014004	ATT	2	6	114455	114460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014004	GCG	2	6	129115	129120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014004	GAT	2	6	143346	143351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014004	CCT	2	6	143369	143374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_014004	TAC	2	6	143400	143405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014004	ATT	2	6	146144	146149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014004	TAA	2	6	146219	146224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014004	TAT	2	6	146225	146230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014004	TAT	2	6	146237	146242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014004	TAA	3	9	146258	146266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014004	ATA	2	6	154943	154948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014004	GCT	2	6	154995	155000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014004	CCA	2	6	155106	155111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_014004	TAT	2	6	161825	161830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014004	ATT	2	6	161853	161858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014004	TTA	2	6	161864	161869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014004	ATT	2	6	161908	161913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014004	TAA	2	6	161952	161957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014004	TAA	2	6	165587	165592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014004	ATA	2	6	165593	165598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014004	ATT	2	6	165603	165608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014004	ATT	2	6	167227	167232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014004	CAT	2	6	167930	167935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014004	TGC	2	6	168031	168036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_014004	AAG	2	6	168157	168162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014004	AGA	2	6	169135	169140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014004	AAT	2	6	169172	169177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014004	TTG	2	6	171641	171646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014004	TAT	2	6	171653	171658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014004	ATT	2	6	171671	171676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014004	ATT	2	6	178229	178234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014004	TAA	2	6	178281	178286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014004	TAC	2	6	178291	178296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_014004	CAC	2	6	178325	178330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_014004	ATA	2	6	178741	178746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014004	ATT	2	6	184225	184230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014004	ATA	2	6	186741	186746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014004	ATA	2	6	186769	186774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014004	TAT	2	6	186808	186813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014004	TAA	3	9	186868	186876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_014004	ATT	2	6	186881	186886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_014004	ATA	2	6	186917	186922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_014004	ATT	3	9	188316	188324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_014004	TAT	2	6	199535	199540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014004	CTG	2	6	199593	199598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_014004	TAC	2	6	205263	205268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_014004	TAC	2	6	205270	205275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_014004	TAC	2	6	205277	205282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_014004	TAC	2	6	205284	205289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_014004	TAC	2	6	205291	205296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_014004	TAC	2	6	205298	205303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_014004	TAC	2	6	205305	205310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_014004	TAC	2	6	205312	205317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_014004	TAC	2	6	205319	205324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_014004	TAC	2	6	205326	205331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_014004	TAC	2	6	205333	205338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_014004	TAC	2	6	205340	205345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_014004	TAC	2	6	205347	205352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_014004	TAA	2	6	208849	208854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_014004	TAA	2	6	209619	209624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_014004	ATA	2	6	209625	209630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_014004	TAA	2	6	209931	209936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_014004	ATT	2	6	215455	215460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_014004	ATT	2	6	217512	217517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_014004	ATT	2	6	223446	223451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_014004	TTA	2	6	226831	226836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_014004	TTA	2	6	227088	227093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_014004	AGT	2	6	227161	227166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
195	NC_014004	ATA	2	6	230081	230086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_014004	ATA	2	6	231534	231539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_014004	TAA	2	6	234556	234561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_014004	TAT	2	6	234598	234603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_014004	TAA	2	6	234617	234622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_014004	AAT	2	6	234665	234670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_014004	TTA	2	6	234671	234676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_014004	ATT	2	6	240291	240296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.