MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridiales genomosp. BVAB3 str. UPII9-5 chromosome

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013895	TATAA	2	10	1562	1571	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013895	CTTAT	2	10	6470	6479	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013895	ACAAA	2	10	9016	9025	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013895	TAACT	2	10	17383	17392	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013895	CTGTG	2	10	21156	21165	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013895	AAAGT	2	10	39885	39894	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013895	CGGTT	2	10	40464	40473	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013895	CCCTA	2	10	55900	55909	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_013895	ATTAT	2	10	57290	57299	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013895	TATAG	2	10	69414	69423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013895	GCAAA	2	10	69529	69538	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013895	AAATA	2	10	73497	73506	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013895	AAAAT	2	10	73633	73642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013895	TAGCA	2	10	100613	100622	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013895	GCTCA	2	10	108735	108744	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_013895	TGGCT	2	10	110197	110206	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013895	TGCGA	2	10	142406	142415	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013895	AAAAT	2	10	152813	152822	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013895	TAATG	2	10	171815	171824	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013895	ATGTG	2	10	181406	181415	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013895	CCGAA	2	10	183941	183950	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_013895	GTGTT	2	10	184847	184856	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013895	CACCT	2	10	184973	184982	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_013895	CAAAG	2	10	198566	198575	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013895	AAGGA	2	10	208870	208879	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013895	TTTGA	2	10	255525	255534	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013895	TCGTG	2	10	256584	256593	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013895	AGGCC	2	10	258834	258843	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_013895	CCGTA	2	10	259083	259092	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_013895	TAAGA	2	10	260229	260238	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013895	CTTTC	2	10	271638	271647	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_013895	ATTTA	2	10	273181	273190	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013895	GTAAA	2	10	277899	277908	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013895	GATGA	2	10	278010	278019	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013895	TAGGC	2	10	290310	290319	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_013895	AATAT	2	10	322325	322334	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013895	TATTT	2	10	326401	326410	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013895	AGATA	2	10	326546	326555	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013895	CTATT	2	10	333645	333654	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013895	GATTT	2	10	411799	411808	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013895	AAATT	2	10	422243	422252	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013895	TTTAT	2	10	435209	435218	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013895	ATTTA	2	10	451765	451774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013895	ATTTT	2	10	464676	464685	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013895	TATAA	2	10	464725	464734	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013895	AAAAC	2	10	464799	464808	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013895	TTTGA	2	10	465372	465381	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013895	TCGTG	2	10	466431	466440	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_013895	AGGCC	2	10	468669	468678	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_013895	CCGTA	2	10	468918	468927	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_013895	TAAGA	2	10	470064	470073	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013895	CTTTT	2	10	490929	490938	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013895	AGGCG	2	10	492679	492688	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_013895	GACTT	2	10	525801	525810	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_013895	TAATT	2	10	532634	532643	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013895	TTCCT	2	10	553488	553497	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_013895	AAAGG	2	10	554895	554904	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013895	TATTT	2	10	569021	569030	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013895	TATAT	2	10	587016	587025	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013895	ACTTC	2	10	592055	592064	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_013895	AAAAT	2	10	594117	594126	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013895	CCGGT	2	10	637780	637789	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_013895	AGGTT	2	10	641333	641342	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013895	AATTC	2	10	671290	671299	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013895	TTCCA	2	10	671441	671450	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_013895	GATCC	2	10	671736	671745	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_013895	ATTTT	2	10	679825	679834	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013895	TAAAA	2	10	682668	682677	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013895	TTACT	2	10	686273	686282	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_013895	ATAAA	2	10	689440	689449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013895	ACGTA	2	10	690845	690854	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013895	ATGAT	2	10	696063	696072	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013895	TTTTG	2	10	699281	699290	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013895	TAATA	2	10	699312	699321	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013895	ATATA	2	10	720781	720790	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013895	AAAAT	2	10	726665	726674	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013895	TCCAT	2	10	769052	769061	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_013895	TATTT	2	10	771072	771081	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013895	ATTTT	2	10	792057	792066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013895	TTGAA	2	10	839665	839674	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013895	TGCAT	2	10	842338	842347	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013895	AATTT	2	10	843536	843545	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013895	ATTGC	2	10	846256	846265	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_013895	TATGA	2	10	872831	872840	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013895	AACAT	2	10	896704	896713	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_013895	AGAGA	2	10	941614	941623	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013895	AAAAT	2	10	964830	964839	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013895	CGTCG	2	10	968751	968760	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_013895	GCTAA	2	10	968854	968863	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_013895	AAACA	2	10	1007012	1007021	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_013895	AACTG	2	10	1011312	1011321	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013895	CTTAT	2	10	1030929	1030938	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013895	AAAAT	2	10	1032384	1032393	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013895	TTTGC	2	10	1051306	1051315	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_013895	AAAAT	2	10	1060818	1060827	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013895	TTTAT	2	10	1070370	1070379	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013895	CGTCA	2	10	1077528	1077537	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_013895	ATTTA	2	10	1079021	1079030	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013895	ATTGG	2	10	1094214	1094223	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013895	GAACT	2	10	1096372	1096381	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_013895	AAAGT	2	10	1096504	1096513	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013895	AATAT	2	10	1104104	1104113	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013895	ATAGG	2	10	1104138	1104147	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013895	GGCAC	2	10	1112741	1112750	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_013895	AAGAT	2	10	1115197	1115206	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013895	AGCAA	2	10	1119359	1119368	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_013895	TTTTA	2	10	1140634	1140643	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013895	GACAT	2	10	1160382	1160391	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_013895	AAAGC	2	10	1160580	1160589	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_013895	TCAAG	2	10	1160677	1160686	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_013895	TTTAA	2	10	1175327	1175336	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013895	TTTTG	2	10	1193160	1193169	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013895	GCTGC	2	10	1207241	1207250	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_013895	AAATC	2	10	1225204	1225213	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_013895	CAGGC	2	10	1241024	1241033	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_013895	GCAAG	2	10	1261696	1261705	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_013895	CTTTC	2	10	1266610	1266619	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_013895	TGCGC	2	10	1266676	1266685	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_013895	TTTCT	2	10	1266713	1266722	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_013895	TTTCA	2	10	1266756	1266765	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_013895	AATTA	2	10	1284089	1284098	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013895	TGAAA	2	10	1294375	1294384	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013895	AAATT	2	10	1296428	1296437	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013895	CACCT	2	10	1298543	1298552	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
125	NC_013895	CAAGG	2	10	1306682	1306691	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_013895	CCAAG	2	10	1324460	1324469	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_013895	TTATA	2	10	1327886	1327895	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013895	ACATT	2	10	1337569	1337578	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_013895	TAGCA	2	10	1338745	1338754	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_013895	TTTTA	2	10	1347767	1347776	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013895	ATTAT	2	10	1372005	1372014	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013895	ACGGC	2	10	1378412	1378421	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_013895	CGCAT	2	10	1397506	1397515	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_013895	TTAGT	2	10	1399650	1399659	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013895	TGTTT	2	10	1406497	1406506	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013895	TTAAA	2	10	1413885	1413894	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013895	ATTTT	2	10	1419069	1419078	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013895	TATAT	2	10	1421686	1421695	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013895	GCTTT	2	10	1436408	1436417	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_013895	AAAGT	2	10	1436487	1436496	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013895	GAAAA	2	10	1462940	1462949	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013895	CGGGC	2	10	1467446	1467455	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
143	NC_013895	GCCCG	2	10	1482721	1482730	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
144	NC_013895	ATTTA	2	10	1483297	1483306	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013895	TCCTC	2	10	1553029	1553038	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
146	NC_013895	TGATT	2	10	1557989	1557998	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013895	AATTA	2	10	1558349	1558358	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_013895	TTATC	2	10	1618629	1618638	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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174	NC_013895	TTAAT	2	10	1809704	1809713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.