MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Conexibacter woesei DSM 14684 chromosome

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013739	CTTCGG	2	12	24919	24930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013739	CCGCGA	2	12	188280	188291	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013739	CCCGAA	2	12	282055	282066	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013739	GTCGCG	2	12	339851	339862	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013739	GGCGTG	2	12	349875	349886	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013739	CTCGAC	2	12	350502	350513	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013739	TGCGGG	2	12	354949	354960	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013739	CCGGCC	2	12	422065	422076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013739	ACCGAG	2	12	487429	487440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013739	CGGACG	2	12	493125	493136	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013739	CGGGCA	2	12	514226	514237	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013739	GGGAGC	2	12	525707	525718	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013739	GCCCGC	2	12	546274	546285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_013739	GCGCTC	2	12	577760	577771	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013739	CGCCTG	2	12	585237	585248	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013739	GCGTCG	2	12	611894	611905	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013739	GATCTC	2	12	641454	641465	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013739	CGACAC	2	12	677528	677539	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013739	AGCGCG	2	12	701110	701121	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013739	GGCGCG	2	12	719514	719525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013739	CTTCGA	2	12	722974	722985	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013739	CACCGG	2	12	736919	736930	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013739	AGAGGC	2	12	737662	737673	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_013739	ACGCCG	2	12	761338	761349	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013739	CGGGAT	2	12	791804	791815	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013739	GAACGA	2	12	828360	828371	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013739	CACTTA	2	12	840247	840258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013739	CGCGGG	2	12	873227	873238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013739	GTGCGC	2	12	880762	880773	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013739	GACCCC	2	12	897576	897587	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_013739	CCGGCC	2	12	924908	924919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_013739	CGCGGG	2	12	932569	932580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013739	CGCGGG	2	12	981271	981282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013739	AGGCCG	2	12	1019544	1019555	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013739	TGACGC	2	12	1091600	1091611	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013739	CGCTCG	2	12	1106624	1106635	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013739	CTCGAT	2	12	1174836	1174847	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013739	GGAGGG	2	12	1241121	1241132	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013739	TCCGGA	2	12	1242304	1242315	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013739	GCTGTC	2	12	1271264	1271275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013739	CGCCGG	2	12	1298052	1298063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013739	CGCGAT	2	12	1350366	1350377	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013739	CCCCTG	2	12	1363306	1363317	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_013739	TGGCGC	2	12	1459919	1459930	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013739	CGAACA	2	12	1516050	1516061	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013739	ACGGGG	2	12	1551692	1551703	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013739	GCGGGT	2	12	1551761	1551772	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013739	GGTGGG	2	12	1551856	1551867	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013739	GCCGGC	2	12	1568359	1568370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013739	AGGAGC	2	12	1644901	1644912	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_013739	ACGCGC	2	12	1670552	1670563	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013739	GTCGAG	2	12	1776006	1776017	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_013739	TGGCGG	2	12	1780010	1780021	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_013739	CGCGGG	2	12	1780022	1780033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013739	GCCGGC	2	12	1780059	1780070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013739	GCTTGC	2	12	1837723	1837734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013739	CGGCGA	2	12	1989716	1989727	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013739	TTCCCC	2	12	2058250	2058261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_013739	GCGCTC	2	12	2072697	2072708	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013739	GGATCG	2	12	2180869	2180880	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013739	CGACCA	2	12	2186938	2186949	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013739	TCGCCA	2	12	2226109	2226120	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013739	GCGCCC	2	12	2280271	2280282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_013739	AGGCGG	2	12	2322910	2322921	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_013739	CGCGGA	2	12	2504615	2504626	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013739	GGAGGG	2	12	2512292	2512303	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013739	TCGGCG	2	12	2550800	2550811	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013739	GCGGCT	2	12	2625382	2625393	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013739	GCTGGA	2	12	2626271	2626282	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013739	CGCTGG	2	12	2626318	2626329	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013739	ACGCGG	2	12	2626915	2626926	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013739	GCGCTG	2	12	2626968	2626979	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013739	GCCCCG	2	12	2632043	2632054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_013739	GCCAGC	3	18	2636950	2636967	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013739	GGCTGG	2	12	2752383	2752394	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_013739	CGTCGC	2	12	2763469	2763480	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013739	CAGCTC	2	12	2763925	2763936	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013739	CGTCGG	2	12	2770335	2770346	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013739	GCGCCG	2	12	2821474	2821485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013739	GAGCGG	2	12	2891641	2891652	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_013739	GAGCGG	2	12	2891661	2891672	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_013739	CGACCG	2	12	2973352	2973363	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013739	AGCGGC	2	12	2978642	2978653	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013739	GACCGC	2	12	3001136	3001147	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013739	ACGACA	2	12	3030297	3030308	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013739	TCGTCA	2	12	3094816	3094827	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013739	GCGCGG	2	12	3161351	3161362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013739	CGGGAG	2	12	3284931	3284942	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_013739	GCGTCC	2	12	3284994	3285005	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_013739	AGCGCC	2	12	3337529	3337540	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013739	CCGCGC	2	12	3347789	3347800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_013739	TCTCCC	2	12	3472017	3472028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_013739	AGACCA	2	12	3497476	3497487	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013739	GGCGCA	2	12	3544666	3544677	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013739	CCGCGA	2	12	3551481	3551492	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013739	CGCAGC	2	12	3640216	3640227	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013739	CCGGCG	2	12	3640424	3640435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013739	CAGGTC	2	12	3662881	3662892	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013739	CGACCG	2	12	3686607	3686618	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013739	GCGCCG	2	12	3785241	3785252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013739	GCCCGC	2	12	3820625	3820636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_013739	CCGCGC	2	12	3826135	3826146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_013739	GACGCG	2	12	3842974	3842985	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013739	GGCGCG	2	12	3999158	3999169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013739	CGGGGT	3	18	4023500	4023517	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_013739	CCCGAT	2	12	4130836	4130847	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013739	CCGGCC	2	12	4183724	4183735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_013739	GCCCGC	2	12	4203468	4203479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_013739	CGGCAG	2	12	4308241	4308252	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013739	TCGCGG	2	12	4311445	4311456	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013739	GGCGCC	2	12	4321911	4321922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013739	GGCCCC	2	12	4412915	4412926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_013739	ACCGCA	2	12	4417062	4417073	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013739	TCGCGA	2	12	4419389	4419400	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013739	GCCGAC	2	12	4468226	4468237	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013739	CGCCGG	2	12	4468451	4468462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013739	CTCGGC	2	12	4468677	4468688	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013739	ACGGGA	2	12	4507750	4507761	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_013739	GAGCGG	2	12	4528428	4528439	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_013739	GGAGCG	2	12	4528478	4528489	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_013739	GAGCGG	2	12	4528509	4528520	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_013739	AGCCTG	2	12	4548891	4548902	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013739	GCCCCG	2	12	4590799	4590810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_013739	GAAAAC	2	12	4607477	4607488	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_013739	CCGGCG	2	12	4607600	4607611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013739	CGAACG	2	12	4619217	4619228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013739	GACGGA	2	12	4723473	4723484	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_013739	GGCGAC	2	12	4759568	4759579	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013739	CGAACG	2	12	4759758	4759769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013739	CAGCCG	2	12	4761947	4761958	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013739	GCCGCA	2	12	4800941	4800952	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013739	TGCCGC	2	12	4891428	4891439	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013739	CGCGGG	2	12	4945624	4945635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013739	GCGCGT	2	12	4949880	4949891	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013739	CCGGCT	2	12	4982922	4982933	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013739	GGCACC	2	12	4991692	4991703	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
137	NC_013739	TGCGCG	2	12	5035244	5035255	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013739	GCGCTC	2	12	5102410	5102421	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013739	CGTCCA	2	12	5112793	5112804	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013739	CGCTCG	2	12	5172019	5172030	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013739	CGCCTC	3	18	5173958	5173975	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_013739	GTTCAT	2	12	5213149	5213160	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_013739	TCAGCG	2	12	5258858	5258869	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_013739	GGTCCT	2	12	5259116	5259127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_013739	CGCCGG	2	12	5331713	5331724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013739	GTTGCC	2	12	5347564	5347575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_013739	GCCGAG	2	12	5382532	5382543	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_013739	CGACGG	3	18	5500546	5500563	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_013739	TCCGCG	2	12	5548478	5548489	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013739	GATCGT	2	12	5552590	5552601	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_013739	CGCCAG	2	12	5553145	5553156	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
152	NC_013739	CGGTCG	2	12	5561180	5561191	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_013739	GGCGCC	2	12	5561441	5561452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_013739	CACCTG	2	12	5561732	5561743	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
155	NC_013739	ACCGGC	2	12	5561753	5561764	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
156	NC_013739	ACCACG	2	12	5577388	5577399	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
157	NC_013739	CCTCTC	2	12	5588403	5588414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_013739	TTCCCG	2	12	5649000	5649011	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
159	NC_013739	CGCCAT	2	12	5691790	5691801	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
160	NC_013739	CGTATC	2	12	5728145	5728156	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_013739	CGCCTG	2	12	5777341	5777352	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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168	NC_013739	CTGGTC	2	12	5901593	5901604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_013739	CGCGCT	2	12	6202276	6202287	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.