MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 plasmid pCROD1

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013717	TGGC	2	8	562	569	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013717	CATT	2	8	1965	1972	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013717	GACA	2	8	2006	2013	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013717	ATCA	2	8	2409	2416	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013717	CCAG	2	8	4261	4268	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013717	GCCT	2	8	4759	4766	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013717	GGAC	2	8	11735	11742	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013717	GTCC	2	8	11758	11765	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013717	CTGG	2	8	12060	12067	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013717	AAGG	2	8	12142	12149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013717	GTTG	2	8	13481	13488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013717	TGTT	2	8	13492	13499	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013717	GGTT	2	8	13501	13508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013717	ATGA	2	8	18832	18839	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013717	TTTA	2	8	20957	20964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013717	CTTT	2	8	20969	20976	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013717	GTTT	2	8	20991	20998	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013717	TCAG	2	8	21969	21976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013717	AAAT	2	8	26290	26297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013717	CTGA	2	8	26644	26651	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013717	GAAA	2	8	26948	26955	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013717	GGAG	2	8	27542	27549	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013717	AGAC	2	8	31340	31347	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013717	TAAT	2	8	31418	31425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013717	TAAC	2	8	31452	31459	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013717	AAAT	2	8	32308	32315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013717	GAGT	2	8	32343	32350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013717	TCAT	2	8	32527	32534	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013717	AATC	2	8	32903	32910	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013717	GTAA	2	8	33018	33025	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013717	ACAG	2	8	33030	33037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013717	AAAT	2	8	33442	33449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013717	ATGC	2	8	40923	40930	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013717	ATTT	2	8	41213	41220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013717	CCTT	2	8	41788	41795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013717	GATT	2	8	47396	47403	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013717	CATT	2	8	48295	48302	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013717	CATC	2	8	48760	48767	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013717	CAGC	2	8	49657	49664	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013717	CGGG	2	8	52769	52776	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013717	GACA	2	8	52892	52899	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013717	GAAT	2	8	52996	53003	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013717	TAAA	2	8	53159	53166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013717	TCAT	2	8	53182	53189	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013717	AATA	2	8	53204	53211	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013717	TAAT	2	8	53431	53438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.