MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 2212

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013716	CAGA	2	8	132	139	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013716	CTGT	2	8	8695	8702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013716	CCTT	2	8	8703	8710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013716	ATTG	2	8	11394	11401	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013716	ATTT	2	8	11543	11550	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013716	GTAA	2	8	13663	13670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013716	TCAT	2	8	14913	14920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013716	ATAA	2	8	14948	14955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013716	TTTA	2	8	14972	14979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013716	ATTA	2	8	17682	17689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013716	TAAA	2	8	17778	17785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013716	TGAA	2	8	17848	17855	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013716	GAAC	2	8	17981	17988	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013716	AGAC	2	8	20206	20213	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013716	GTAC	2	8	20365	20372	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013716	CATC	2	8	20434	20441	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013716	TTTC	2	8	26374	26381	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013716	AATT	2	8	26508	26515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013716	CAAC	2	8	26728	26735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013716	TCAT	2	8	33544	33551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013716	CCTT	2	8	33665	33672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013716	AGCC	2	8	33675	33682	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013716	GCCT	2	8	40141	40148	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013716	AGTT	2	8	41314	41321	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013716	AGTG	2	8	41499	41506	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013716	CTGG	2	8	45987	45994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013716	CAAG	2	8	46030	46037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013716	GTGC	2	8	53647	53654	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013716	CAGG	2	8	55432	55439	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013716	AAAT	2	8	63256	63263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013716	TGAA	2	8	63306	63313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013716	TATT	2	8	73251	73258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013716	ACGC	2	8	74333	74340	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013716	GCTG	2	8	74361	74368	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013716	ATGG	2	8	78174	78181	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013716	ATTC	2	8	80690	80697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013716	CTTT	2	8	80767	80774	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013716	CTGC	2	8	80914	80921	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013716	TCCA	2	8	85527	85534	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013716	CAGG	2	8	85581	85588	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013716	GACG	2	8	86809	86816	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013716	ATCA	2	8	99582	99589	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013716	TAAT	2	8	99744	99751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013716	TTAC	2	8	99809	99816	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013716	TTTA	2	8	101019	101026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013716	AGGC	2	8	101296	101303	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013716	AGGC	2	8	121080	121087	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013716	CTTT	2	8	140118	140125	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013716	ATTT	2	8	140384	140391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013716	TCAA	2	8	140548	140555	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013716	TAGA	2	8	141560	141567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013716	CGGC	2	8	145888	145895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013716	AACT	2	8	150306	150313	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013716	TTTA	2	8	153699	153706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013716	GCTG	2	8	157791	157798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013716	GGGA	2	8	159804	159811	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013716	CTTT	2	8	161985	161992	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013716	GGCA	2	8	165910	165917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_013716	CTTT	2	8	183383	183390	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013716	TGCT	2	8	183437	183444	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013716	TGCC	2	8	192998	193005	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013716	CATA	2	8	198369	198376	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013716	TAAA	2	8	201263	201270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013716	GAAA	2	8	207154	207161	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013716	ACTT	2	8	207935	207942	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013716	TTAG	2	8	213237	213244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013716	GCCA	2	8	225029	225036	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013716	GTCC	2	8	228492	228499	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013716	TGGT	2	8	228922	228929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013716	AAGG	2	8	228954	228961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013716	GTGC	2	8	228974	228981	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013716	GTAA	2	8	232266	232273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013716	ATTA	2	8	236061	236068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013716	TGAA	2	8	236326	236333	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013716	CTGT	2	8	236399	236406	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013716	ATTA	2	8	238312	238319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013716	TTAC	2	8	238442	238449	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013716	TTTA	2	8	238512	238519	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013716	GCCA	2	8	240133	240140	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013716	GACA	2	8	240271	240278	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013716	GATT	2	8	240329	240336	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013716	TCTG	2	8	240435	240442	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013716	GCAG	2	8	240467	240474	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013716	CTGG	2	8	240486	240493	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013716	AATG	2	8	244147	244154	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013716	GTCT	2	8	246829	246836	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013716	ATCA	2	8	246890	246897	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013716	TGCC	2	8	246922	246929	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013716	AAAT	2	8	247573	247580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013716	CCGG	2	8	249051	249058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013716	GTAG	2	8	249350	249357	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013716	TGAA	2	8	249543	249550	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013716	CGCT	2	8	249558	249565	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013716	CGCA	2	8	249910	249917	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013716	CTGA	2	8	250456	250463	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013716	GTAC	2	8	250540	250547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013716	CGTC	2	8	250980	250987	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013716	AAAG	2	8	251103	251110	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013716	CGTT	2	8	251277	251284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013716	GCTG	2	8	251865	251872	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013716	CCTG	2	8	253405	253412	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013716	CCGT	2	8	253440	253447	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013716	ATTA	2	8	253746	253753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013716	TTAA	2	8	253772	253779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013716	TGCC	3	12	253943	253954	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013716	CTGG	2	8	254057	254064	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013716	TAAA	2	8	257353	257360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013716	CTCA	2	8	258018	258025	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013716	CTTA	2	8	259932	259939	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013716	CAAA	2	8	259940	259947	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013716	CCTG	2	8	266112	266119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013716	CCGT	2	8	266147	266154	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013716	CCTG	2	8	266457	266464	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013716	TTCT	2	8	266536	266543	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013716	ATTT	2	8	266775	266782	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013716	TAAT	2	8	266805	266812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013716	GTTA	2	8	266865	266872	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013716	TACA	2	8	266926	266933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013716	GAAA	2	8	267100	267107	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013716	AATT	2	8	267271	267278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013716	GAGT	2	8	267343	267350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013716	CTTG	2	8	270945	270952	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013716	ATAA	2	8	274520	274527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013716	GGTG	2	8	274656	274663	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013716	ATTT	2	8	281376	281383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013716	TTAA	2	8	281614	281621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013716	GCGG	2	8	287868	287875	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013716	TTTC	2	8	297001	297008	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013716	AGCC	2	8	297092	297099	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013716	TGGG	2	8	313506	313513	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013716	TGAA	2	8	317683	317690	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013716	TTGA	2	8	317700	317707	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013716	AAAC	2	8	317729	317736	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013716	AACG	2	8	317913	317920	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_013716	GGGA	2	8	319118	319125	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013716	CATA	2	8	319344	319351	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_013716	AGCC	2	8	319506	319513	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013716	CTTT	2	8	324958	324965	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013716	GAAA	2	8	325029	325036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013716	CAAG	2	8	325777	325784	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_013716	TTTC	2	8	325885	325892	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_013716	GCTG	2	8	326212	326219	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_013716	CCGC	2	8	326739	326746	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_013716	CGAT	2	8	326959	326966	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_013716	TGGA	2	8	327057	327064	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013716	GGCG	2	8	327098	327105	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013716	CACG	2	8	328938	328945	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_013716	GCTG	2	8	329172	329179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_013716	GCCA	2	8	330146	330153	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013716	GAAG	2	8	337698	337705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013716	CAGG	2	8	355601	355608	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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495	NC_013716	TGAA	2	8	1253528	1253535	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_013716	TGGG	2	8	1261033	1261040	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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