MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 17322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013716	TAA	3	9	1292073	1292081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_013716	GCT	2	6	1292127	1292132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_013716	AAT	2	6	1292138	1292143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_013716	GGC	2	6	1292616	1292621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_013716	GAT	2	6	1292643	1292648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_013716	T	6	6	1292697	1292702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_013716	TTCA	2	8	1292720	1292727	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_013716	TA	3	6	1292731	1292736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_013716	A	6	6	1292736	1292741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_013716	TCA	2	6	1295757	1295762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_013716	CAGG	2	8	1295773	1295780	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4012	NC_013716	G	6	6	1295779	1295784	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_013716	AAC	2	6	1295790	1295795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_013716	CTG	2	6	1295857	1295862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_013716	TGA	2	6	1295873	1295878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_013716	AT	5	10	1295879	1295888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_013716	AAC	2	6	1295905	1295910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_013716	GCAA	2	8	1295926	1295933	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4019	NC_013716	TTAAT	2	10	1296007	1296016	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_013716	ATG	2	6	1296081	1296086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_013716	CT	3	6	1296137	1296142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_013716	ATGCA	2	10	1296189	1296198	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4023	NC_013716	AAT	2	6	1296221	1296226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_013716	TC	3	6	1296266	1296271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4025	NC_013716	GCC	2	6	1296277	1296282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4026	NC_013716	ATA	2	6	1296346	1296351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_013716	TAAA	2	8	1298182	1298189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_013716	AAT	2	6	1300573	1300578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_013716	CAA	2	6	1300586	1300591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_013716	CTG	2	6	1300604	1300609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_013716	T	8	8	1300632	1300639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_013716	GCTTT	2	10	1300641	1300650	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4033	NC_013716	CGG	2	6	1300678	1300683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_013716	A	6	6	1300698	1300703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_013716	AGC	2	6	1300712	1300717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_013716	CT	3	6	1302740	1302745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_013716	GGC	2	6	1302859	1302864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_013716	CCATA	2	10	1302890	1302899	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4039	NC_013716	A	6	6	1302899	1302904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_013716	GAAG	2	8	1302927	1302934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_013716	CGGG	2	8	1302943	1302950	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_013716	AAC	2	6	1304069	1304074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_013716	CTT	2	6	1304880	1304885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_013716	T	6	6	1304928	1304933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_013716	TC	3	6	1304947	1304952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4046	NC_013716	ACA	2	6	1304987	1304992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_013716	T	6	6	1304994	1304999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_013716	CAG	2	6	1305090	1305095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_013716	GTG	2	6	1305135	1305140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_013716	TTG	2	6	1305162	1305167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_013716	ACA	2	6	1305187	1305192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_013716	TCT	2	6	1305205	1305210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_013716	CTG	2	6	1305307	1305312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_013716	TGG	2	6	1305327	1305332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_013716	CAC	2	6	1305428	1305433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4056	NC_013716	GGT	3	9	1305434	1305442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_013716	TGG	2	6	1305526	1305531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_013716	TCC	2	6	1305539	1305544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4059	NC_013716	GGA	2	6	1305620	1305625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_013716	GTCC	2	8	1305630	1305637	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4061	NC_013716	TGG	2	6	1305664	1305669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_013716	GAG	2	6	1305690	1305695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_013716	GAA	3	9	1305698	1305706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_013716	AGA	2	6	1305761	1305766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_013716	CAG	2	6	1305790	1305795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_013716	G	6	6	1305795	1305800	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_013716	CAG	2	6	1305822	1305827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_013716	GCG	2	6	1305860	1305865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_013716	GAA	2	6	1305866	1305871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_013716	GTG	2	6	1305893	1305898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_013716	CCGGC	2	10	1305978	1305987	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4072	NC_013716	GA	3	6	1306080	1306085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_013716	AGCA	2	8	1306255	1306262	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4074	NC_013716	TCA	2	6	1306311	1306316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_013716	CA	3	6	1306348	1306353	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4076	NC_013716	A	6	6	1306807	1306812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_013716	ATT	2	6	1309329	1309334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_013716	GTT	2	6	1309388	1309393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_013716	GGT	2	6	1309497	1309502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_013716	AT	3	6	1309504	1309509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_013716	AT	3	6	1309524	1309529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_013716	TGT	2	6	1309635	1309640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_013716	T	8	8	1309646	1309653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_013716	ATTTT	2	10	1309668	1309677	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_013716	TAAT	2	8	1309820	1309827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_013716	TA	3	6	1309915	1309920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_013716	CAA	2	6	1309925	1309930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_013716	GTA	2	6	1309931	1309936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_013716	GAA	2	6	1310023	1310028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_013716	A	7	7	1310084	1310090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_013716	ATG	2	6	1310132	1310137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_013716	GAA	2	6	1310198	1310203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_013716	ATTA	2	8	1310206	1310213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_013716	ATG	2	6	1310300	1310305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_013716	GCA	2	6	1310415	1310420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_013716	ATA	2	6	1310473	1310478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_013716	AAT	2	6	1310512	1310517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_013716	GAT	2	6	1310581	1310586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_013716	GAA	2	6	1310609	1310614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_013716	TA	3	6	1310630	1310635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_013716	TAT	2	6	1310639	1310644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_013716	GAA	2	6	1310647	1310652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_013716	AAT	2	6	1310677	1310682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_013716	A	6	6	1310697	1310702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_013716	GAC	2	6	1310709	1310714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_013716	TCA	2	6	1310728	1310733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_013716	CAA	2	6	1310771	1310776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_013716	AAT	2	6	1310779	1310784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_013716	CCAT	2	8	1310823	1310830	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4110	NC_013716	G	7	7	1310871	1310877	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_013716	GTG	2	6	1310882	1310887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_013716	TTC	2	6	1310891	1310896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_013716	T	6	6	1310929	1310934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_013716	ATA	2	6	1310945	1310950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_013716	ATG	2	6	1310957	1310962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_013716	ATA	2	6	1310977	1310982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_013716	AAATA	2	10	1311000	1311009	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_013716	ATA	2	6	1311028	1311033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_013716	AT	3	6	1311039	1311044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_013716	ATT	2	6	1311135	1311140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_013716	AT	3	6	1311176	1311181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_013716	AT	3	6	1311199	1311204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_013716	TGC	2	6	1311240	1311245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_013716	TATCAT	2	12	1311298	1311309	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4125	NC_013716	GGGA	2	8	1311346	1311353	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_013716	A	7	7	1311400	1311406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_013716	AAT	2	6	1311421	1311426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_013716	A	8	8	1311433	1311440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_013716	ATA	2	6	1311468	1311473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_013716	AAAG	2	8	1311478	1311485	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_013716	TTA	2	6	1311537	1311542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_013716	TTC	2	6	1311549	1311554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_013716	ATG	2	6	1311591	1311596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_013716	AATAG	2	10	1311599	1311608	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_013716	ATA	2	6	1311617	1311622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_013716	A	6	6	1311622	1311627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_013716	TTA	2	6	1311692	1311697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4142	NC_013716	TAA	2	6	1311844	1311849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_013716	ATC	2	6	1311853	1311858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4145	NC_013716	A	6	6	1311920	1311925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4149	NC_013716	ATC	2	6	1312037	1312042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4152	NC_013716	A	7	7	1312310	1312316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_013716	ATA	2	6	1312325	1312330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4154	NC_013716	TTAT	2	8	1312331	1312338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4155	NC_013716	TAA	2	6	1312347	1312352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4163	NC_013716	TTTC	2	8	1312671	1312678	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4164	NC_013716	TGG	2	6	1312719	1312724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4165	NC_013716	TTA	2	6	1312730	1312735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4222	NC_013716	T	6	6	1330954	1330959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4223	NC_013716	CGT	2	6	1330970	1330975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4231	NC_013716	CAGA	2	8	1332151	1332158	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4247	NC_013716	TTATA	2	10	1335723	1335732	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4249	NC_013716	T	6	6	1336464	1336469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4250	NC_013716	T	7	7	1336495	1336501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_013716	TAA	2	6	1336510	1336515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_013716	GC	3	6	1336551	1336556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4253	NC_013716	TA	3	6	1336595	1336600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_013716	TGG	2	6	1337061	1337066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_013716	AG	3	6	1337091	1337096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_013716	TTA	2	6	1338440	1338445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_013716	TCCT	2	8	1340406	1340413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4258	NC_013716	TA	4	8	1340445	1340452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_013716	ATTC	2	8	1340620	1340627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4260	NC_013716	AAAT	2	8	1340637	1340644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_013716	TCA	2	6	1340652	1340657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4262	NC_013716	TTA	2	6	1340675	1340680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4264	NC_013716	GAT	2	6	1341801	1341806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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