MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 17322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_013716	AGA	2	6	5256672	5256677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17002	NC_013716	CAG	2	6	5256724	5256729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17003	NC_013716	ATG	2	6	5256810	5256815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17004	NC_013716	A	8	8	5256911	5256918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17005	NC_013716	TGTC	2	8	5256954	5256961	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17006	NC_013716	TTTA	2	8	5256991	5256998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17007	NC_013716	TCA	2	6	5258680	5258685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17008	NC_013716	ATT	2	6	5258692	5258697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17009	NC_013716	TCA	2	6	5263405	5263410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17010	NC_013716	AT	3	6	5263440	5263445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17011	NC_013716	TA	3	6	5263473	5263478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17012	NC_013716	C	7	7	5263820	5263826	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17013	NC_013716	GCA	2	6	5263906	5263911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17014	NC_013716	ATG	2	6	5266609	5266614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17015	NC_013716	TTAT	2	8	5268669	5268676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17016	NC_013716	TAC	2	6	5268684	5268689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17017	NC_013716	ACA	2	6	5268809	5268814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17018	NC_013716	CTC	2	6	5268818	5268823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17019	NC_013716	CGC	2	6	5268827	5268832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17020	NC_013716	GAA	2	6	5268846	5268851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17021	NC_013716	TTTC	2	8	5268861	5268868	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17022	NC_013716	ATT	2	6	5268903	5268908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17026	NC_013716	T	6	6	5268996	5269001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17027	NC_013716	TG	3	6	5269008	5269013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17028	NC_013716	TTCT	2	8	5269014	5269021	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17029	NC_013716	GT	3	6	5269139	5269144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17030	NC_013716	TCC	2	6	5269146	5269151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17031	NC_013716	AAT	2	6	5269163	5269168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17032	NC_013716	CAT	2	6	5269172	5269177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17034	NC_013716	TACT	2	8	5269405	5269412	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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17036	NC_013716	A	7	7	5269445	5269451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17038	NC_013716	GCCA	2	8	5269470	5269477	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17039	NC_013716	ACTG	2	8	5269486	5269493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17040	NC_013716	TCA	2	6	5269649	5269654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17041	NC_013716	TCA	2	6	5269661	5269666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17042	NC_013716	ATC	2	6	5269735	5269740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17045	NC_013716	GCC	2	6	5270063	5270068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17046	NC_013716	GCA	2	6	5270082	5270087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17047	NC_013716	TTA	2	6	5270097	5270102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17049	NC_013716	TTTC	2	8	5270131	5270138	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17050	NC_013716	TCT	2	6	5270183	5270188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17053	NC_013716	CA	3	6	5271585	5271590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17054	NC_013716	G	6	6	5271604	5271609	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17055	NC_013716	GTAG	2	8	5271639	5271646	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17056	NC_013716	CAC	2	6	5271811	5271816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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17058	NC_013716	CAC	2	6	5271865	5271870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17059	NC_013716	ATT	2	6	5272633	5272638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17060	NC_013716	GTT	2	6	5272662	5272667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17064	NC_013716	CTT	2	6	5272832	5272837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17077	NC_013716	GTGTT	2	10	5277891	5277900	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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17099	NC_013716	TGA	2	6	5295313	5295318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17109	NC_013716	CAC	2	6	5297131	5297136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17110	NC_013716	GC	3	6	5297156	5297161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17111	NC_013716	TTA	2	6	5297165	5297170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17259	NC_013716	CTG	2	6	5320072	5320077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17261	NC_013716	CGA	2	6	5320111	5320116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17262	NC_013716	AATC	2	8	5320241	5320248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17263	NC_013716	GTG	2	6	5321256	5321261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17265	NC_013716	AATG	2	8	5321294	5321301	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17266	NC_013716	GC	3	6	5322612	5322617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17267	NC_013716	GCTC	2	8	5322624	5322631	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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17270	NC_013716	T	7	7	5323797	5323803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17272	NC_013716	GGC	2	6	5323819	5323824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17273	NC_013716	TATT	2	8	5324880	5324887	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17275	NC_013716	AAT	2	6	5324923	5324928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17277	NC_013716	AAAAG	2	10	5324982	5324991	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17278	NC_013716	AGCA	2	8	5324992	5324999	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17279	NC_013716	TAAGG	2	10	5325006	5325015	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17280	NC_013716	ATCT	2	8	5325027	5325034	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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17285	NC_013716	TAA	2	6	5332146	5332151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17289	NC_013716	CGC	2	6	5333781	5333786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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17293	NC_013716	TCCC	2	8	5335643	5335650	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
17294	NC_013716	CAGC	2	8	5335657	5335664	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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17299	NC_013716	GCC	2	6	5338136	5338141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17300	NC_013716	ATT	2	6	5338725	5338730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17301	NC_013716	TA	3	6	5338736	5338741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17302	NC_013716	ATA	2	6	5340318	5340323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17320	NC_013716	TC	3	6	5345873	5345878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17321	NC_013716	GC	3	6	5345985	5345990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17322	NC_013716	TGG	2	6	5346636	5346641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.