MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 17322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013716	TGG	2	6	337585	337590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_013716	CAA	2	6	337601	337606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_013716	CCG	2	6	337639	337644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_013716	CGA	2	6	337664	337669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_013716	GCG	2	6	337684	337689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_013716	GAAG	2	8	337698	337705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_013716	ATG	2	6	337728	337733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_013716	GAT	2	6	337775	337780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_013716	CGG	2	6	340832	340837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_013716	CCG	2	6	340847	340852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_013716	CGC	2	6	340858	340863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_013716	GTT	2	6	340879	340884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_013716	T	6	6	340916	340921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_013716	ATT	2	6	345825	345830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_013716	T	6	6	345842	345847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_013716	GC	3	6	345909	345914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_013716	TAT	2	6	345954	345959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_013716	AAT	2	6	346046	346051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_013716	TTA	2	6	346056	346061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_013716	GGC	2	6	346082	346087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_013716	GAA	2	6	346088	346093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_013716	ATT	2	6	346278	346283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_013716	ACA	2	6	347236	347241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_013716	ATT	2	6	347334	347339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_013716	ATT	2	6	347341	347346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_013716	TTAAC	2	10	347353	347362	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1027	NC_013716	ATT	2	6	351843	351848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_013716	GGA	2	6	351853	351858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_013716	CCG	2	6	354428	354433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_013716	TA	3	6	354459	354464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_013716	CAGG	2	8	355601	355608	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_013716	CGC	2	6	355624	355629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_013716	CTTT	2	8	357213	357220	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_013716	CGG	2	6	357223	357228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_013716	TGC	2	6	357280	357285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_013716	C	8	8	357318	357325	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1037	NC_013716	AAC	2	6	357327	357332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_013716	GTT	2	6	357863	357868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_013716	T	6	6	359660	359665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_013716	A	6	6	360848	360853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_013716	T	7	7	360859	360865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_013716	CAA	2	6	360917	360922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_013716	TGC	2	6	360939	360944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_013716	CGTT	2	8	360976	360983	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_013716	AGC	2	6	363520	363525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_013716	TAT	2	6	363560	363565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_013716	A	6	6	363595	363600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_013716	TTTA	2	8	363605	363612	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_013716	CTT	2	6	363620	363625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_013716	TCA	2	6	363654	363659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_013716	CAT	2	6	363665	363670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_013716	TGA	2	6	363717	363722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_013716	A	6	6	363722	363727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_013716	TAG	2	6	363735	363740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_013716	T	6	6	363755	363760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_013716	CAT	3	9	363833	363841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_013716	TAA	2	6	363851	363856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_013716	AG	3	6	363859	363864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_013716	ATA	2	6	363886	363891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_013716	CGGGG	2	10	363985	363994	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1061	NC_013716	ACC	2	6	364018	364023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_013716	TTG	2	6	364049	364054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_013716	TGA	2	6	364059	364064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_013716	A	6	6	364153	364158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_013716	CCT	2	6	365057	365062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_013716	AATT	2	8	365070	365077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_013716	TGT	2	6	365224	365229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_013716	GT	3	6	365257	365262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_013716	TAAAT	2	10	365294	365303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_013716	GAT	2	6	365310	365315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_013716	AATA	2	8	365316	365323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_013716	GTT	2	6	365330	365335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_013716	CCAT	2	8	365353	365360	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_013716	TAT	2	6	365367	365372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_013716	TAA	2	6	366716	366721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_013716	TAAT	2	8	366792	366799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_013716	TTA	2	6	366823	366828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_013716	ATT	2	6	366842	366847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_013716	GTT	3	9	366903	366911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_013716	T	7	7	366936	366942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_013716	TG	3	6	366950	366955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_013716	AATT	2	8	366970	366977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_013716	TG	3	6	367021	367026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_013716	T	6	6	367036	367041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_013716	ATT	2	6	367060	367065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1087	NC_013716	CTG	2	6	367128	367133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_013716	GT	3	6	367175	367180	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_013716	ACG	2	6	367226	367231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1091	NC_013716	TGA	2	6	367494	367499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1095	NC_013716	TGGGC	2	10	367762	367771	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1096	NC_013716	CAG	2	6	367790	367795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_013716	CG	3	6	367831	367836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_013716	CCG	2	6	367952	367957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_013716	CTT	2	6	367979	367984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1101	NC_013716	TGG	2	6	368158	368163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_013716	A	6	6	368183	368188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_013716	AAG	2	6	368198	368203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_013716	TGA	2	6	368247	368252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_013716	ACC	2	6	368367	368372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_013716	GTGAT	2	10	368498	368507	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_013716	TTC	2	6	368515	368520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_013716	T	7	7	368571	368577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_013716	TAG	2	6	368602	368607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1112	NC_013716	CTG	2	6	368732	368737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_013716	GAAT	2	8	368740	368747	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_013716	TTC	2	6	368864	368869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_013716	TCA	2	6	368870	368875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_013716	TCT	2	6	368877	368882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_013716	T	9	9	368952	368960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_013716	AT	3	6	368979	368984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_013716	TA	3	6	369096	369101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_013716	AAT	2	6	369121	369126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_013716	T	6	6	369140	369145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_013716	GAG	2	6	369189	369194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_013716	TGAT	2	8	369252	369259	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_013716	AT	3	6	369265	369270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_013716	CAG	2	6	369309	369314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_013716	TTG	2	6	369845	369850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_013716	TTG	2	6	369864	369869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_013716	ATT	2	6	369876	369881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_013716	ACTG	2	8	369907	369914	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_013716	TTA	2	6	369935	369940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_013716	ATATG	2	10	369968	369977	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_013716	AT	3	6	369992	369997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_013716	ATT	2	6	370000	370005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_013716	ATA	2	6	370096	370101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_013716	AGA	2	6	370104	370109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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