MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 17322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013716	ACG	2	6	229035	229040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_013716	CTG	2	6	229060	229065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_013716	GCGGG	2	10	229138	229147	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
504	NC_013716	GTA	2	6	229230	229235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_013716	GTC	2	6	229275	229280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_013716	CAC	2	6	229394	229399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_013716	AAC	2	6	229428	229433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_013716	TAT	2	6	229494	229499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013716	AGG	2	6	229613	229618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_013716	CGA	2	6	232230	232235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_013716	GTAA	2	8	232266	232273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
512	NC_013716	TTA	2	6	233598	233603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_013716	AGC	2	6	233614	233619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_013716	CAG	2	6	234215	234220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_013716	T	6	6	234291	234296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_013716	CATAA	2	10	236011	236020	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
517	NC_013716	ATTA	2	8	236061	236068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_013716	A	6	6	236090	236095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_013716	T	7	7	236145	236151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_013716	CCT	2	6	236173	236178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_013716	AT	3	6	236225	236230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_013716	CT	3	6	236236	236241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
523	NC_013716	T	8	8	236295	236302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013716	TGAA	2	8	236326	236333	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013716	TAA	2	6	236366	236371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_013716	TGA	2	6	236388	236393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_013716	CTGT	2	8	236399	236406	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
528	NC_013716	AAT	2	6	236427	236432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_013716	T	6	6	236502	236507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_013716	TTCTTA	2	12	236543	236554	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
531	NC_013716	TA	3	6	237918	237923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_013716	ATC	2	6	237947	237952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_013716	TC	3	6	238038	238043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_013716	A	7	7	238080	238086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_013716	CT	3	6	238218	238223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
536	NC_013716	AAC	2	6	238233	238238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_013716	TAT	2	6	238275	238280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_013716	TTG	2	6	238281	238286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_013716	T	6	6	238306	238311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_013716	ATTA	2	8	238312	238319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_013716	TTTAA	2	10	238326	238335	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_013716	TCA	2	6	238362	238367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_013716	TTAC	2	8	238442	238449	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
544	NC_013716	T	6	6	238465	238470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_013716	AAT	2	6	238480	238485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_013716	TTTA	2	8	238512	238519	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013716	CCG	2	6	239701	239706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_013716	TCA	2	6	239775	239780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_013716	T	6	6	239796	239801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013716	CCA	2	6	239908	239913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_013716	CGC	2	6	240060	240065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_013716	TGA	2	6	240099	240104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013716	GCCA	2	8	240133	240140	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
554	NC_013716	GCA	2	6	240147	240152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_013716	GACA	2	8	240271	240278	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
556	NC_013716	ATG	2	6	240310	240315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_013716	GCA	2	6	240323	240328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_013716	GATT	2	8	240329	240336	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
559	NC_013716	CGC	2	6	240395	240400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_013716	TCTG	2	8	240435	240442	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
561	NC_013716	GCAG	2	8	240467	240474	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
562	NC_013716	CTGG	2	8	240486	240493	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
563	NC_013716	GGA	2	6	240541	240546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_013716	TGG	2	6	240554	240559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_013716	CGC	2	6	240572	240577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_013716	CT	3	6	240672	240677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_013716	CTG	2	6	240838	240843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_013716	GCC	2	6	240900	240905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_013716	T	6	6	241142	241147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_013716	AAT	2	6	241175	241180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013716	A	7	7	242969	242975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013716	AATG	2	8	244147	244154	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013716	ATT	2	6	245086	245091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_013716	TG	3	6	245097	245102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_013716	TAT	2	6	246796	246801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013716	GTCT	2	8	246829	246836	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
577	NC_013716	CAA	2	6	246855	246860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_013716	ATCA	2	8	246890	246897	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
579	NC_013716	TGCC	2	8	246922	246929	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
580	NC_013716	AAAT	2	8	247573	247580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_013716	CGG	2	6	247638	247643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_013716	TG	3	6	247801	247806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_013716	GGC	2	6	247953	247958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_013716	AGC	2	6	247993	247998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_013716	TGC	2	6	248000	248005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_013716	ACT	2	6	248067	248072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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588	NC_013716	CGA	2	6	248192	248197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_013716	GCA	2	6	248266	248271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_013716	GAA	2	6	248325	248330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_013716	GGA	2	6	248361	248366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_013716	TAA	2	6	248379	248384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_013716	AGA	2	6	248408	248413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_013716	CAG	2	6	248434	248439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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596	NC_013716	GGA	2	6	248625	248630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_013716	GGC	2	6	248645	248650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_013716	GAA	2	6	248888	248893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_013716	TGC	2	6	248964	248969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_013716	GTC	2	6	248976	248981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_013716	TTG	2	6	249037	249042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013716	CCGG	2	8	249051	249058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
603	NC_013716	GGA	2	6	249089	249094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_013716	TCA	2	6	249114	249119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_013716	AC	3	6	249140	249145	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_013716	AC	3	6	249309	249314	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_013716	GTAG	2	8	249350	249357	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013716	CCT	2	6	249450	249455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_013716	CA	3	6	249485	249490	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_013716	TGA	2	6	249498	249503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013716	AAG	2	6	249509	249514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_013716	TGAA	2	8	249543	249550	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013716	CGCT	2	8	249558	249565	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
614	NC_013716	CGG	2	6	249667	249672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_013716	TG	3	6	249717	249722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
616	NC_013716	AAC	2	6	249820	249825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_013716	GTT	2	6	249830	249835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_013716	TC	3	6	249842	249847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
619	NC_013716	CGCA	2	8	249910	249917	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
620	NC_013716	AAC	2	6	249961	249966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_013716	CAC	2	6	250155	250160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_013716	CAT	2	6	250165	250170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_013716	GCG	2	6	250265	250270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_013716	GAG	2	6	250281	250286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_013716	TG	3	6	250306	250311	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_013716	G	6	6	250426	250431	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
627	NC_013716	TCC	2	6	250436	250441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_013716	CTGA	2	8	250456	250463	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
629	NC_013716	GTAC	2	8	250540	250547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
630	NC_013716	GGA	2	6	250744	250749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_013716	AC	3	6	250962	250967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
632	NC_013716	CGTC	2	8	250980	250987	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
633	NC_013716	AAC	2	6	250999	251004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_013716	AGC	2	6	251089	251094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_013716	CAT	2	6	251095	251100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_013716	AAAG	2	8	251103	251110	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
637	NC_013716	AGCGA	2	10	251229	251238	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
638	NC_013716	AGTCG	2	10	251256	251265	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
639	NC_013716	CGTT	2	8	251277	251284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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