MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 17322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013716	A	7	7	1935974	1935980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_013716	ATC	2	6	1936021	1936026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_013716	TTTA	2	8	1937336	1937343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_013716	TGC	2	6	1937349	1937354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_013716	ATT	2	6	1937417	1937422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_013716	CGT	2	6	1937467	1937472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_013716	ATTG	2	8	1937488	1937495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_013716	AT	3	6	1937530	1937535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_013716	T	6	6	1937548	1937553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_013716	CATTC	2	10	1937578	1937587	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6011	NC_013716	GCA	2	6	1937643	1937648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_013716	TTCC	2	8	1939021	1939028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6013	NC_013716	AACG	2	8	1939039	1939046	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6014	NC_013716	TATT	2	8	1939117	1939124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_013716	T	6	6	1939123	1939128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_013716	ATTG	2	8	1939130	1939137	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_013716	TCT	2	6	1939142	1939147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_013716	GC	3	6	1939148	1939153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6019	NC_013716	ATT	2	6	1939177	1939182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_013716	TTA	2	6	1939184	1939189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_013716	GCGAC	2	10	1939257	1939266	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6022	NC_013716	ATT	2	6	1939332	1939337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_013716	TCCA	2	8	1941085	1941092	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6024	NC_013716	AAT	2	6	1943216	1943221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_013716	TAT	2	6	1943224	1943229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_013716	ATT	2	6	1943245	1943250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_013716	TTA	2	6	1943258	1943263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_013716	CTT	2	6	1943623	1943628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_013716	TGC	2	6	1943666	1943671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_013716	A	6	6	1943702	1943707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_013716	CCG	3	9	1943727	1943735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_013716	CGTCG	2	10	1945151	1945160	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6033	NC_013716	CG	3	6	1945159	1945164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6034	NC_013716	T	6	6	1945165	1945170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_013716	GTC	2	6	1945189	1945194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_013716	CTA	2	6	1945227	1945232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_013716	TGT	2	6	1945260	1945265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_013716	TTA	2	6	1946237	1946242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_013716	TAA	2	6	1946256	1946261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_013716	ATC	2	6	1950489	1950494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_013716	ATT	2	6	1950525	1950530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_013716	T	6	6	1950542	1950547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_013716	GCT	2	6	1950590	1950595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_013716	CAA	2	6	1950683	1950688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_013716	A	6	6	1950687	1950692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_013716	AG	3	6	1950753	1950758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_013716	CGC	2	6	1950759	1950764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_013716	CAA	2	6	1950765	1950770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_013716	GTT	2	6	1952326	1952331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_013716	GGC	2	6	1952345	1952350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_013716	TCA	2	6	1953202	1953207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_013716	T	6	6	1955072	1955077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_013716	CCCG	2	8	1955620	1955627	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6054	NC_013716	T	7	7	1955634	1955640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_013716	GAG	2	6	1955706	1955711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_013716	GGC	2	6	1956078	1956083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_013716	GCC	2	6	1956596	1956601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_013716	GGC	2	6	1956608	1956613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_013716	TGT	2	6	1957284	1957289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_013716	ATA	2	6	1957686	1957691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_013716	GAT	2	6	1957740	1957745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_013716	A	7	7	1959602	1959608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_013716	T	6	6	1959625	1959630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_013716	ATA	2	6	1959670	1959675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_013716	TA	4	8	1959681	1959688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_013716	ATTA	2	8	1960654	1960661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_013716	GCC	2	6	1961818	1961823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_013716	A	8	8	1962984	1962991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6071	NC_013716	ATA	2	6	1964779	1964784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_013716	ATTA	2	8	1964805	1964812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_013716	TATT	2	8	1964842	1964849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_013716	TAA	2	6	1964863	1964868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_013716	ATA	2	6	1964906	1964911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6088	NC_013716	GGC	2	6	1971261	1971266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_013716	GCC	2	6	1971270	1971275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6097	NC_013716	TCGAT	2	10	1976534	1976543	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6098	NC_013716	GAC	2	6	1976548	1976553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6101	NC_013716	AGG	2	6	1976596	1976601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_013716	TGT	2	6	1979302	1979307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_013716	T	6	6	1979334	1979339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_013716	AGG	2	6	1979347	1979352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_013716	T	7	7	1979840	1979846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6109	NC_013716	AAT	2	6	1979963	1979968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6112	NC_013716	GTG	2	6	1980192	1980197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_013716	AAC	2	6	1981616	1981621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_013716	CGCTT	2	10	1983421	1983430	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6115	NC_013716	GAT	2	6	1983444	1983449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6117	NC_013716	TAA	2	6	1983489	1983494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_013716	CAA	2	6	1983508	1983513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_013716	GGA	2	6	1983523	1983528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6122	NC_013716	A	6	6	1984315	1984320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_013716	ACAT	2	8	1984339	1984346	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6124	NC_013716	ATG	2	6	1984397	1984402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_013716	A	7	7	1984412	1984418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_013716	GA	3	6	1984421	1984426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_013716	TTTA	2	8	1984479	1984486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_013716	CAT	2	6	1984589	1984594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6130	NC_013716	CAC	2	6	1984944	1984949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6132	NC_013716	AGA	2	6	1985301	1985306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6431	NC_013716	CG	3	6	2070188	2070193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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