MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Citrobacter rodentium ICC168 chromosome

Total Repeats: 17322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013716	AAT	2	6	1610333	1610338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_013716	TAA	2	6	1610392	1610397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_013716	TAA	2	6	1610411	1610416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_013716	ATG	2	6	1610420	1610425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_013716	ATG	2	6	1612488	1612493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_013716	TCAA	2	8	1612501	1612508	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5007	NC_013716	GTG	2	6	1612512	1612517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_013716	TTA	2	6	1612548	1612553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_013716	ATT	2	6	1612558	1612563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_013716	TA	3	6	1612601	1612606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_013716	TAA	2	6	1613549	1613554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_013716	ATG	2	6	1613586	1613591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_013716	GGCA	2	8	1615089	1615096	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5014	NC_013716	ATA	2	6	1616420	1616425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_013716	CG	3	6	1616445	1616450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_013716	ATA	2	6	1616457	1616462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_013716	AAT	2	6	1616495	1616500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_013716	ATA	2	6	1616518	1616523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_013716	ATC	2	6	1616526	1616531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_013716	TGA	2	6	1618025	1618030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_013716	GTT	2	6	1618034	1618039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_013716	GTG	2	6	1618055	1618060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_013716	T	6	6	1619731	1619736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_013716	ACA	2	6	1619754	1619759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_013716	CTG	2	6	1619785	1619790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_013716	CTG	2	6	1619897	1619902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_013716	TCA	3	9	1621610	1621618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_013716	TG	3	6	1621686	1621691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_013716	CGG	2	6	1621729	1621734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_013716	GAA	2	6	1621739	1621744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_013716	ACA	2	6	1622974	1622979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_013716	ATG	2	6	1622999	1623004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_013716	AGCG	2	8	1626508	1626515	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5034	NC_013716	A	6	6	1626571	1626576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_013716	CTT	2	6	1626619	1626624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_013716	GAG	2	6	1626643	1626648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_013716	GTGCT	2	10	1626668	1626677	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5038	NC_013716	A	6	6	1626741	1626746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_013716	TTC	2	6	1626749	1626754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_013716	CGG	2	6	1628099	1628104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_013716	GAC	2	6	1628212	1628217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_013716	ATT	2	6	1628228	1628233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_013716	ATA	3	9	1628305	1628313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_013716	TAT	2	6	1628331	1628336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_013716	ACC	2	6	1628385	1628390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5046	NC_013716	C	6	6	1628496	1628501	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5047	NC_013716	GTC	2	6	1628550	1628555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_013716	ATAG	2	8	1629887	1629894	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_013716	GTT	2	6	1629914	1629919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_013716	TCCCT	2	10	1629975	1629984	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5051	NC_013716	T	7	7	1629986	1629992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_013716	GAA	2	6	1629999	1630004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_013716	A	9	9	1630008	1630016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_013716	CCGG	2	8	1630031	1630038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5055	NC_013716	GTG	2	6	1630051	1630056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_013716	AAG	2	6	1630426	1630431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_013716	GGA	2	6	1630457	1630462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_013716	TCT	2	6	1630513	1630518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_013716	ATG	2	6	1630926	1630931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_013716	CGA	2	6	1630932	1630937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_013716	AGCC	2	8	1630954	1630961	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5062	NC_013716	ACA	2	6	1630969	1630974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_013716	GGC	2	6	1630999	1631004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_013716	AATTT	2	10	1633247	1633256	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_013716	GA	3	6	1633302	1633307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_013716	TC	3	6	1634664	1634669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5067	NC_013716	A	6	6	1634695	1634700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_013716	ACTT	2	8	1634722	1634729	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5069	NC_013716	CAAA	2	8	1634735	1634742	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5070	NC_013716	A	8	8	1634740	1634747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_013716	A	6	6	1634767	1634772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_013716	ATT	2	6	1634869	1634874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_013716	AAAC	2	8	1634876	1634883	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5074	NC_013716	GAA	2	6	1643161	1643166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_013716	GCG	2	6	1643180	1643185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5077	NC_013716	GCG	2	6	1643217	1643222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_013716	GCC	2	6	1643225	1643230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5079	NC_013716	CCT	2	6	1643280	1643285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5080	NC_013716	A	6	6	1643297	1643302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_013716	TG	3	6	1643541	1643546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_013716	CTA	2	6	1643567	1643572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_013716	CGA	3	9	1643584	1643592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_013716	GTT	2	6	1645019	1645024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_013716	TTAA	2	8	1648377	1648384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_013716	A	8	8	1648397	1648404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_013716	TGAG	2	8	1648409	1648416	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_013716	ATG	2	6	1648455	1648460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_013716	TGG	2	6	1649288	1649293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5092	NC_013716	CGG	2	6	1649475	1649480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_013716	CGC	2	6	1649570	1649575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5096	NC_013716	CTG	2	6	1649740	1649745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5098	NC_013716	CGC	2	6	1649867	1649872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_013716	GCT	2	6	1649924	1649929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5101	NC_013716	CGG	2	6	1649981	1649986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5103	NC_013716	CGC	2	6	1650038	1650043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5104	NC_013716	GCG	2	6	1650088	1650093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_013716	CGG	2	6	1650170	1650175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_013716	GT	3	6	1650226	1650231	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_013716	ACC	2	6	1650237	1650242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_013716	GAG	2	6	1650253	1650258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_013716	GCGG	2	8	1651070	1651077	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5110	NC_013716	A	6	6	1651558	1651563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_013716	TGA	2	6	1651591	1651596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_013716	AGCC	2	8	1651606	1651613	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5113	NC_013716	TTA	2	6	1651687	1651692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_013716	TAAAA	2	10	1651748	1651757	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_013716	ATT	2	6	1651797	1651802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_013716	TACT	2	8	1651839	1651846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5117	NC_013716	TTTC	2	8	1652127	1652134	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5118	NC_013716	GAG	2	6	1652172	1652177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_013716	GGC	2	6	1652388	1652393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_013716	CT	3	6	1652406	1652411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_013716	TAT	2	6	1652439	1652444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_013716	A	6	6	1652469	1652474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_013716	GCGCTT	2	12	1654198	1654209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_013716	CCCTT	2	10	1654271	1654280	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5125	NC_013716	TCA	2	6	1654293	1654298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_013716	AAC	2	6	1654323	1654328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_013716	AGTGTT	2	12	1654329	1654340	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_013716	GAT	2	6	1654358	1654363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_013716	ACA	2	6	1655621	1655626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5131	NC_013716	A	8	8	1655669	1655676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5264	NC_013716	ATG	2	6	1700070	1700075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5380	NC_013716	TTA	2	6	1730736	1730741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5388	NC_013716	GCT	3	9	1738232	1738240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5389	NC_013716	GTT	2	6	1738265	1738270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5391	NC_013716	AT	3	6	1738388	1738393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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