MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 24179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5003	NC_013315	TTAA	2	8	755076	755083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_013315	TTAA	2	8	755095	755102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_013315	TTAA	2	8	755114	755121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_013315	TTAA	2	8	755133	755140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_013315	TTAA	2	8	755152	755159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5009	NC_013315	TTAA	2	8	755190	755197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_013315	TTAA	2	8	755209	755216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_013315	TTAA	2	8	755228	755235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_013315	GATA	2	8	755257	755264	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5014	NC_013315	CTA	2	6	755386	755391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_013315	AGT	2	6	755421	755426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5020	NC_013315	TAAT	2	8	757054	757061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_013315	T	6	6	757098	757103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_013315	ATT	2	6	757104	757109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_013315	A	6	6	757122	757127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_013315	TAAA	2	8	757141	757148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_013315	A	6	6	757170	757175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_013315	TA	3	6	757186	757191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5029	NC_013315	TATT	2	8	757289	757296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5034	NC_013315	GTA	2	6	757408	757413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5037	NC_013315	GTA	2	6	757442	757447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5040	NC_013315	GTA	2	6	757484	757489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_013315	TAG	2	6	757490	757495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_013315	AATAT	2	10	757504	757513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_013315	TA	3	6	757527	757532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_013315	AT	3	6	757572	757577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_013315	AATATA	2	12	757590	757601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_013315	AGT	2	6	757645	757650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5053	NC_013315	GAT	2	6	757863	757868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5055	NC_013315	CAAT	2	8	757932	757939	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5059	NC_013315	AGA	2	6	758673	758678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_013315	AGG	2	6	758689	758694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5062	NC_013315	AAT	2	6	759097	759102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_013315	T	6	6	759111	759116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_013315	T	6	6	759118	759123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_013315	TTA	2	6	759133	759138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5072	NC_013315	TCAA	2	8	759295	759302	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5104	NC_013315	AT	3	6	765789	765794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_013315	AAG	2	6	765798	765803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5107	NC_013315	ATA	2	6	765817	765822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_013315	A	6	6	765872	765877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_013315	TTTA	2	8	765895	765902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5116	NC_013315	AT	3	6	767191	767196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_013315	T	6	6	767199	767204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_013315	TAT	3	9	767218	767226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_013315	AAAG	2	8	767229	767236	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_013315	AGAGT	2	10	767243	767252	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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5122	NC_013315	TTTGT	2	10	767279	767288	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_013315	TA	3	6	767342	767347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5125	NC_013315	AACAT	2	10	767409	767418	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5128	NC_013315	ATA	2	6	767546	767551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_013315	TTAATA	2	12	768454	768465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_013315	AATTA	2	10	768503	768512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5133	NC_013315	TAT	2	6	768535	768540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_013315	ATT	2	6	768570	768575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_013315	TTTC	2	8	769212	769219	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5136	NC_013315	AAT	2	6	769248	769253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_013315	TA	5	10	769343	769352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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