MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cronobacter turicensis z3032 plasmid pCTU1

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013283	CTGT	2	8	2115	2122	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013283	TGCG	2	8	4021	4028	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013283	GCTG	2	8	8742	8749	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013283	ACTG	2	8	16371	16378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013283	GGTG	2	8	16392	16399	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013283	GGCT	2	8	16872	16879	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013283	CACG	2	8	17560	17567	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013283	ATTT	2	8	18084	18091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013283	TCCT	2	8	18194	18201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013283	TTCA	2	8	20529	20536	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013283	TAAA	2	8	20869	20876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013283	TTTA	2	8	24532	24539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013283	GACC	2	8	24964	24971	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013283	CGGT	2	8	25072	25079	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013283	AAAT	2	8	30241	30248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013283	CGGA	2	8	34321	34328	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013283	TTCC	2	8	34461	34468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013283	AACA	2	8	39839	39846	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013283	TTAT	2	8	44377	44384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013283	GTTT	2	8	44696	44703	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013283	GCGT	2	8	44716	44723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013283	CTGA	2	8	45177	45184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013283	GGCA	2	8	45256	45263	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013283	GGCA	2	8	50003	50010	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013283	GGCA	2	8	50941	50948	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013283	TAAA	2	8	54584	54591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013283	CTGA	2	8	64340	64347	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013283	GGTT	2	8	66633	66640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013283	ATTT	2	8	70863	70870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013283	CGGG	2	8	73468	73475	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013283	TTTA	2	8	73701	73708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013283	ATAC	2	8	74933	74940	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013283	TTAA	2	8	77077	77084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013283	AAAG	2	8	77142	77149	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013283	TTAA	2	8	78435	78442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013283	GGGA	2	8	83194	83201	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013283	AACG	2	8	83399	83406	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013283	CGCC	2	8	85120	85127	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_013283	TCCA	2	8	90127	90134	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013283	CGGG	2	8	96408	96415	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013283	ATAC	2	8	96428	96435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013283	TGTT	2	8	98764	98771	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013283	CGTT	2	8	109672	109679	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013283	GTGA	2	8	110275	110282	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013283	TGAA	2	8	111880	111887	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013283	AAAT	2	8	124991	124998	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013283	TAAT	2	8	125143	125150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013283	ATTC	2	8	125228	125235	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013283	TTTG	2	8	125512	125519	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013283	ATCT	2	8	125785	125792	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013283	AAAC	2	8	127140	127147	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013283	GAGT	2	8	127379	127386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013283	ACTA	2	8	127407	127414	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013283	GGGT	2	8	127482	127489	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013283	TATC	2	8	127567	127574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013283	ATCA	2	8	129305	129312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013283	ACAG	2	8	130341	130348	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013283	GGTT	2	8	132911	132918	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013283	ATTT	2	8	133084	133091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013283	ATAA	2	8	133146	133153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013283	CAAA	2	8	133964	133971	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013283	AAAT	2	8	134051	134058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013283	TGGG	2	8	134727	134734	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013283	CGCT	2	8	136354	136361	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013283	AGAT	2	8	136660	136667	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013283	TCAG	2	8	136705	136712	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013283	TGAA	2	8	136780	136787	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013283	ATCA	2	8	138084	138091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.