MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Methylomirabilis oxyfera

Total Repeats: 729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013260	GAAC	2	8	4733	4740	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013260	CATT	2	8	8267	8274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013260	GTCA	2	8	8462	8469	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013260	CAAC	2	8	13392	13399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013260	GATT	2	8	14542	14549	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013260	GAGT	2	8	14921	14928	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013260	GAAG	2	8	17821	17828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013260	ATCC	2	8	21989	21996	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013260	AACG	2	8	22018	22025	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013260	CGGG	2	8	24873	24880	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013260	CGGC	2	8	25717	25724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013260	GCTG	2	8	29852	29859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013260	GGCC	2	8	29933	29940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013260	TGTC	2	8	39012	39019	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013260	TCGC	2	8	40195	40202	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013260	GCCC	2	8	43390	43397	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_013260	GATT	2	8	46208	46215	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013260	GCTC	2	8	54393	54400	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013260	GATC	2	8	54770	54777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013260	TCGG	2	8	55701	55708	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013260	CCAA	2	8	55883	55890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013260	GGGA	2	8	55983	55990	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013260	ACGT	2	8	56442	56449	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013260	TGGC	2	8	57783	57790	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013260	CTTC	2	8	57865	57872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013260	CGGC	2	8	57932	57939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013260	GGGC	2	8	59606	59613	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013260	GTCG	2	8	65001	65008	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013260	GGGC	2	8	68053	68060	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013260	CGAT	2	8	82492	82499	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013260	GGGC	2	8	94219	94226	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013260	ACCA	2	8	95376	95383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013260	GCGA	2	8	95986	95993	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013260	GCTG	2	8	96129	96136	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013260	CACG	2	8	96359	96366	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013260	TCGT	2	8	96388	96395	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013260	GCAG	2	8	96570	96577	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013260	CACG	2	8	107573	107580	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013260	AAGG	2	8	111716	111723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013260	CCCA	2	8	115884	115891	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_013260	CGGT	2	8	115906	115913	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013260	GACT	2	8	117037	117044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013260	CGAG	2	8	118362	118369	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013260	GATC	2	8	120604	120611	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013260	ACCG	2	8	125269	125276	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013260	CAGG	2	8	127055	127062	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013260	TTTC	2	8	138416	138423	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013260	TAGA	2	8	142937	142944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013260	CCTA	2	8	145545	145552	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013260	GTAC	2	8	150135	150142	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013260	GCCT	2	8	150332	150339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013260	GTAG	2	8	151433	151440	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013260	ACTC	2	8	152016	152023	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013260	TATC	2	8	162759	162766	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013260	TGCC	2	8	169753	169760	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013260	CGGC	2	8	191803	191810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013260	GGGT	2	8	191847	191854	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013260	TCGC	2	8	193940	193947	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013260	GGTG	2	8	196172	196179	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013260	GGAA	2	8	196657	196664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013260	GAAC	2	8	196725	196732	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013260	TAAA	2	8	197462	197469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013260	TGCC	2	8	197498	197505	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013260	AGGG	2	8	197802	197809	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013260	ATCG	2	8	200909	200916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013260	TGCC	2	8	204905	204912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013260	TTCA	2	8	205057	205064	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013260	GGAG	2	8	210310	210317	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013260	CTGC	2	8	213809	213816	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013260	CCCT	2	8	217869	217876	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_013260	TCTA	2	8	217889	217896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013260	AATC	2	8	217970	217977	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013260	AGGA	2	8	246403	246410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013260	GAGT	2	8	259073	259080	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013260	TGGG	2	8	259181	259188	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013260	GCCA	2	8	260506	260513	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013260	CGCC	2	8	261582	261589	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_013260	AGGG	2	8	274632	274639	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013260	CTTG	2	8	287962	287969	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013260	ATCT	2	8	288389	288396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013260	ACGT	2	8	288431	288438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013260	CTTG	2	8	288574	288581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013260	TTAC	2	8	288639	288646	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013260	CATC	2	8	288678	288685	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013260	TGGT	2	8	288719	288726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013260	GGCC	2	8	290522	290529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013260	TTCC	2	8	296299	296306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013260	GGAA	2	8	296424	296431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013260	GAGG	2	8	305143	305150	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013260	TGAC	2	8	310950	310957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013260	TGCG	2	8	310993	311000	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013260	CAGG	2	8	311009	311016	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013260	TCCC	2	8	311416	311423	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_013260	AAAG	2	8	311561	311568	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013260	GGTC	2	8	312381	312388	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013260	CGGG	2	8	313882	313889	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013260	CCCG	2	8	313896	313903	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_013260	GTGC	2	8	323902	323909	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013260	CCCT	2	8	330079	330086	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_013260	AAGG	2	8	330336	330343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013260	GGCC	2	8	330937	330944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013260	ATCC	2	8	334884	334891	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013260	GCCG	2	8	334917	334924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013260	GGCC	2	8	337099	337106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013260	TTTC	2	8	346736	346743	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013260	GCGA	2	8	346750	346757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013260	CGTT	2	8	347565	347572	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013260	GCCC	2	8	349617	349624	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_013260	GCCG	2	8	359524	359531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013260	CATC	2	8	360177	360184	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013260	AGGG	2	8	360711	360718	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013260	AGGC	2	8	360814	360821	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013260	GATC	2	8	370780	370787	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013260	GCCT	2	8	372473	372480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_013260	CACC	3	12	372567	372578	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_013260	GGGC	2	8	373168	373175	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013260	TCCC	2	8	373994	374001	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_013260	TCCT	2	8	381621	381628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013260	TGGA	2	8	382461	382468	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013260	TGAG	2	8	392969	392976	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013260	TTCG	2	8	407953	407960	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013260	TCCA	2	8	408513	408520	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013260	GCCC	2	8	412317	412324	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_013260	ATCC	2	8	412344	412351	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013260	TGGG	2	8	412406	412413	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013260	AATC	2	8	412629	412636	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013260	ACGG	2	8	416772	416779	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013260	GCCG	2	8	419823	419830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013260	GGGA	2	8	436327	436334	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013260	AGGC	2	8	436994	437001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013260	CGCC	2	8	438903	438910	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_013260	GATC	2	8	454430	454437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013260	GGAC	2	8	454461	454468	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013260	ACGA	2	8	455100	455107	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_013260	GCTT	2	8	457816	457823	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013260	TAAT	2	8	471554	471561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013260	CCTG	2	8	472064	472071	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013260	GAGG	2	8	484080	484087	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013260	CAGG	2	8	491601	491608	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013260	GTTC	2	8	492148	492155	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_013260	TCCT	2	8	494390	494397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013260	TGAC	2	8	513783	513790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_013260	CCCA	2	8	513844	513851	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_013260	CCTC	2	8	513898	513905	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
145	NC_013260	CCGC	2	8	513968	513975	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
146	NC_013260	CGAT	2	8	514045	514052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013260	TCGA	2	8	518312	518319	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_013260	GGGT	2	8	518374	518381	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013260	GGTT	2	8	518514	518521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013260	GGGA	2	8	523378	523385	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013260	CCAT	2	8	533238	533245	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_013260	TCCC	2	8	537561	537568	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
153	NC_013260	AGGG	2	8	537799	537806	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_013260	GCCT	2	8	545266	545273	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
157	NC_013260	GTGA	2	8	545328	545335	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_013260	ATCG	2	8	1735906	1735913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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490	NC_013260	AAAG	2	8	1746088	1746095	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
491	NC_013260	CAAG	2	8	1775466	1775473	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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496	NC_013260	TACC	2	8	1811074	1811081	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
497	NC_013260	GAAG	2	8	1811095	1811102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
498	NC_013260	TCTT	2	8	1814586	1814593	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
499	NC_013260	CGAT	2	8	1815858	1815865	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_013260	TGCC	2	8	1822032	1822039	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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