MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1 chromosome

Total Repeats: 13928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013194	CAA	2	6	339639	339644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_013194	CTC	2	6	339648	339653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_013194	CCGC	2	8	339695	339702	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1004	NC_013194	GCG	2	6	339800	339805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_013194	TCA	2	6	339821	339826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_013194	CGC	2	6	339950	339955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_013194	ATCG	2	8	339972	339979	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_013194	CCG	2	6	339984	339989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_013194	TC	4	8	340059	340066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_013194	TC	3	6	340069	340074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_013194	GCGAA	2	10	340600	340609	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1012	NC_013194	GCC	2	6	340618	340623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_013194	TCG	2	6	343212	343217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_013194	ACG	2	6	346024	346029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_013194	CTGC	2	8	347547	347554	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_013194	CG	3	6	347588	347593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_013194	A	6	6	348134	348139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_013194	CG	3	6	348143	348148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_013194	CCAA	2	8	349677	349684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_013194	GAA	2	6	349686	349691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_013194	GA	3	6	349695	349700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_013194	AG	3	6	349716	349721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_013194	TGAA	2	8	349764	349771	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_013194	AGG	2	6	349780	349785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_013194	AGG	2	6	349787	349792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_013194	GCT	2	6	349843	349848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_013194	GCG	2	6	349853	349858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_013194	GGC	2	6	350475	350480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_013194	GGGCG	2	10	350980	350989	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1030	NC_013194	GGC	2	6	350997	351002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_013194	AG	3	6	354222	354227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_013194	CCG	3	9	354274	354282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_013194	GGC	2	6	354335	354340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_013194	TTG	2	6	354345	354350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_013194	CAC	2	6	354446	354451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_013194	GGC	2	6	355312	355317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_013194	CGG	2	6	357548	357553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_013194	TCA	3	9	357554	357562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_013194	ACA	2	6	358512	358517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_013194	ACG	2	6	358524	358529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_013194	TGA	2	6	365251	365256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_013194	A	6	6	365256	365261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_013194	C	7	7	365382	365388	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1044	NC_013194	T	7	7	365401	365407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_013194	TGGA	2	8	366129	366136	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_013194	GAG	2	6	366158	366163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_013194	TTG	2	6	366188	366193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_013194	TGT	2	6	366223	366228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_013194	GC	4	8	366885	366892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_013194	C	6	6	366914	366919	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1051	NC_013194	AAG	2	6	366953	366958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_013194	GCG	2	6	367464	367469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_013194	TC	4	8	367497	367504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_013194	CACG	2	8	367515	367522	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_013194	GC	3	6	367523	367528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_013194	CTG	2	6	368286	368291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_013194	GCC	2	6	368312	368317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_013194	CGG	2	6	368328	368333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_013194	GCC	2	6	368434	368439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_013194	TCC	2	6	368496	368501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_013194	CGGA	2	8	368535	368542	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_013194	TGC	2	6	368554	368559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_013194	CGT	2	6	368625	368630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_013194	ATC	2	6	368639	368644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_013194	GGA	2	6	368656	368661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_013194	GGAA	2	8	372852	372859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_013194	TG	3	6	372945	372950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_013194	CGGC	2	8	372959	372966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_013194	GCAA	2	8	374725	374732	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_013194	CGG	2	6	375689	375694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_013194	TAA	2	6	375705	375710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_013194	TCA	2	6	375735	375740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_013194	CCG	4	12	379111	379122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_013194	TCGCCG	2	12	379124	379135	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_013194	ATCA	2	8	379153	379160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_013194	CGG	2	6	379662	379667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_013194	CGTC	2	8	379687	379694	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_013194	CGG	2	6	379734	379739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_013194	ACG	2	6	379768	379773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_013194	GCGT	2	8	379820	379827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_013194	GTC	2	6	379830	379835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_013194	CG	3	6	379838	379843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_013194	CGC	2	6	379866	379871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_013194	GCG	2	6	379928	379933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_013194	TGC	2	6	379972	379977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_013194	GATCT	2	10	380011	380020	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1087	NC_013194	GCG	2	6	380023	380028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_013194	CGAG	2	8	380040	380047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_013194	CAG	2	6	380110	380115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_013194	GAG	2	6	381433	381438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_013194	GCAA	2	8	381503	381510	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_013194	GCC	2	6	382136	382141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_013194	AAC	2	6	382218	382223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_013194	GCA	2	6	382234	382239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_013194	ACA	2	6	382341	382346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_013194	GCC	2	6	382364	382369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_013194	TGC	2	6	382417	382422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_013194	GAC	2	6	386351	386356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_013194	CTT	2	6	390466	390471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_013194	GGC	2	6	390541	390546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_013194	GCC	2	6	390584	390589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_013194	TGCC	2	8	390607	390614	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_013194	CGAA	2	8	390649	390656	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_013194	TGC	2	6	390826	390831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_013194	AGG	2	6	393160	393165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_013194	GAG	2	6	393773	393778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_013194	CTGA	2	8	395420	395427	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_013194	CGG	2	6	395431	395436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_013194	GC	3	6	395524	395529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_013194	ATCG	2	8	395609	395616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_013194	TGC	2	6	395700	395705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_013194	TGG	2	6	395706	395711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_013194	CG	4	8	395713	395720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_013194	GCAG	2	8	395723	395730	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_013194	ATGC	2	8	395779	395786	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_013194	GCC	2	6	397605	397610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_013194	CGC	2	6	397628	397633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_013194	CCAG	2	8	397638	397645	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_013194	CAT	2	6	397665	397670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_013194	AGC	2	6	397688	397693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_013194	GATC	2	8	397709	397716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_013194	GCT	2	6	397773	397778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_013194	CCG	2	6	397849	397854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_013194	AC	3	6	403479	403484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_013194	TGCC	2	8	404128	404135	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_013194	GCTGCC	2	12	404136	404147	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_013194	CGCGA	2	10	404192	404201	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1128	NC_013194	ACG	2	6	404234	404239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_013194	GC	3	6	404267	404272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_013194	GAG	2	6	404333	404338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_013194	GCC	2	6	406009	406014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_013194	GGC	2	6	406015	406020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_013194	CTG	2	6	410054	410059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_013194	GCCCAA	2	12	412141	412152	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_013194	GC	3	6	412287	412292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_013194	AGAA	2	8	412307	412314	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1254	NC_013194	ACG	2	6	432265	432270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1258	NC_013194	GTC	2	6	432536	432541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1261	NC_013194	CTC	2	6	432779	432784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1262	NC_013194	CGC	2	6	432804	432809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1263	NC_013194	ACG	2	6	432815	432820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1265	NC_013194	CCTG	2	8	432882	432889	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1266	NC_013194	CGCC	2	8	435349	435356	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1267	NC_013194	CCA	2	6	435362	435367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1268	NC_013194	ACG	2	6	435394	435399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1271	NC_013194	GAT	2	6	443920	443925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1277	NC_013194	ACG	2	6	456602	456607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1282	NC_013194	GTT	2	6	456928	456933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1292	NC_013194	GCA	2	6	464248	464253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1294	NC_013194	TCGA	2	8	465625	465632	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1316	NC_013194	TCG	2	6	475111	475116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1332	NC_013194	GGC	2	6	483069	483074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1334	NC_013194	CGG	2	6	483116	483121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1405	NC_013194	CTT	2	6	517829	517834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1406	NC_013194	TCAT	2	8	518119	518126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1407	NC_013194	GGC	2	6	518161	518166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1411	NC_013194	CG	3	6	518209	518214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1452	NC_013194	CG	3	6	530301	530306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1495	NC_013194	CTCGC	2	10	553127	553136	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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