MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cryptobacterium curtum DSM 15641 chromosome

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013170	TACAC	2	10	90	99	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_013170	TCGTG	2	10	13880	13889	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013170	TCGGA	2	10	14111	14120	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013170	ACCTG	2	10	14948	14957	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_013170	GAGCA	2	10	15452	15461	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013170	TCGTG	2	10	18085	18094	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013170	CAATA	2	10	23035	23044	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013170	GCATT	2	10	30620	30629	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013170	GGGAA	2	10	54280	54289	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013170	CGAGA	2	10	56231	56240	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013170	AGCGC	2	10	56497	56506	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_013170	AAATG	2	10	75834	75843	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013170	AAGGA	2	10	82659	82668	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013170	GGCAT	2	10	146604	146613	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013170	GCTTG	2	10	155442	155451	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013170	GCAAT	2	10	169357	169366	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013170	AAATC	2	10	184085	184094	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013170	TTCGT	2	10	187857	187866	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013170	CCTTG	2	10	193971	193980	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_013170	CCGTT	2	10	194259	194268	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_013170	AGTTG	2	10	200284	200293	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013170	TACAC	2	10	207950	207959	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_013170	ATGTG	2	10	216514	216523	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013170	TGCGC	2	10	219073	219082	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_013170	AGACA	2	10	219206	219215	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013170	GAAAT	2	10	220756	220765	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013170	CACAT	2	10	225580	225589	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_013170	AAGAA	2	10	231831	231840	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013170	ACTAT	2	10	234828	234837	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013170	TACTT	2	10	253052	253061	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013170	CGTAT	2	10	264031	264040	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013170	TCGTG	2	10	285763	285772	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_013170	TCGGA	2	10	285994	286003	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013170	ACCTG	2	10	286831	286840	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_013170	GAGCA	2	10	287335	287344	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_013170	TCGTG	2	10	289968	289977	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_013170	TATGT	2	10	313409	313418	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013170	TCCGC	2	10	341647	341656	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_013170	ACTCA	2	10	348630	348639	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_013170	GATGT	2	10	397234	397243	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013170	AAACG	2	10	398412	398421	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_013170	GAAAA	2	10	398738	398747	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013170	ATTGC	2	10	400695	400704	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013170	GCCAA	2	10	407268	407277	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_013170	TCCCT	2	10	410126	410135	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
46	NC_013170	GCCAA	2	10	420540	420549	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_013170	TGGTG	2	10	428500	428509	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013170	GAGTG	2	10	432042	432051	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013170	AAAAC	2	10	436205	436214	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013170	ATTTC	2	10	436466	436475	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013170	GCTCT	2	10	467851	467860	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_013170	GGTTT	2	10	476408	476417	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013170	TGTTT	2	10	486070	486079	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013170	GGGGA	2	10	488681	488690	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013170	ACCGC	2	10	495894	495903	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_013170	GGAAG	2	10	495908	495917	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013170	GGAAA	2	10	510095	510104	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013170	GGTAC	2	10	519430	519439	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013170	AAGCG	2	10	519504	519513	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_013170	GAGCA	2	10	519551	519560	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_013170	TATTT	2	10	525050	525059	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013170	GAAAT	2	10	527869	527878	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013170	TCTTA	2	10	538300	538309	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013170	GTCTG	2	10	544761	544770	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013170	CTGTT	2	10	554809	554818	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_013170	TTTTC	2	10	567705	567714	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_013170	CTGGT	2	10	572296	572305	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013170	ACCCC	2	10	598349	598358	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
69	NC_013170	GACTT	2	10	598551	598560	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_013170	GAAGG	2	10	634626	634635	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013170	TTTTC	2	10	640110	640119	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013170	CCAAG	2	10	641392	641401	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_013170	TTTGA	2	10	656709	656718	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013170	TTGGT	2	10	663941	663950	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013170	ACGCA	2	10	664250	664259	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_013170	CTCAT	2	10	676390	676399	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_013170	ACACA	2	10	687218	687227	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_013170	CGTAT	2	10	699137	699146	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_013170	TGTGC	2	10	705841	705850	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013170	GTGTA	2	10	705910	705919	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013170	GAAAG	2	10	709751	709760	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013170	AGGGG	2	10	733705	733714	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013170	TAGGA	2	10	736308	736317	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013170	GAGAA	2	10	740244	740253	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013170	AGGAA	2	10	748664	748673	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013170	GATAA	2	10	749068	749077	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013170	AAAGT	2	10	764348	764357	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013170	TGACA	2	10	813144	813153	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013170	AAGGA	2	10	813209	813218	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013170	ACATA	2	10	851571	851580	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_013170	CCCTA	2	10	854116	854125	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
92	NC_013170	CCTTT	2	10	871224	871233	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_013170	GACGT	2	10	876358	876367	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_013170	CTGCT	2	10	888103	888112	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_013170	GTTAG	2	10	928547	928556	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013170	AGCTG	2	10	936751	936760	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_013170	AATTC	2	10	936937	936946	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_013170	CCCTG	2	10	940031	940040	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
99	NC_013170	GGAAG	2	10	981923	981932	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013170	AGTAA	2	10	997685	997694	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013170	CAGCA	2	10	997783	997792	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_013170	AAATC	2	10	999327	999336	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_013170	GTAAT	2	10	1000749	1000758	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013170	AAGGC	2	10	1000807	1000816	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_013170	TGCCT	2	10	1000838	1000847	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_013170	GCTAA	2	10	1000979	1000988	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_013170	ATCGC	2	10	1001034	1001043	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_013170	TGTTT	2	10	1002218	1002227	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013170	ATTCA	2	10	1008764	1008773	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_013170	AGAAT	2	10	1010384	1010393	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013170	CGGCT	2	10	1018167	1018176	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_013170	TACGC	2	10	1018487	1018496	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_013170	ACAGG	2	10	1026318	1026327	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_013170	CACGA	2	10	1026506	1026515	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_013170	TGCTC	2	10	1029139	1029148	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_013170	CAGGT	2	10	1029643	1029652	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_013170	TCCGA	2	10	1030480	1030489	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_013170	CACGA	2	10	1030711	1030720	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_013170	TTCCT	2	10	1033240	1033249	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_013170	CGTTA	2	10	1038210	1038219	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_013170	AAACA	2	10	1061666	1061675	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_013170	TTCGC	2	10	1065928	1065937	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_013170	AAAGG	2	10	1071822	1071831	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013170	GGCGA	2	10	1079021	1079030	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
125	NC_013170	AGAAA	2	10	1079049	1079058	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013170	GAAAA	2	10	1081948	1081957	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013170	TCCAC	2	10	1117212	1117221	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_013170	CAGAG	2	10	1122812	1122821	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_013170	CTTCT	2	10	1172360	1172369	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_013170	TGAAT	2	10	1208221	1208230	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013170	CGTTC	2	10	1241301	1241310	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_013170	TAGCC	2	10	1249600	1249609	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_013170	GTTCC	2	10	1262951	1262960	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_013170	GAAAA	2	10	1282054	1282063	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013170	GAAAA	2	10	1290158	1290167	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013170	TCCTT	2	10	1293152	1293161	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_013170	CTCTA	2	10	1301384	1301393	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_013170	CGCGG	2	10	1303405	1303414	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
139	NC_013170	GCTTT	2	10	1317948	1317957	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_013170	CTTAC	2	10	1318147	1318156	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_013170	TTGCA	2	10	1319615	1319624	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_013170	TCCTT	2	10	1321049	1321058	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_013170	CAAAG	2	10	1328016	1328025	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_013170	ATCCA	2	10	1328795	1328804	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_013170	TATTG	2	10	1339543	1339552	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013170	GAACC	2	10	1344651	1344660	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_013170	CGCTG	2	10	1349440	1349449	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
148	NC_013170	TTAAT	2	10	1353638	1353647	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013170	AAGGA	2	10	1362528	1362537	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013170	CAAAC	2	10	1362556	1362565	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
151	NC_013170	CGCGT	2	10	1431717	1431726	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
152	NC_013170	TTGCA	2	10	1436154	1436163	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
153	NC_013170	CTCAG	2	10	1443241	1443250	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
154	NC_013170	AAACC	2	10	1444397	1444406	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
155	NC_013170	CGTCT	2	10	1454936	1454945	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
156	NC_013170	AACCT	2	10	1463821	1463830	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
157	NC_013170	CAAGC	2	10	1492084	1492093	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
158	NC_013170	AGAAA	2	10	1492652	1492661	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013170	CTTTT	2	10	1506486	1506495	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_013170	TCCCT	2	10	1511085	1511094	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
161	NC_013170	AGCAA	2	10	1518960	1518969	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
162	NC_013170	CATGC	2	10	1531787	1531796	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
163	NC_013170	ATGAC	2	10	1546672	1546681	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
164	NC_013170	TCCAC	2	10	1562129	1562138	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
165	NC_013170	CTCAC	2	10	1565280	1565289	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
166	NC_013170	CTGCA	2	10	1575564	1575573	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
167	NC_013170	AAAGC	2	10	1610688	1610697	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
168	NC_013170	ATTTT	2	10	1616617	1616626	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.