MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880202

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013163	TCC	2	6	9	14	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_013163	ATT	2	6	517	522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013163	CTT	2	6	1884	1889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013163	AAT	2	6	1942	1947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013163	TCC	2	6	1989	1994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_013163	CAA	2	6	2068	2073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013163	TGG	2	6	2218	2223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013163	TCC	2	6	2290	2295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013163	CGT	2	6	2316	2321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013163	CTT	2	6	2489	2494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013163	TTC	3	9	4586	4594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013163	TTA	2	6	4600	4605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013163	ATC	2	6	4642	4647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013163	CTT	2	6	4651	4656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013163	TCC	2	6	4681	4686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_013163	CGA	2	6	4810	4815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013163	GCT	2	6	4901	4906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013163	AAC	2	6	4936	4941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013163	AAC	2	6	4967	4972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013163	TCT	2	6	5010	5015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013163	TTG	2	6	5241	5246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013163	TGC	2	6	5801	5806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013163	GTA	2	6	7553	7558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013163	TCT	3	9	9654	9662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013163	TGA	2	6	9754	9759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013163	ACA	3	9	9778	9786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013163	ACA	2	6	10543	10548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013163	TAA	2	6	12555	12560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013163	TGG	2	6	12744	12749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013163	TCT	2	6	12890	12895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013163	GAC	2	6	12913	12918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013163	TAA	2	6	13109	13114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013163	CCG	2	6	13155	13160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_013163	TGA	2	6	13267	13272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013163	TGA	2	6	15715	15720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013163	CTC	2	6	19241	19246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_013163	GAT	2	6	19279	19284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013163	CAG	2	6	19312	19317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013163	CCA	2	6	19343	19348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_013163	ATT	2	6	19375	19380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013163	CTT	2	6	19484	19489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013163	ATA	2	6	19859	19864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013163	GCA	2	6	19908	19913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013163	AGT	2	6	19977	19982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013163	AAT	2	6	19984	19989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013163	AAT	2	6	21221	21226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013163	CAG	2	6	21260	21265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013163	ATC	2	6	22214	22219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013163	AGA	2	6	22239	22244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.