MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Capnocytophaga ochracea DSM 7271 chromosome

Total Repeats: 9116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_013162	GA	3	6	2572772	2572777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_013162	GA	3	6	2572788	2572793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_013162	ACG	2	6	2572975	2572980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_013162	A	6	6	2573028	2573033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_013162	T	6	6	2573036	2573041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_013162	GGA	2	6	2573086	2573091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_013162	TGA	2	6	2573128	2573133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_013162	A	6	6	2573133	2573138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_013162	AGG	2	6	2573146	2573151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_013162	AG	3	6	2573167	2573172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_013162	TA	3	6	2573219	2573224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_013162	TGAT	2	8	2573227	2573234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_013162	CAT	2	6	2573238	2573243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_013162	ACA	2	6	2573250	2573255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_013162	GAAA	2	8	2573286	2573293	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_013162	AGA	2	6	2573347	2573352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_013162	AAT	2	6	2573356	2573361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_013162	TAG	2	6	2573370	2573375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_013162	GGA	2	6	2573401	2573406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_013162	ATT	2	6	2573441	2573446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_013162	GAAA	2	8	2576775	2576782	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_013162	A	7	7	2576780	2576786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_013162	T	6	6	2576822	2576827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_013162	AAT	2	6	2576864	2576869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_013162	ATTTT	2	10	2576906	2576915	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_013162	A	7	7	2576922	2576928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_013162	CAC	2	6	2576944	2576949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9028	NC_013162	AAG	2	6	2576969	2576974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_013162	T	6	6	2579957	2579962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_013162	AAT	2	6	2579968	2579973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_013162	TCATA	2	10	2579979	2579988	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9032	NC_013162	TAATTT	2	12	2580063	2580074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_013162	T	6	6	2580079	2580084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_013162	A	6	6	2580441	2580446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_013162	TTC	2	6	2580459	2580464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9036	NC_013162	T	7	7	2581237	2581243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_013162	CAT	2	6	2581244	2581249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_013162	ATTA	2	8	2581267	2581274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_013162	CAA	2	6	2581299	2581304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9040	NC_013162	CAA	2	6	2581315	2581320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9041	NC_013162	AT	3	6	2582351	2582356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_013162	TA	3	6	2582359	2582364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_013162	TAC	2	6	2582386	2582391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9044	NC_013162	TATC	2	8	2582462	2582469	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9045	NC_013162	A	6	6	2582511	2582516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_013162	G	6	6	2584437	2584442	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_013162	AAT	2	6	2584455	2584460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_013162	ATT	2	6	2584507	2584512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_013162	CAAAC	2	10	2584551	2584560	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9050	NC_013162	TGA	2	6	2584565	2584570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_013162	TGA	2	6	2584582	2584587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_013162	ATT	2	6	2584631	2584636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_013162	AAT	2	6	2586783	2586788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_013162	ATAA	2	8	2588520	2588527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_013162	TCTT	2	8	2588566	2588573	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9056	NC_013162	TTAT	2	8	2589968	2589975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_013162	CTT	2	6	2590000	2590005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9058	NC_013162	TTTA	2	8	2590011	2590018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_013162	TC	3	6	2590031	2590036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9060	NC_013162	TAT	2	6	2590069	2590074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_013162	TAT	2	6	2590087	2590092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_013162	ATTAA	2	10	2590096	2590105	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_013162	A	7	7	2590758	2590764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_013162	TAA	2	6	2590767	2590772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_013162	A	7	7	2590775	2590781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_013162	ATT	2	6	2590788	2590793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_013162	TCG	2	6	2590826	2590831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9068	NC_013162	T	6	6	2591802	2591807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_013162	A	7	7	2591844	2591850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9070	NC_013162	TTTTC	2	10	2591879	2591888	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9071	NC_013162	A	6	6	2593794	2593799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9072	NC_013162	TCC	2	6	2593820	2593825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9073	NC_013162	CTTC	2	8	2593850	2593857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9074	NC_013162	GTTC	2	8	2593898	2593905	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9075	NC_013162	TA	4	8	2593949	2593956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9076	NC_013162	CTA	2	6	2593997	2594002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9077	NC_013162	TATC	2	8	2594018	2594025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9078	NC_013162	TTCG	2	8	2594071	2594078	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9079	NC_013162	TTCG	2	8	2594082	2594089	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9080	NC_013162	CCTG	2	8	2594204	2594211	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9081	NC_013162	TAT	2	6	2594294	2594299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9082	NC_013162	AATA	2	8	2594349	2594356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9083	NC_013162	TA	3	6	2594355	2594360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9084	NC_013162	AT	3	6	2594364	2594369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_013162	CAAATA	2	12	2594389	2594400	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9086	NC_013162	T	6	6	2594409	2594414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_013162	AT	4	8	2594443	2594450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_013162	ATT	2	6	2594481	2594486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9089	NC_013162	AT	3	6	2597500	2597505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9090	NC_013162	A	6	6	2597553	2597558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9091	NC_013162	ACT	2	6	2597566	2597571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9092	NC_013162	A	7	7	2597608	2597614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9093	NC_013162	AAT	2	6	2601444	2601449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9094	NC_013162	GTTT	2	8	2601459	2601466	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_013162	AAAT	2	8	2601473	2601480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_013162	TAT	2	6	2602714	2602719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9097	NC_013162	TAC	2	6	2602779	2602784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9098	NC_013162	GTTC	2	8	2602848	2602855	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9099	NC_013162	GTTC	2	8	2602859	2602866	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9100	NC_013162	GTTC	2	8	2602870	2602877	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9101	NC_013162	GTTC	2	8	2602881	2602888	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9102	NC_013162	ATT	2	6	2602911	2602916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_013162	ATT	2	6	2603030	2603035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_013162	ATT	2	6	2603039	2603044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_013162	A	8	8	2603068	2603075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9106	NC_013162	A	6	6	2603109	2603114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9107	NC_013162	TAA	2	6	2604012	2604017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_013162	CCT	2	6	2605101	2605106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9109	NC_013162	T	6	6	2605130	2605135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_013162	TAA	2	6	2606698	2606703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_013162	T	6	6	2607725	2607730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_013162	T	7	7	2608484	2608490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_013162	ACT	2	6	2610528	2610533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9114	NC_013162	TTA	2	6	2610546	2610551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_013162	T	6	6	2612833	2612838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_013162	CA	3	6	2612895	2612900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.