MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 8033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013161	TCA	2	6	21	26	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013161	TAA	2	6	76	81	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013161	TTC	2	6	1539	1544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013161	AAC	2	6	1753	1758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013161	ATT	2	6	1767	1772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013161	TAA	2	6	3045	3050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013161	TGA	2	6	3845	3850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013161	AAC	2	6	3861	3866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013161	TAA	2	6	3877	3882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013161	ATT	2	6	4197	4202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013161	GTT	2	6	4207	4212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013161	TAT	2	6	4228	4233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013161	ATC	2	6	9517	9522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013161	TGA	2	6	9531	9536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013161	CTA	2	6	9546	9551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013161	TAA	2	6	10422	10427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013161	GAT	2	6	10440	10445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013161	TCA	2	6	10466	10471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013161	TGT	2	6	10521	10526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013161	AAT	2	6	10536	10541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013161	TTA	2	6	10548	10553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013161	TTA	2	6	14420	14425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013161	ATA	2	6	15069	15074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013161	AGA	2	6	15126	15131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013161	AAT	2	6	15137	15142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013161	AAT	2	6	15518	15523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013161	TAA	2	6	15535	15540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013161	AGT	2	6	16074	16079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013161	TTA	2	6	17858	17863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013161	TAT	2	6	17928	17933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013161	CCT	2	6	17942	17947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_013161	TCA	2	6	18129	18134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013161	TTC	2	6	22733	22738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013161	TGT	2	6	22754	22759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013161	CTA	2	6	22782	22787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013161	TTC	2	6	25221	25226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013161	TCT	2	6	25317	25322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013161	ATT	2	6	27522	27527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013161	TAA	2	6	27550	27555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013161	AAT	2	6	27763	27768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013161	ATG	2	6	30067	30072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013161	CTT	2	6	30090	30095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013161	ACT	2	6	30127	30132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013161	TAG	2	6	30160	30165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013161	TAT	2	6	30183	30188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013161	TTC	2	6	30231	30236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013161	ATG	2	6	32991	32996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013161	TAC	2	6	33062	33067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013161	TTG	2	6	33191	33196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013161	TAT	2	6	33234	33239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013161	AAT	2	6	33625	33630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013161	ACT	2	6	33781	33786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013161	ATT	3	9	36494	36502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013161	TAC	2	6	36529	36534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013161	ACC	2	6	36557	36562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_013161	TAA	2	6	37666	37671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013161	CTC	2	6	39541	39546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_013161	TAC	2	6	39563	39568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013161	TCC	2	6	39581	39586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_013161	TGA	2	6	39624	39629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013161	CAA	2	6	39636	39641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013161	ATA	2	6	39671	39676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013161	ATG	2	6	39697	39702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013161	TCA	2	6	39766	39771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013161	TTA	2	6	39849	39854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013161	AAT	2	6	43798	43803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013161	AAT	2	6	49274	49279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013161	ATT	2	6	55031	55036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013161	TAG	2	6	55821	55826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013161	GGA	2	6	58472	58477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013161	ATT	3	9	58564	58572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013161	AAC	2	6	58681	58686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013161	ATT	2	6	58714	58719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013161	TAT	2	6	60190	60195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013161	ATC	3	9	61060	61068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013161	CTC	2	6	62666	62671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_013161	ATC	2	6	63165	63170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013161	TAA	2	6	64271	64276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013161	CAA	2	6	64390	64395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013161	CTA	2	6	64425	64430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013161	TAC	2	6	64534	64539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013161	AGC	2	6	64588	64593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013161	TCT	2	6	64634	64639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013161	CTA	2	6	64650	64655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013161	AAG	2	6	64774	64779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013161	GGA	2	6	64818	64823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013161	CCG	2	6	66931	66936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_013161	TGT	2	6	68123	68128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013161	ATT	2	6	69543	69548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013161	TAA	3	9	69584	69592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013161	GAT	2	6	69641	69646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013161	AGA	2	6	69669	69674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013161	TAA	2	6	69696	69701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013161	TAA	2	6	75322	75327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013161	AAT	2	6	83893	83898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013161	CCT	2	6	90325	90330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_013161	CCT	2	6	90332	90337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_013161	CCT	2	6	90339	90344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_013161	CCT	2	6	90346	90351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_013161	GGT	2	6	91499	91504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013161	ATT	2	6	91630	91635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013161	TAT	2	6	92913	92918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013161	TGT	2	6	92944	92949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013161	ATG	2	6	92998	93003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013161	GCT	2	6	93652	93657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013161	GTA	2	6	93715	93720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013161	AGA	2	6	93725	93730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013161	TCC	2	6	94415	94420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_013161	GAT	2	6	94519	94524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013161	TCG	2	6	94526	94531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013161	ATC	2	6	94544	94549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013161	TAA	2	6	94552	94557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013161	GTA	2	6	97409	97414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013161	TAT	2	6	97415	97420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013161	AGA	2	6	97437	97442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013161	TTA	2	6	99045	99050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013161	ATT	2	6	99603	99608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013161	ATG	2	6	99614	99619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013161	AAT	3	9	99620	99628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013161	ATT	2	6	102586	102591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013161	ACA	2	6	102708	102713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013161	TAC	2	6	103756	103761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013161	TAA	2	6	103795	103800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013161	TGA	2	6	104635	104640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013161	TAA	2	6	104669	104674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013161	CTA	2	6	104685	104690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013161	CCT	2	6	104729	104734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_013161	TTG	2	6	104753	104758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013161	TTA	2	6	106241	106246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013161	AGA	2	6	106275	106280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013161	AGA	2	6	106332	106337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013161	TTC	2	6	106340	106345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013161	CGA	2	6	106368	106373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013161	CTG	2	6	106458	106463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013161	TAA	2	6	106517	106522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013161	ATT	2	6	108872	108877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013161	TTA	2	6	109373	109378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013161	GAA	2	6	109388	109393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013161	TCT	2	6	109501	109506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013161	CAA	2	6	110206	110211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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274	NC_013161	GTT	2	6	178152	178157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
275	NC_013161	AGG	3	9	178819	178827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_013161	ATT	2	6	179038	179043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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