MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 14557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013161	GGT	2	6	1145368	1145373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_013161	CAT	2	6	1145374	1145379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_013161	ATA	2	6	1145429	1145434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_013161	T	6	6	1146234	1146239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_013161	TAT	2	6	1146326	1146331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_013161	GATTA	2	10	1148232	1148241	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_013161	AAT	2	6	1148288	1148293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_013161	ATC	2	6	1148320	1148325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_013161	TAA	2	6	1148327	1148332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_013161	TAG	2	6	1149958	1149963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_013161	CGT	2	6	1150012	1150017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_013161	TAA	2	6	1151752	1151757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_013161	TC	3	6	1151837	1151842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_013161	TAA	2	6	1151901	1151906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_013161	ATT	2	6	1152003	1152008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_013161	TCA	2	6	1153175	1153180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_013161	TCA	2	6	1153182	1153187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_013161	GTT	2	6	1155041	1155046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_013161	ACTT	2	8	1155101	1155108	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3520	NC_013161	T	7	7	1155130	1155136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_013161	AAT	2	6	1155153	1155158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_013161	TAA	2	6	1155239	1155244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_013161	TCTT	2	8	1157166	1157173	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3524	NC_013161	GATC	2	8	1157204	1157211	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3525	NC_013161	TTC	2	6	1157361	1157366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_013161	AGATT	2	10	1158822	1158831	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_013161	AGA	2	6	1158839	1158844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_013161	ACA	2	6	1158854	1158859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_013161	TGA	2	6	1158863	1158868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_013161	GTCT	2	8	1159091	1159098	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3531	NC_013161	ATGCA	2	10	1159138	1159147	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3532	NC_013161	GGT	2	6	1159171	1159176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_013161	TTC	2	6	1161946	1161951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_013161	CTA	2	6	1161982	1161987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_013161	A	6	6	1162000	1162005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_013161	TAA	2	6	1162014	1162019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_013161	GTT	2	6	1162985	1162990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_013161	AAG	2	6	1163012	1163017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_013161	TAG	2	6	1163025	1163030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_013161	AAT	2	6	1163411	1163416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_013161	T	6	6	1163446	1163451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_013161	TTAA	2	8	1163625	1163632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_013161	CTT	2	6	1163646	1163651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_013161	ATCG	2	8	1163665	1163672	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3545	NC_013161	ATT	2	6	1163693	1163698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_013161	AAT	3	9	1163715	1163723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_013161	AAT	2	6	1164116	1164121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_013161	CAT	2	6	1164156	1164161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_013161	TAT	2	6	1164214	1164219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_013161	ATAA	2	8	1164226	1164233	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_013161	CTT	2	6	1164255	1164260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_013161	TAA	2	6	1164261	1164266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_013161	AAC	2	6	1164296	1164301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_013161	T	6	6	1164345	1164350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_013161	AAT	2	6	1164384	1164389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_013161	TGT	2	6	1164415	1164420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_013161	ATA	2	6	1164457	1164462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_013161	T	7	7	1164482	1164488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_013161	GGT	2	6	1166095	1166100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_013161	TTG	2	6	1166102	1166107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_013161	AAT	2	6	1166126	1166131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_013161	GTA	2	6	1166516	1166521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_013161	AAT	2	6	1166563	1166568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_013161	GAT	2	6	1166667	1166672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_013161	ATT	2	6	1166745	1166750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_013161	ACG	2	6	1169699	1169704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_013161	TGA	2	6	1169731	1169736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_013161	TAA	2	6	1169751	1169756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_013161	TAT	2	6	1171412	1171417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_013161	GATA	2	8	1171424	1171431	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_013161	TGGG	2	8	1171880	1171887	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_013161	T	6	6	1171944	1171949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_013161	TA	3	6	1172583	1172588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_013161	ATA	2	6	1172620	1172625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_013161	T	7	7	1172656	1172662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_013161	CTT	2	6	1172677	1172682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_013161	TTA	2	6	1173399	1173404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_013161	GTT	2	6	1173410	1173415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_013161	T	7	7	1175260	1175266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_013161	ATA	2	6	1175305	1175310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_013161	GAATT	2	10	1175315	1175324	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_013161	A	6	6	1175641	1175646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_013161	TCT	3	9	1176408	1176416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_013161	AGCA	2	8	1176425	1176432	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3585	NC_013161	CTC	2	6	1176439	1176444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3586	NC_013161	T	6	6	1176456	1176461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_013161	TC	3	6	1176477	1176482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_013161	AG	3	6	1176576	1176581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_013161	TGC	2	6	1176815	1176820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_013161	T	6	6	1176840	1176845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_013161	TAA	2	6	1176877	1176882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_013161	AAAT	2	8	1176887	1176894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_013161	AGA	2	6	1176908	1176913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_013161	AATG	2	8	1176978	1176985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_013161	AATC	2	8	1178092	1178099	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3596	NC_013161	ATT	2	6	1179069	1179074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_013161	TTAA	2	8	1179082	1179089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_013161	TAC	2	6	1179098	1179103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_013161	TCAAT	2	10	1179133	1179142	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3600	NC_013161	GGT	2	6	1179547	1179552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_013161	GGT	2	6	1179620	1179625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_013161	ACCT	2	8	1179795	1179802	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3603	NC_013161	TTA	2	6	1179816	1179821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_013161	T	6	6	1179871	1179876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_013161	ATTA	2	8	1179893	1179900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_013161	AAT	2	6	1180733	1180738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_013161	GCA	2	6	1180846	1180851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_013161	ATTG	2	8	1180865	1180872	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_013161	TTTA	2	8	1180877	1180884	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_013161	TACT	2	8	1180893	1180900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3611	NC_013161	AAT	2	6	1180915	1180920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_013161	A	7	7	1180944	1180950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_013161	T	6	6	1180955	1180960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_013161	AACT	2	8	1180977	1180984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3615	NC_013161	ATT	2	6	1180999	1181004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_013161	TAA	2	6	1181010	1181015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_013161	TAA	2	6	1182271	1182276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_013161	TGA	2	6	1182284	1182289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_013161	GAG	2	6	1182315	1182320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_013161	TCA	2	6	1183975	1183980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_013161	CCCT	2	8	1184436	1184443	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3622	NC_013161	TAA	2	6	1184458	1184463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_013161	CAC	2	6	1184665	1184670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_013161	TTC	2	6	1184722	1184727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_013161	GTA	2	6	1184815	1184820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_013161	T	6	6	1184832	1184837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_013161	CATT	2	8	1184859	1184866	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3628	NC_013161	AAG	2	6	1184880	1184885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_013161	A	9	9	1184925	1184933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_013161	TGA	2	6	1184948	1184953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3632	NC_013161	TAG	2	6	1185966	1185971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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