MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 14557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_013161	GAT	2	6	2521901	2521906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_013161	TTC	2	6	2521944	2521949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_013161	CCT	2	6	2521984	2521989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8004	NC_013161	T	6	6	2522067	2522072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_013161	ACT	2	6	2522097	2522102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_013161	AACA	2	8	2522177	2522184	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8007	NC_013161	AT	3	6	2522201	2522206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_013161	TAAA	2	8	2522217	2522224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_013161	ATC	2	6	2522298	2522303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_013161	ATC	2	6	2522310	2522315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_013161	AAT	2	6	2522367	2522372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_013161	ATTA	2	8	2522442	2522449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_013161	T	8	8	2522501	2522508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_013161	AAT	2	6	2522535	2522540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_013161	T	8	8	2522552	2522559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_013161	TA	3	6	2522567	2522572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_013161	GTCA	2	8	2522655	2522662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8018	NC_013161	AATT	2	8	2522681	2522688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_013161	A	6	6	2522740	2522745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_013161	AAT	2	6	2522765	2522770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_013161	TTC	2	6	2522805	2522810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_013161	T	7	7	2522816	2522822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_013161	CTG	2	6	2522823	2522828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_013161	TAA	2	6	2522870	2522875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_013161	CTAT	2	8	2522908	2522915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8026	NC_013161	ATC	2	6	2522940	2522945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_013161	CTTT	2	8	2522979	2522986	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8028	NC_013161	A	6	6	2522995	2523000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_013161	TAA	2	6	2523003	2523008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_013161	ATTTA	2	10	2523036	2523045	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_013161	TAG	2	6	2523128	2523133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_013161	A	6	6	2523193	2523198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_013161	T	6	6	2523204	2523209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_013161	ATT	2	6	2523225	2523230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_013161	TTA	2	6	2523250	2523255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_013161	TCT	2	6	2523262	2523267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_013161	A	6	6	2523298	2523303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_013161	A	6	6	2523382	2523387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_013161	ATT	2	6	2523393	2523398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_013161	T	6	6	2523440	2523445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_013161	CAA	2	6	2524021	2524026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_013161	TAT	2	6	2524032	2524037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_013161	TTA	2	6	2524052	2524057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_013161	CT	3	6	2524158	2524163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8045	NC_013161	TCCCC	2	10	2524164	2524173	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
8046	NC_013161	C	7	7	2524170	2524176	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8047	NC_013161	TCC	2	6	2524177	2524182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8048	NC_013161	CT	3	6	2524183	2524188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8049	NC_013161	CCCCT	2	10	2524190	2524199	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
8050	NC_013161	T	7	7	2524257	2524263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_013161	TAT	2	6	2525030	2525035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_013161	ATC	2	6	2525881	2525886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_013161	TGA	2	6	2525982	2525987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_013161	GAAT	2	8	2526080	2526087	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_013161	TTAAG	2	10	2526090	2526099	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_013161	TAAT	2	8	2528037	2528044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_013161	AC	3	6	2529724	2529729	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8058	NC_013161	AACTTC	2	12	2529801	2529812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_013161	TCT	2	6	2529910	2529915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_013161	GAA	2	6	2530040	2530045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_013161	T	6	6	2530085	2530090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_013161	G	6	6	2530096	2530101	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_013161	GGA	2	6	2534585	2534590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_013161	G	7	7	2534656	2534662	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_013161	CCT	2	6	2534674	2534679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8066	NC_013161	T	6	6	2535217	2535222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_013161	TGT	2	6	2535263	2535268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_013161	TCCCCC	2	12	2535325	2535336	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
8069	NC_013161	C	7	7	2535332	2535338	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8070	NC_013161	CTG	2	6	2537133	2537138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_013161	TAT	2	6	2537184	2537189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_013161	TA	3	6	2537234	2537239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_013161	TTA	2	6	2537248	2537253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_013161	ATT	2	6	2537254	2537259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_013161	T	6	6	2537258	2537263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_013161	TA	3	6	2537284	2537289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_013161	ATA	2	6	2537316	2537321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_013161	TTAC	2	8	2537346	2537353	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8079	NC_013161	TTG	2	6	2537394	2537399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_013161	TAT	2	6	2537400	2537405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_013161	ATT	2	6	2537426	2537431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_013161	CCT	2	6	2537454	2537459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8083	NC_013161	A	6	6	2537460	2537465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_013161	ATTA	2	8	2537847	2537854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_013161	AATTA	2	10	2537873	2537882	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_013161	TCG	2	6	2537886	2537891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8087	NC_013161	AATT	2	8	2537898	2537905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_013161	TAT	2	6	2541939	2541944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_013161	AGA	2	6	2541945	2541950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_013161	T	6	6	2542050	2542055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_013161	AAT	2	6	2542060	2542065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_013161	TAAA	2	8	2542108	2542115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_013161	TAAGAT	2	12	2543246	2543257	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_013161	ATAATT	2	12	2543341	2543352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_013161	TAAA	2	8	2543372	2543379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_013161	ATT	2	6	2543428	2543433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_013161	ATG	2	6	2543470	2543475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_013161	A	6	6	2543489	2543494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_013161	TAC	2	6	2543529	2543534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_013161	AAT	2	6	2544012	2544017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_013161	ATAC	2	8	2549690	2549697	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8102	NC_013161	ATT	2	6	2549704	2549709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_013161	T	6	6	2549708	2549713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_013161	TCT	2	6	2549729	2549734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_013161	TTG	2	6	2550961	2550966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_013161	ATC	2	6	2551028	2551033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_013161	TCC	2	6	2551421	2551426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8108	NC_013161	TAA	2	6	2551434	2551439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_013161	TAT	2	6	2551492	2551497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_013161	T	6	6	2551507	2551512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_013161	CTT	2	6	2551535	2551540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_013161	ATT	2	6	2551720	2551725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_013161	CTTAAC	2	12	2552901	2552912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_013161	TAT	2	6	2552932	2552937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_013161	ACT	2	6	2552950	2552955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_013161	A	6	6	2552960	2552965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_013161	AATAA	2	10	2556506	2556515	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_013161	AGAGG	2	10	2556626	2556635	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_013161	TTA	2	6	2556710	2556715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_013161	AGA	2	6	2556724	2556729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_013161	TTA	2	6	2556731	2556736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_013161	AGA	2	6	2556822	2556827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_013161	TAT	2	6	2556846	2556851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_013161	TTG	2	6	2558396	2558401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_013161	TTTA	2	8	2559693	2559700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_013161	TTTG	2	8	2559706	2559713	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_013161	AAT	2	6	2559718	2559723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_013161	TAAT	2	8	2559746	2559753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_013161	AAT	2	6	2561528	2561533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_013161	TGAAAA	2	12	2561543	2561554	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_013161	TAA	2	6	2561609	2561614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8133	NC_013161	AAGT	2	8	2561660	2561667	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8268	NC_013161	CAA	2	6	2608187	2608192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8269	NC_013161	TAT	2	6	2608221	2608226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8270	NC_013161	CAA	2	6	2608231	2608236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8271	NC_013161	A	6	6	2608905	2608910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8281	NC_013161	GTA	2	6	2610536	2610541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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