MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 14557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_013161	TTG	2	6	2398963	2398968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_013161	T	8	8	2398991	2398998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_013161	TTG	3	9	2399003	2399011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7504	NC_013161	ACA	2	6	2399020	2399025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7505	NC_013161	TCT	2	6	2399199	2399204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7506	NC_013161	C	7	7	2399222	2399228	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7507	NC_013161	AATAA	2	10	2399246	2399255	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7508	NC_013161	A	6	6	2399286	2399291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_013161	A	6	6	2399296	2399301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7510	NC_013161	A	7	7	2399303	2399309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_013161	ATT	2	6	2402281	2402286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_013161	GAG	2	6	2402302	2402307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_013161	CAA	2	6	2402310	2402315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7514	NC_013161	TAAA	2	8	2402334	2402341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_013161	TCAA	2	8	2402345	2402352	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7516	NC_013161	GAA	2	6	2402376	2402381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7517	NC_013161	AAG	2	6	2402434	2402439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_013161	GAT	2	6	2402441	2402446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_013161	AGA	2	6	2402477	2402482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_013161	ATT	2	6	2402491	2402496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_013161	AAT	2	6	2402523	2402528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_013161	TGC	2	6	2402539	2402544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7523	NC_013161	A	6	6	2402578	2402583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7524	NC_013161	ATT	2	6	2402690	2402695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_013161	TAC	2	6	2402734	2402739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7527	NC_013161	TTC	2	6	2402757	2402762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7528	NC_013161	A	8	8	2402766	2402773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_013161	ATT	2	6	2406494	2406499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_013161	TAC	2	6	2406521	2406526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7531	NC_013161	CAA	2	6	2406549	2406554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7532	NC_013161	AAGG	2	8	2407805	2407812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_013161	CAAGT	2	10	2407843	2407852	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7534	NC_013161	TAA	2	6	2409040	2409045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_013161	ACA	2	6	2409067	2409072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7536	NC_013161	AGTAA	2	10	2409133	2409142	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_013161	GTTA	2	8	2411931	2411938	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7538	NC_013161	TGT	2	6	2411958	2411963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_013161	TTC	2	6	2411996	2412001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7540	NC_013161	AG	3	6	2412032	2412037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7541	NC_013161	TCC	2	6	2412064	2412069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7542	NC_013161	AGA	2	6	2412094	2412099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_013161	CAA	2	6	2412127	2412132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7544	NC_013161	AT	3	6	2412185	2412190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_013161	CTG	2	6	2412232	2412237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7546	NC_013161	GAG	2	6	2412304	2412309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_013161	ATG	2	6	2412313	2412318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_013161	TTC	2	6	2413418	2413423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_013161	AAT	2	6	2413433	2413438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_013161	TTA	2	6	2414341	2414346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_013161	ATT	2	6	2414971	2414976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_013161	TAGG	2	8	2415004	2415011	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7553	NC_013161	CAG	2	6	2415069	2415074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7554	NC_013161	T	8	8	2415088	2415095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_013161	T	7	7	2415856	2415862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_013161	CCG	2	6	2415883	2415888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7557	NC_013161	GGAT	2	8	2416561	2416568	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_013161	GTTA	2	8	2416646	2416653	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_013161	AGTTG	2	10	2417077	2417086	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_013161	ACA	2	6	2417137	2417142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7561	NC_013161	AAT	2	6	2417370	2417375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_013161	AGA	2	6	2417380	2417385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_013161	T	6	6	2419432	2419437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_013161	ATA	2	6	2420306	2420311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_013161	A	7	7	2420334	2420340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_013161	T	6	6	2420348	2420353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7567	NC_013161	AG	3	6	2420359	2420364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7568	NC_013161	A	6	6	2420379	2420384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7569	NC_013161	G	6	6	2422266	2422271	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7570	NC_013161	TGG	2	6	2422286	2422291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7571	NC_013161	CAA	2	6	2422318	2422323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7572	NC_013161	A	6	6	2422322	2422327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7573	NC_013161	T	6	6	2422357	2422362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_013161	AATA	2	8	2422462	2422469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7575	NC_013161	A	6	6	2422791	2422796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7576	NC_013161	A	6	6	2422815	2422820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_013161	TTG	2	6	2422862	2422867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7579	NC_013161	AAT	2	6	2422906	2422911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7580	NC_013161	ATT	2	6	2423201	2423206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7581	NC_013161	CTA	2	6	2425509	2425514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7582	NC_013161	TAT	2	6	2425520	2425525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7583	NC_013161	T	6	6	2425550	2425555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7584	NC_013161	ATT	2	6	2425562	2425567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7585	NC_013161	ATT	2	6	2425652	2425657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7586	NC_013161	ATA	2	6	2425746	2425751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7588	NC_013161	ACTTA	2	10	2425803	2425812	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7589	NC_013161	ACTG	2	8	2425826	2425833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7590	NC_013161	ATTTT	2	10	2425834	2425843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7591	NC_013161	ATT	2	6	2425854	2425859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7592	NC_013161	TATTC	2	10	2425906	2425915	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7593	NC_013161	ATT	2	6	2425945	2425950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7596	NC_013161	GTT	2	6	2426156	2426161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7597	NC_013161	ATT	2	6	2426228	2426233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7598	NC_013161	AATC	2	8	2427791	2427798	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7599	NC_013161	A	6	6	2427802	2427807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7600	NC_013161	GTA	2	6	2427851	2427856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7601	NC_013161	ATT	2	6	2428058	2428063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7602	NC_013161	TAT	2	6	2428101	2428106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_013161	A	6	6	2430283	2430288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7604	NC_013161	TAG	2	6	2430289	2430294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7608	NC_013161	TTAA	2	8	2431921	2431928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7609	NC_013161	TCA	2	6	2431972	2431977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7610	NC_013161	GAT	2	6	2433278	2433283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7611	NC_013161	AGA	2	6	2433358	2433363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7612	NC_013161	T	6	6	2434201	2434206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7613	NC_013161	TTA	2	6	2434238	2434243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7614	NC_013161	GAA	2	6	2434285	2434290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7615	NC_013161	AAG	2	6	2434306	2434311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7616	NC_013161	ATA	2	6	2434355	2434360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7617	NC_013161	A	6	6	2434367	2434372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7618	NC_013161	AATTG	2	10	2436186	2436195	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7619	NC_013161	ATA	2	6	2436197	2436202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7620	NC_013161	TAAG	2	8	2436747	2436754	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7621	NC_013161	AATT	2	8	2436762	2436769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7622	NC_013161	T	6	6	2436791	2436796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7623	NC_013161	TAA	2	6	2436798	2436803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7624	NC_013161	TAAA	2	8	2436825	2436832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7625	NC_013161	TTA	2	6	2436860	2436865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7626	NC_013161	CGG	2	6	2436892	2436897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7627	NC_013161	ATT	2	6	2436932	2436937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7628	NC_013161	TA	4	8	2437236	2437243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7629	NC_013161	TAA	2	6	2437295	2437300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7630	NC_013161	AAGAG	2	10	2437318	2437327	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7631	NC_013161	A	6	6	2438787	2438792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7633	NC_013161	AT	3	6	2438889	2438894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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