MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880201

Total Repeats: 237

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013160	ATT	2	6	596	601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013160	TAG	2	6	753	758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013160	ATT	2	6	808	813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013160	AGA	2	6	834	839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013160	ATT	2	6	1380	1385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013160	ACT	2	6	2934	2939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013160	GAA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013160	CTA	2	6	5211	5216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013160	TTC	2	6	5293	5298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013160	ACT	2	6	5306	5311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013160	TCA	2	6	5325	5330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013160	ACC	2	6	5351	5356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_013160	TAA	2	6	5368	5373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013160	TGA	2	6	5416	5421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013160	CAC	2	6	5451	5456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_013160	TAA	2	6	5515	5520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013160	AAT	3	9	5573	5581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013160	AGT	2	6	5664	5669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013160	AAT	2	6	5795	5800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013160	ATT	2	6	5951	5956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013160	ACT	2	6	6147	6152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013160	CCA	2	6	6169	6174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_013160	AGT	2	6	7684	7689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013160	GTA	2	6	7692	7697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013160	AAC	2	6	7759	7764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013160	TAG	2	6	7824	7829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013160	TTC	2	6	7912	7917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013160	TGA	2	6	7953	7958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013160	GTC	2	6	8024	8029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013160	CAC	2	6	8047	8052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_013160	GAA	2	6	8149	8154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013160	AGA	2	6	8262	8267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013160	TAA	2	6	8432	8437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013160	AGG	2	6	8488	8493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013160	AAG	2	6	8681	8686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013160	TAA	2	6	8838	8843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013160	TAT	3	9	9867	9875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013160	GTT	2	6	10360	10365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013160	TAA	2	6	10506	10511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013160	TAA	3	9	10521	10529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013160	TTA	2	6	10546	10551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013160	AAT	2	6	10736	10741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013160	TAT	2	6	10754	10759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013160	CTT	2	6	10901	10906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013160	ATA	2	6	10992	10997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013160	ATA	2	6	12636	12641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013160	ATA	2	6	12665	12670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013160	TAA	2	6	12676	12681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013160	TTA	2	6	13462	13467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013160	TCT	2	6	13584	13589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013160	TCA	2	6	13654	13659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013160	CTT	2	6	13842	13847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013160	TTA	2	6	17524	17529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013160	AAT	2	6	17730	17735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013160	TCA	2	6	17744	17749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013160	TAT	2	6	17755	17760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013160	TTA	2	6	17763	17768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013160	CTA	2	6	17821	17826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013160	TTA	2	6	17904	17909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013160	TAA	2	6	17969	17974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013160	CAG	2	6	18190	18195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013160	TAA	2	6	18239	18244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013160	TAG	3	9	18259	18267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013160	TTG	2	6	18295	18300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013160	TCA	2	6	18535	18540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013160	CAA	2	6	19681	19686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013160	CAA	2	6	19744	19749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013160	ACA	2	6	19755	19760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013160	GTT	2	6	24543	24548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013160	TCC	2	6	24564	24569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_013160	TTA	2	6	24621	24626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013160	TAA	2	6	24780	24785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013160	TCT	2	6	24792	24797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013160	GTC	2	6	24877	24882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013160	GGT	2	6	25005	25010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013160	TCA	2	6	25088	25093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013160	AGA	2	6	25128	25133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013160	CTA	2	6	25217	25222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013160	GTT	2	6	25282	25287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013160	TCT	2	6	25330	25335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013160	TTA	2	6	25369	25374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013160	AAG	2	6	25404	25409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013160	TAT	3	9	26469	26477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013160	CAA	2	6	27617	27622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013160	TTA	2	6	28363	28368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013160	TAT	2	6	28381	28386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013160	AGA	2	6	29593	29598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013160	AAG	2	6	29604	29609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013160	AGA	2	6	29656	29661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013160	AGT	2	6	29676	29681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013160	TTC	2	6	29742	29747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013160	ACT	2	6	29755	29760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013160	TCA	2	6	29774	29779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013160	ACC	2	6	29800	29805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_013160	TAA	2	6	29817	29822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013160	TGA	2	6	29865	29870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013160	CAC	2	6	29900	29905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_013160	TAA	2	6	29964	29969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013160	AAT	3	9	30022	30030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013160	AGT	2	6	30113	30118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013160	AAT	2	6	30244	30249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013160	ATT	2	6	30400	30405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013160	GAA	2	6	32965	32970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013160	CTT	2	6	32991	32996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013160	TTA	2	6	35407	35412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013160	ATC	2	6	35475	35480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013160	CAG	2	6	35511	35516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013160	TCT	2	6	37088	37093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013160	TTG	2	6	38259	38264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013160	GAA	2	6	38655	38660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013160	AGA	2	6	39016	39021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013160	AGA	2	6	39133	39138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013160	AGA	2	6	39222	39227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013160	AAC	2	6	39387	39392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013160	TGA	2	6	39403	39408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013160	TAA	2	6	40132	40137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013160	TTG	2	6	40364	40369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013160	CTT	2	6	40416	40421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013160	TAG	2	6	41379	41384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013160	TGT	2	6	41391	41396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013160	ATT	2	6	41466	41471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013160	TAA	2	6	43288	43293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013160	GGT	2	6	43331	43336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013160	TTA	2	6	43369	43374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013160	AGA	2	6	43410	43415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013160	TAA	2	6	43459	43464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013160	AAG	2	6	43751	43756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013160	AGA	2	6	43792	43797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013160	ACC	2	6	43819	43824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_013160	TGA	2	6	43842	43847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013160	AAG	2	6	43892	43897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013160	GAA	2	6	43927	43932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013160	TGG	2	6	44008	44013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013160	CAT	2	6	44050	44055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013160	CAA	2	6	44098	44103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013160	CTC	2	6	44297	44302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_013160	TAA	2	6	44417	44422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013160	ATT	2	6	44470	44475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013160	GAC	2	6	44489	44494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013160	TGG	2	6	44539	44544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013160	TAA	2	6	44676	44681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013160	TTA	2	6	44689	44694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_013160	TTA	2	6	44798	44803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.