MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chitinophaga pinensis DSM 2588 chromosome

Total Repeats: 12372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013132	TCG	2	6	25	30	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013132	AAC	2	6	101	106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013132	GCT	2	6	1623	1628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013132	CAG	2	6	1656	1661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013132	AAC	2	6	1667	1672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013132	TAA	2	6	1673	1678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013132	CAA	2	6	2402	2407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013132	TCC	2	6	2624	2629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013132	TCC	2	6	2671	2676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_013132	AGA	2	6	3734	3739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013132	CTT	2	6	3765	3770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013132	TCC	2	6	3842	3847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_013132	TTA	2	6	10866	10871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013132	ATA	2	6	10890	10895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013132	AGC	2	6	10900	10905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013132	TAA	2	6	10917	10922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013132	ATT	2	6	12801	12806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013132	AAT	2	6	12839	12844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013132	ATA	2	6	12855	12860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013132	CAA	2	6	16794	16799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013132	AAG	2	6	16824	16829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013132	ATC	2	6	16942	16947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013132	ACA	2	6	16952	16957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013132	ATC	2	6	20550	20555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013132	TAA	2	6	20563	20568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013132	AAT	2	6	22285	22290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013132	GTA	2	6	23408	23413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013132	GTA	2	6	25259	25264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013132	TCG	2	6	26295	26300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013132	ATT	2	6	26359	26364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013132	AAC	2	6	26425	26430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013132	TCT	2	6	29366	29371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013132	TTA	2	6	29403	29408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013132	TAA	2	6	29433	29438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013132	CTA	2	6	29459	29464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013132	CAT	2	6	29504	29509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013132	TTA	2	6	32054	32059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013132	ATT	2	6	32156	32161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013132	ATG	2	6	32446	32451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013132	ATA	2	6	33432	33437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013132	TAA	2	6	34443	34448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013132	AGA	2	6	34451	34456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013132	TTA	2	6	34553	34558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013132	GCT	2	6	39989	39994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013132	TGG	2	6	40052	40057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013132	CAG	2	6	40066	40071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013132	GGA	2	6	40191	40196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013132	TAA	2	6	40348	40353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013132	GGT	2	6	40372	40377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013132	AAT	2	6	40524	40529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013132	ATC	2	6	40625	40630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013132	CTT	2	6	40705	40710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013132	TGA	2	6	40748	40753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013132	CAA	2	6	40801	40806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013132	ATT	3	9	40940	40948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013132	CTA	2	6	40999	41004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013132	CAA	2	6	41059	41064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013132	TTA	2	6	41087	41092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013132	CTT	2	6	41155	41160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013132	TTA	2	6	41199	41204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013132	CAA	2	6	41672	41677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013132	CAA	2	6	41735	41740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013132	ATC	2	6	41803	41808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013132	TAT	2	6	41814	41819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013132	GGA	2	6	41839	41844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013132	GAA	2	6	41869	41874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013132	CAT	2	6	42140	42145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013132	ATT	3	9	42152	42160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013132	AAT	2	6	42167	42172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013132	TAA	2	6	42178	42183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013132	ATG	2	6	42333	42338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013132	ATT	2	6	42700	42705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013132	CAA	2	6	42723	42728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013132	ATT	2	6	42741	42746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013132	GCT	2	6	42749	42754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013132	TGA	2	6	42790	42795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013132	CCA	2	6	42849	42854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_013132	ATT	2	6	42879	42884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013132	AAT	2	6	42905	42910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013132	TTA	2	6	43010	43015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013132	ATA	2	6	44594	44599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013132	GCC	2	6	45449	45454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_013132	GCT	2	6	45466	45471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013132	GAT	2	6	45515	45520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013132	TCA	2	6	46076	46081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013132	CTT	2	6	46111	46116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013132	ATC	2	6	46158	46163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013132	ATT	2	6	46232	46237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013132	TTC	2	6	46303	46308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013132	TGC	2	6	46366	46371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013132	CTT	2	6	46389	46394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013132	GCT	2	6	46418	46423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013132	TCT	2	6	46424	46429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013132	ATA	2	6	54135	54140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013132	AGT	2	6	54320	54325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013132	TCA	2	6	54349	54354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013132	ATT	2	6	54377	54382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013132	ACG	2	6	58275	58280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013132	TCC	2	6	58357	58362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_013132	ACC	2	6	58369	58374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_013132	ACC	2	6	59923	59928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_013132	ACC	2	6	61571	61576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_013132	TTA	2	6	61833	61838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013132	GAT	2	6	61915	61920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013132	AAT	2	6	62239	62244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013132	TGC	2	6	62272	62277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013132	GCT	2	6	64511	64516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013132	TCA	2	6	64588	64593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013132	TGT	2	6	64605	64610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013132	CTG	2	6	64712	64717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013132	TAT	2	6	71646	71651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013132	TAA	2	6	71653	71658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013132	AAC	2	6	71707	71712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013132	TAC	2	6	72356	72361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013132	CTT	2	6	77370	77375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013132	TTA	2	6	77388	77393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013132	TGT	2	6	78007	78012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013132	CAG	2	6	78075	78080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013132	TCA	2	6	78116	78121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013132	TAC	2	6	79296	79301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013132	TAA	2	6	81293	81298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013132	TGC	2	6	83887	83892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013132	CAA	2	6	86218	86223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013132	TAA	2	6	87166	87171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013132	TGA	2	6	87178	87183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013132	TAC	2	6	87235	87240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013132	ACA	2	6	87255	87260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013132	GAA	2	6	87630	87635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013132	GAT	2	6	87971	87976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013132	ATA	2	6	88013	88018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013132	CTG	2	6	88021	88026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013132	CAG	2	6	88035	88040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013132	AGA	2	6	94658	94663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013132	ATT	2	6	95772	95777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013132	TAT	2	6	95778	95783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013132	CAA	2	6	95812	95817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013132	GAA	2	6	102028	102033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013132	AAT	2	6	102045	102050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013132	GCA	2	6	102132	102137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013132	GAA	2	6	102217	102222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013132	TGT	2	6	103191	103196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_013132	CAT	2	6	103229	103234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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145	NC_013132	TGC	2	6	103350	103355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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148	NC_013132	ACA	2	6	103448	103453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_013132	TTA	2	6	104620	104625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_013132	ATT	2	6	109775	109780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_013132	TAT	2	6	172436	172441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_013132	CCT	3	9	172442	172450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
275	NC_013132	ATG	2	6	173452	173457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
276	NC_013132	CCG	2	6	176248	176253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
277	NC_013132	CAG	2	6	177143	177148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_013132	GAG	2	6	177151	177156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
279	NC_013132	GCT	2	6	177174	177179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_013132	AAT	2	6	177217	177222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_013132	ATA	2	6	177276	177281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_013132	AGG	2	6	178625	178630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
283	NC_013132	CAA	2	6	178642	178647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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290	NC_013132	CTT	2	6	183548	183553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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295	NC_013132	TAT	2	6	185773	185778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_013132	TGC	2	6	185905	185910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_013132	AAT	2	6	185912	185917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_013132	GCC	2	6	186198	186203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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305	NC_013132	TAA	2	6	186246	186251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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406	NC_013132	CAG	2	6	253182	253187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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410	NC_013132	TAC	2	6	257405	257410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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441	NC_013132	CTT	2	6	273827	273832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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445	NC_013132	TTC	2	6	274251	274256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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449	NC_013132	TCT	2	6	274399	274404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_013132	ATT	2	6	274465	274470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_013132	TAG	2	6	274900	274905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_013132	AAT	2	6	276736	276741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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463	NC_013132	TTC	2	6	286254	286259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
464	NC_013132	GAT	2	6	286292	286297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_013132	ACG	2	6	289846	289851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
467	NC_013132	GCA	2	6	289881	289886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
468	NC_013132	ATT	2	6	289909	289914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_013132	TAA	2	6	289930	289935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_013132	AAT	2	6	289946	289951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_013132	TTA	2	6	289988	289993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_013132	ATA	2	6	290147	290152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_013132	GAC	2	6	291025	291030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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479	NC_013132	ATT	3	9	295615	295623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_013132	CAG	2	6	297444	297449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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482	NC_013132	TGA	2	6	298711	298716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_013132	CCA	2	6	298745	298750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
485	NC_013132	TCA	2	6	298761	298766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
486	NC_013132	GAT	2	6	298878	298883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
487	NC_013132	GAA	2	6	298959	298964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
488	NC_013132	CTT	2	6	298986	298991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
489	NC_013132	TTG	2	6	299146	299151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
490	NC_013132	ATA	2	6	299209	299214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_013132	TGC	2	6	300082	300087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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493	NC_013132	TAA	2	6	300172	300177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
494	NC_013132	GTC	2	6	300211	300216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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496	NC_013132	AAT	2	6	300850	300855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_013132	TAA	2	6	300865	300870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_013132	ATC	2	6	302676	302681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
499	NC_013132	TGC	2	6	304585	304590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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