MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chitinophaga pinensis DSM 2588 chromosome

Total Repeats: 22683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013132	ATTT	2	8	585796	585803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_013132	T	7	7	585834	585840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_013132	TAC	2	6	587004	587009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_013132	TAA	2	6	587071	587076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_013132	CGG	2	6	587157	587162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_013132	GCA	3	9	588521	588529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_013132	A	8	8	589555	589562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_013132	ATA	2	6	589569	589574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_013132	CTA	2	6	589582	589587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_013132	TGA	2	6	589616	589621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_013132	GGTTT	2	10	590163	590172	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_013132	ACG	2	6	590331	590336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_013132	TTG	2	6	590479	590484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_013132	CAA	2	6	591220	591225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_013132	AG	3	6	591859	591864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_013132	CT	3	6	591883	591888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_013132	TAA	2	6	591899	591904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_013132	CCA	2	6	592083	592088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_013132	T	9	9	592140	592148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_013132	T	6	6	593476	593481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_013132	ACCA	2	8	593500	593507	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_013132	A	6	6	593542	593547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_013132	A	7	7	593551	593557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_013132	CTT	2	6	593560	593565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_013132	TTG	2	6	593638	593643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_013132	ACA	2	6	593654	593659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_013132	AT	3	6	593697	593702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_013132	TA	3	6	593714	593719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_013132	TTTA	2	8	596610	596617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_013132	TGC	2	6	596685	596690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_013132	AGA	2	6	596752	596757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_013132	GATA	2	8	596781	596788	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_013132	CTTT	2	8	596798	596805	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1534	NC_013132	ATTG	2	8	596806	596813	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_013132	AT	3	6	596948	596953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_013132	ATA	2	6	596992	596997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_013132	CAA	2	6	597047	597052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_013132	TCCA	2	8	597053	597060	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_013132	ACT	2	6	597125	597130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_013132	A	6	6	599061	599066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_013132	TTG	2	6	599870	599875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_013132	CTA	2	6	599914	599919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_013132	TGA	2	6	600825	600830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_013132	CATA	2	8	600849	600856	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1545	NC_013132	ATT	2	6	600924	600929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_013132	TACAT	2	10	602602	602611	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1547	NC_013132	TTTA	2	8	603035	603042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_013132	ATT	2	6	603043	603048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_013132	ACA	2	6	603062	603067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_013132	TAT	2	6	605265	605270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_013132	CAG	2	6	605419	605424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_013132	AAG	2	6	605438	605443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_013132	AGG	2	6	605453	605458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_013132	AAG	2	6	605621	605626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_013132	A	6	6	605652	605657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_013132	T	6	6	605677	605682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_013132	AAG	2	6	605716	605721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_013132	TAA	2	6	605780	605785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_013132	GTA	2	6	605838	605843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_013132	CAT	2	6	605906	605911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_013132	ATATT	2	10	605927	605936	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_013132	TA	4	8	605958	605965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_013132	A	7	7	606365	606371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_013132	AAT	2	6	606393	606398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_013132	AT	3	6	606430	606435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_013132	ACC	2	6	606457	606462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_013132	ACA	2	6	606517	606522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_013132	TTA	2	6	606535	606540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_013132	A	7	7	606547	606553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_013132	GTC	2	6	606673	606678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_013132	AT	3	6	608015	608020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_013132	T	6	6	609161	609166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_013132	A	6	6	610214	610219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_013132	CAG	2	6	610231	610236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_013132	TAA	2	6	610241	610246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_013132	AT	4	8	611150	611157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_013132	AT	3	6	611169	611174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_013132	GAT	2	6	613401	613406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_013132	T	6	6	613406	613411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_013132	ACA	2	6	613482	613487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_013132	TA	3	6	613514	613519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_013132	TTA	2	6	613565	613570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_013132	ATTA	2	8	613584	613591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_013132	TTA	2	6	613613	613618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_013132	AT	3	6	614034	614039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_013132	A	6	6	614068	614073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_013132	CCT	2	6	614096	614101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1588	NC_013132	TAA	2	6	615771	615776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_013132	CT	3	6	615779	615784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_013132	CAG	2	6	615852	615857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_013132	AT	3	6	615873	615878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_013132	T	6	6	616299	616304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_013132	TAC	2	6	616329	616334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1595	NC_013132	TTC	2	6	618540	618545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_013132	TA	3	6	620442	620447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_013132	AATT	2	8	620508	620515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_013132	TCT	2	6	620521	620526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_013132	AAT	2	6	621610	621615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_013132	TTA	2	6	621637	621642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_013132	TTGA	2	8	622917	622924	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_013132	TAT	2	6	623587	623592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_013132	TG	3	6	623610	623615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_013132	CTC	2	6	623616	623621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_013132	TCC	2	6	623634	623639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NC_013132	A	6	6	624259	624264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_013132	A	6	6	624275	624280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_013132	TC	3	6	625887	625892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_013132	TTAT	2	8	629016	629023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_013132	CTTC	2	8	629122	629129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_013132	ACG	2	6	630408	630413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_013132	TTTAG	2	10	630426	630435	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_013132	CAA	2	6	630497	630502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_013132	A	6	6	630507	630512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_013132	TA	4	8	630543	630550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_013132	A	6	6	630591	630596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_013132	TA	5	10	630650	630659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_013132	GT	3	6	630663	630668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_013132	TAT	2	6	630681	630686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_013132	TGT	2	6	630699	630704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_013132	ATAA	2	8	630777	630784	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_013132	TCAGC	2	10	631409	631418	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1623	NC_013132	GGC	2	6	631449	631454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_013132	GCG	2	6	632151	632156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_013132	TTC	2	6	632180	632185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_013132	TAC	2	6	632234	632239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_013132	TTG	2	6	633370	633375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_013132	GATA	2	8	633419	633426	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_013132	ATA	2	6	633431	633436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_013132	AAT	2	6	633490	633495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_013132	AAG	2	6	635291	635296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_013132	A	6	6	635454	635459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_013132	AAG	2	6	636186	636191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_013132	A	6	6	636201	636206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_013132	ATT	2	6	636245	636250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_013132	T	9	9	636274	636282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_013132	A	7	7	638893	638899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1639	NC_013132	A	6	6	638990	638995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1913	NC_013132	CTG	2	6	718302	718307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1914	NC_013132	AGG	2	6	718363	718368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1915	NC_013132	AGAT	2	8	718396	718403	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1916	NC_013132	T	6	6	718403	718408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1917	NC_013132	ATAGA	2	10	720027	720036	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1918	NC_013132	CTG	2	6	720061	720066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1919	NC_013132	TA	3	6	721653	721658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1920	NC_013132	ATA	2	6	724621	724626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1921	NC_013132	TCAGC	2	10	724685	724694	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1922	NC_013132	GGAATA	2	12	725438	725449	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1923	NC_013132	CGC	2	6	725484	725489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1924	NC_013132	ATA	2	6	725544	725549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1925	NC_013132	TAT	2	6	725550	725555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1926	NC_013132	AGC	2	6	727154	727159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1929	NC_013132	TTTA	2	8	730981	730988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1930	NC_013132	AGC	2	6	731017	731022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1931	NC_013132	TGA	2	6	731023	731028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1932	NC_013132	AGT	2	6	731079	731084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1934	NC_013132	AAAC	2	8	731112	731119	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1935	NC_013132	AAGAA	2	10	731125	731134	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1936	NC_013132	TTCA	2	8	731876	731883	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1937	NC_013132	T	6	6	732449	732454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1940	NC_013132	CGTT	2	8	733717	733724	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1941	NC_013132	CTA	2	6	735888	735893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1943	NC_013132	CAA	2	6	739108	739113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1944	NC_013132	AATAT	2	10	739180	739189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1945	NC_013132	GCA	2	6	739193	739198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1947	NC_013132	ATC	2	6	740105	740110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1949	NC_013132	ATG	2	6	740135	740140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1950	NC_013132	CAC	2	6	740973	740978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1951	NC_013132	ATT	2	6	740989	740994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1952	NC_013132	GAG	2	6	741049	741054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1953	NC_013132	A	9	9	741063	741071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1954	NC_013132	AAC	2	6	741096	741101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1955	NC_013132	TCC	2	6	741130	741135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1956	NC_013132	ACA	2	6	741221	741226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1958	NC_013132	TTG	2	6	743580	743585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1959	NC_013132	CATA	2	8	743590	743597	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1963	NC_013132	AATT	2	8	750747	750754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1964	NC_013132	A	6	6	750806	750811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1965	NC_013132	T	7	7	750826	750832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1966	NC_013132	A	6	6	750835	750840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1967	NC_013132	GA	3	6	750845	750850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1968	NC_013132	A	6	6	750873	750878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1969	NC_013132	CTT	2	6	750916	750921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1972	NC_013132	TA	3	6	751030	751035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1973	NC_013132	TGGT	2	8	751037	751044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1975	NC_013132	AGG	2	6	751105	751110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1977	NC_013132	TA	3	6	751487	751492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1978	NC_013132	T	7	7	751527	751533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1985	NC_013132	ACA	2	6	752144	752149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1988	NC_013132	CTT	2	6	752848	752853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1989	NC_013132	ACACC	2	10	752857	752866	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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1994	NC_013132	T	7	7	754228	754234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1998	NC_013132	TAA	2	6	754300	754305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_013132	CTA	2	6	754341	754346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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