MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chitinophaga pinensis DSM 2588 chromosome

Total Repeats: 22683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013132	CATA	2	8	364745	364752	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_013132	AT	3	6	364782	364787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_013132	TAA	2	6	366825	366830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_013132	TGT	2	6	366841	366846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_013132	TTA	2	6	368426	368431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_013132	ATA	2	6	370403	370408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_013132	TG	3	6	370445	370450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_013132	TAA	2	6	370454	370459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_013132	GT	3	6	371160	371165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_013132	ATGC	2	8	371189	371196	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_013132	GGC	2	6	371201	371206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_013132	TGT	2	6	371227	371232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_013132	CAG	2	6	371287	371292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_013132	A	6	6	371305	371310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_013132	ATT	2	6	371357	371362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_013132	TTA	2	6	371382	371387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_013132	TTAC	2	8	371391	371398	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_013132	TAG	2	6	371436	371441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_013132	GTT	2	6	373890	373895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_013132	GCC	2	6	373910	373915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_013132	GGC	2	6	373927	373932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_013132	TAT	2	6	381480	381485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_013132	TTA	2	6	381512	381517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_013132	A	6	6	381517	381522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_013132	CAA	2	6	386054	386059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_013132	TA	3	6	386075	386080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_013132	CAG	2	6	386090	386095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_013132	TATTGA	2	12	386118	386129	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_013132	AAT	2	6	386155	386160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_013132	T	6	6	386178	386183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_013132	TTC	2	6	386200	386205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_013132	ATTA	2	8	386214	386221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_013132	AGA	2	6	386232	386237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_013132	AAT	2	6	386238	386243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_013132	ATC	2	6	386354	386359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_013132	TAA	2	6	386362	386367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_013132	T	6	6	386368	386373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_013132	CCT	2	6	386496	386501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_013132	AAT	2	6	386505	386510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_013132	CAT	2	6	386546	386551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_013132	TTA	2	6	387067	387072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_013132	AGC	2	6	392105	392110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_013132	A	6	6	392171	392176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_013132	T	6	6	393119	393124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_013132	A	6	6	393136	393141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_013132	TAC	2	6	393271	393276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_013132	A	6	6	393287	393292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_013132	GAA	2	6	393295	393300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_013132	A	6	6	393366	393371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_013132	TGCC	2	8	393382	393389	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_013132	CGG	2	6	393393	393398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_013132	A	6	6	396052	396057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_013132	T	7	7	396064	396070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_013132	TGA	2	6	396084	396089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_013132	GTAA	2	8	396178	396185	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_013132	TGA	2	6	397722	397727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_013132	AGAA	2	8	397756	397763	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_013132	TA	3	6	400660	400665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_013132	AATC	2	8	400673	400680	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_013132	T	8	8	405248	405255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_013132	TGG	2	6	407181	407186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_013132	AAT	3	9	407193	407201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_013132	AT	3	6	407211	407216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_013132	CTA	2	6	407236	407241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_013132	T	7	7	407269	407275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_013132	AGT	2	6	407285	407290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_013132	G	6	6	407297	407302	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_013132	AACA	2	8	407561	407568	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_013132	CAG	2	6	407600	407605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_013132	GA	3	6	407615	407620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_013132	AT	3	6	407629	407634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_013132	GTTA	2	8	407776	407783	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_013132	TTC	2	6	407825	407830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_013132	AAT	2	6	407845	407850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_013132	CCT	2	6	407859	407864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_013132	A	7	7	407945	407951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_013132	GTA	2	6	408194	408199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_013132	TAA	2	6	408255	408260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_013132	TCA	2	6	408263	408268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_013132	TAAC	2	8	409268	409275	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_013132	GTT	2	6	409312	409317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_013132	T	6	6	409320	409325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_013132	ATA	2	6	409410	409415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_013132	A	6	6	409450	409455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_013132	GCA	3	9	409456	409464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_013132	CAAA	2	8	409485	409492	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_013132	TGAA	2	8	409517	409524	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_013132	TCA	2	6	411809	411814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_013132	ATT	2	6	411836	411841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_013132	CCA	2	6	411888	411893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_013132	CAG	2	6	411921	411926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_013132	T	10	10	412827	412836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_013132	ACA	2	6	417927	417932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_013132	AAC	2	6	417936	417941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_013132	GATTT	2	10	419252	419261	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_013132	AGT	2	6	419263	419268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_013132	AAAG	2	8	419337	419344	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_013132	ACA	2	6	419372	419377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_013132	GAA	2	6	419394	419399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_013132	TGTTCA	2	12	419410	419421	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1101	NC_013132	GTTA	2	8	419427	419434	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_013132	TAAT	2	8	419452	419459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_013132	GTG	2	6	419475	419480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_013132	ATTTT	2	10	419502	419511	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_013132	ATA	2	6	419516	419521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_013132	GTT	2	6	419668	419673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_013132	ATG	2	6	419784	419789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_013132	TAC	2	6	419805	419810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_013132	TGT	3	9	419825	419833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_013132	AAT	2	6	419877	419882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_013132	T	7	7	427101	427107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_013132	AATA	2	8	427130	427137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_013132	TAC	2	6	427257	427262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_013132	A	7	7	428439	428445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_013132	AAAAT	2	10	429050	429059	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_013132	A	7	7	429122	429128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_013132	AAT	2	6	429203	429208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_013132	TGA	2	6	429212	429217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_013132	A	7	7	429240	429246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_013132	CTGTA	2	10	429291	429300	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1121	NC_013132	TCA	2	6	429352	429357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_013132	TGC	2	6	429381	429386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_013132	TTA	2	6	429416	429421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_013132	T	6	6	429449	429454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_013132	TGC	2	6	429471	429476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_013132	CCT	2	6	430440	430445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_013132	T	6	6	430468	430473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_013132	TGAA	2	8	430503	430510	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_013132	ATT	2	6	430542	430547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_013132	ATCA	2	8	430576	430583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_013132	ATTGA	2	10	433543	433552	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_013132	TAT	2	6	433632	433637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_013132	CCT	2	6	433674	433679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_013132	AC	4	8	433689	433696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_013132	TA	4	8	433698	433705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_013132	TA	3	6	433761	433766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_013132	TTAA	2	8	433787	433794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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